Identification of halosalicylamide derivatives as a novel class of allosteric inhibitors of HCV NS5B polymerase
作者:Yaya Liu、Pamela L. Donner、John K. Pratt、Wen W. Jiang、Teresa Ng、Vijaya Gracias、Steve Baumeister、Paul E. Wiedeman、Linda Traphagen、Usha Warrior、Clarence Maring、Warren M. Kati、Stevan W. Djuric、Akhteruzzaman Molla
DOI:10.1016/j.bmcl.2008.04.068
日期:2008.6
elongation pocket that is occupied by diketoacids, but a mutually exclusive binding mode with respect to the allosteric thumb pocket that is occupied by the benzimidazole class of inhibitors. Therefore, halosalicylamides represent a novel class of allosteric inhibitors of HCV NS5B polymerase.
卤水杨酰胺衍生物通过高通量筛选被鉴定为 HCV NS5B 聚合酶的有效抑制剂。随后的结构和活性关系揭示了水杨酰胺部分对最佳活性的绝对要求。水杨酰胺部分的羟基或酰胺基团的甲基化消除了活性,而两个苯环上的取代是可接受的。卤代水杨酰胺衍生物在延伸核苷酸方面显示出非竞争性,并显示出针对基因型 1-3 HCV NS5B 聚合酶的广泛基因型活性。抑制剂竞争研究表明与噻二嗪类化合物占据的起始口袋的加性结合模式和由二酮酸占据的延伸口袋的加性结合模式,但是对于被苯并咪唑类抑制剂占据的变构拇指口袋而言,这是一种相互排斥的结合模式。因此,卤代水杨酰胺代表了一类新型的 HCV NS5B 聚合酶变构抑制剂。