1-cyano-2-methylpropan-2-yl 2-(bis(diisopropylamino)phosphaneyl)acetate | 411234-03-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-cyano-2-methylpropan-2-yl 2-(bis(diisopropylamino)phosphaneyl)acetate
• 英文别名: (1-Cyano-2-methylpropan-2-yl) 2-bis[di(propan-2-yl)amino]phosphanylacetate
• CAS: 411234-03-2
• 化学式: C₁₉H₃₈N₃O₂P
• 分子量: 371.503
• InChiKey: LPOAXGXRIMJOOU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  453.3±55.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  56.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-cyano-2-methylpropan-2-yl 2-(bis(diisopropylamino)phosphaneyl)acetate 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 (1-cyano-2-methylpropan-2-yl) 2-[[(2R,3S,5R)-3-acetyloxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphanyl]acetate
  参考文献：
  名称：

  膦酰乙酸酯和硫代膦酰乙酸酯寡脱氧核苷酸的固相化学合成

  摘要：

  Phosphonoacetate 和 thiophosphonoacetate 寡脱氧核苷酸是通过固相合成策略制备的。在 Reformatsky 反应条件下，合成了新型酯化乙酸膦酰二亚胺，并与适当保护的 5'-O-(4, 4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧核苷缩合，生成 3'-O-膦亚酰胺反应单体。这些合成子在用四唑激活时与自动 DNA 合成仪一起使用，以在受控孔玻璃上制备膦酰乙酸修饰的核苷酸间连接。在每一步用 (1S)-(+)-(10-樟脑磺酰基)恶氮丙啶或 3H-1,2-苯二硫醇-3-one-1 定量氧化膦基乙酸酯偶联产物，1-二氧化物产生混合序列膦酰乙酸酯和硫代膦酰乙酸酯寡脱氧核苷酸，平均每循环偶联效率大于 97%。完全脱保护、修饰的寡脱氧核苷酸通过反相 HPLC 纯化，并通过离子交换 HPLC、(31) P NMR 和 MALDI/TOF 质谱进行表征。两种类似物都对蛇毒磷酸二酯酶的水解稳定并刺激

  DOI：

  10.1021/ja027983f
• 作为产物：
  描述：

  3-羟基-3-甲基丁腈 在 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 甲苯 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 1-cyano-2-methylpropan-2-yl 2-(bis(diisopropylamino)phosphaneyl)acetate
  参考文献：
  名称：

  膦酰乙酸酯和硫代膦酰乙酸酯寡脱氧核苷酸的固相化学合成

  摘要：

  Phosphonoacetate 和 thiophosphonoacetate 寡脱氧核苷酸是通过固相合成策略制备的。在 Reformatsky 反应条件下，合成了新型酯化乙酸膦酰二亚胺，并与适当保护的 5'-O-(4, 4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧核苷缩合，生成 3'-O-膦亚酰胺反应单体。这些合成子在用四唑激活时与自动 DNA 合成仪一起使用，以在受控孔玻璃上制备膦酰乙酸修饰的核苷酸间连接。在每一步用 (1S)-(+)-(10-樟脑磺酰基)恶氮丙啶或 3H-1,2-苯二硫醇-3-one-1 定量氧化膦基乙酸酯偶联产物，1-二氧化物产生混合序列膦酰乙酸酯和硫代膦酰乙酸酯寡脱氧核苷酸，平均每循环偶联效率大于 97%。完全脱保护、修饰的寡脱氧核苷酸通过反相 HPLC 纯化，并通过离子交换 HPLC、(31) P NMR 和 MALDI/TOF 质谱进行表征。两种类似物都对蛇毒磷酸二酯酶的水解稳定并刺激

  DOI：

  10.1021/ja027983f

文献信息

• [EN] NOVEL PHOSPHORAMIDITES<br/>[FR] NOUVELLES PHOSPHORAMIDITES
  申请人：ROCHE INNOVATION CT COPENHAGEN AS

  公开号：WO2020169696A1

  公开（公告）日：2020-08-27

  The invention relates to a compound of formula (II) wherein X, Y, R5, Rx, Ry and Nu are as defined in the description and in the claims. The compound of formula (II) can be used in the manufacture of medicaments.

  该发明涉及具有公式（II）的化合物，其中X、Y、R5、Rx、Ry和Nu如描述和索赔中所定义。公式（II）的化合物可用于制造药物。
• [EN] PHOSPHONOACETATE GAPMER OLIGONUCLEOTIDES<br/>[FR] OLIGONUCLÉOTIDES GAPMER DE PHOSPHONOACÉTATE
  申请人：ROCHE INNOVATION CT COPENHAGEN AS

  公开号：WO2020169695A1

  公开（公告）日：2020-08-27

  The invention relates to a single stranded antisense gapmer oligonucleotide comprising at least one dinucleoside of formula (I), wherein (A1), (A2) and A are as defined in the description and in the claims. The oligonucleotide according to the invention can be used as a medicament.

  该发明涉及一种包含至少一个式(I)的二核苷酸二聚体的单链反义缺口寡核苷酸，其中（A1）、（A2）和A如描述和权利要求中所定义。根据该发明的寡核苷酸可用作药物。
• Synthesis and biological activity of phosphonoacetate- and thiophosphonoacetate-modified 2′-O-methyl oligoribonucleotides
  作者：Richard N. Threlfall、Adrian G. Torres、Angelika Krivenko、Michael J. Gait、Marvin H. Caruthers

  DOI：10.1039/c1ob06614e

  日期：——

  Chimeric 2′-O-methyl oligoribonucleotides (2′-OMe ORNs) containing internucleotide linkages which were modified with phosphonoacetate (PACE) or thiophosphonoacetate (thioPACE) were prepared by solid-phase synthesis. The modified 2′-OMe ORNs contained a central phosphate or phosphorothioate sequence with up to 4 PACE or thioPACE modifications, respectively, at either end of the ORN in a “gapmer” motif. Both PACE and thioPACE 2′-OMe ORNs formed stable duplexes with complementary RNA. The majority of these duplexes had higher thermal melting temperatures than an unmodified RNA:RNA duplex. The modified 2′-OMe ORNs were effective passenger strands with complementary, unmodified siRNAs, for inducing siRNA activity in a dual luciferase assay in the presence of a lipid transfecting agent. As single strands, thioPACE 2′-OMe ORNs were efficiently taken up by HeLa cells in the absence of a lipid transfecting agent. Furthermore, thioPACE modifications greatly improved the potency of a 2′-OMe phosphorothioate ORN as an inhibitor of microRNA-122 in Huh7 cells, without lipid transfection.

  通过固相合成法制备了含有核苷酸内连接的嵌合 2â²-O-甲基寡核苷酸（2â²-OMe ORNs），这些嵌合寡核苷酸经磷酸乙酸酯（PACE）或硫代磷酸乙酸酯（thioPACE）修饰。经修饰的2â²-OMe ORN包含一个中心磷酸或硫代磷酸序列，在ORN的两端分别有多达4个PACE或thioPACE修饰，形成一个 "间隙 "图案。PACE 和 thioPACE 2â²-OMe ORN 都能与互补 RNA 形成稳定的双链体。与未修饰的 RNA:RNA 双链相比，这些双链中的大多数具有更高的热熔温度。修饰的 2-OMe ORN 与互补的、未修饰的 siRNA 是有效的客链，可在有脂质转染剂存在的双荧光素酶试验中诱导 siRNA 活性。作为单链，thioPACE 2â²-OMe ORNs 能在没有脂质转染剂的情况下被 HeLa 细胞有效吸收。此外，硫代PACE修饰大大提高了2â²-OMe硫代磷酸酯ORN在Huh7细胞中作为microRNA-122抑制剂的效力，而无需脂质转染。
• Solid-Phase Chemical Synthesis of Phosphonoacetate and Thiophosphonoacetate Oligodeoxynucleotides
  作者：Douglas J. Dellinger、David M. Sheehan、Nanna K. Christensen、James G. Lindberg、Marvin H. Caruthers

  DOI：10.1021/ja027983f

  日期：2003.1.1

  Phosphonoacetate and thiophosphonoacetate oligodeoxynucleotides were prepared via a solid-phase synthesis strategy. Under Reformatsky reaction conditions, novel esterified acetic acid phosphinodiamidites were synthesized and condensed with appropriately protected 5'-O-(4, 4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxynucleosides to yield 3'-O-phosphinoamidite reactive monomers. These synthons when activated with tetrazole

  Phosphonoacetate 和 thiophosphonoacetate 寡脱氧核苷酸是通过固相合成策略制备的。在 Reformatsky 反应条件下，合成了新型酯化乙酸膦酰二亚胺，并与适当保护的 5'-O-(4, 4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧核苷缩合，生成 3'-O-膦亚酰胺反应单体。这些合成子在用四唑激活时与自动 DNA 合成仪一起使用，以在受控孔玻璃上制备膦酰乙酸修饰的核苷酸间连接。在每一步用 (1S)-(+)-(10-樟脑磺酰基)恶氮丙啶或 3H-1,2-苯二硫醇-3-one-1 定量氧化膦基乙酸酯偶联产物，1-二氧化物产生混合序列膦酰乙酸酯和硫代膦酰乙酸酯寡脱氧核苷酸，平均每循环偶联效率大于 97%。完全脱保护、修饰的寡脱氧核苷酸通过反相 HPLC 纯化，并通过离子交换 HPLC、(31) P NMR 和 MALDI/TOF 质谱进行表征。两种类似物都对蛇毒磷酸二酯酶的水解稳定并刺激