N-(2-(4-hydroxy-N-methylbutanamido)ethyl)-N-methyl-7-oxooctanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N-(2-(4-hydroxy-N-methylbutanamido)ethyl)-N-methyl-7-oxooctanamide
• 英文别名: N-[2-[4-hydroxybutanoyl(methyl)amino]ethyl]-N-methyl-7-oxooctanamide
• 化学式: C₁₆H₃₀N₂O₄
• 分子量: 314.425
• InChiKey: FQXZVTKHPPNPFG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  77.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-(4-hydroxy-N-methylbutanamido)ethyl)-N-methyl-7-oxooctanamide 、 4-甲氧基三苯基氯甲烷 在 吡啶 作用下， 反应 4.0h， 以85%的产率得到N-(2-(4-((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)-N-methylbutanamido)ethyl)-N-methyl-7-oxooctanamide
  参考文献：
  名称：

  固相纯化合成的DNA序列

  摘要：

  尽管目前可用于合成生物学应用的用于DNA序列固相合成的高通量方法，并且已将大规模生产基于核酸的药物的技术用于各种治疗适应症，但为开发高通量所做的工作很少合成核酸序列的纯化方法。本文描述了用于纯化硫代磷酸酯和天然DNA序列的有效方法。该过程包括用氨氧基烷基官能化功能化商业化的氨基丙基化硅胶，以通过肟化反应捕获带有5'-甲氧基醚连接基的带有“酮”功能的DNA序列。用5'-甲硅烷氧基醚接头官能化的脱氧核糖核苷亚磷酰胺的产率为75-83％，最后掺入DNA序列的固相组装中。从合成载体中释放的脱碱基保护的碱基和磷酸脱保护的DNA序列的捕获已证明接近定量进行。从捕获载体上洗短于全长的DNA序列后，经四氢萘处理，从该载体上释放出纯化的DNA序列。在干DMSO中的正丁基氟化铵。释放的DNA序列的纯度超过98％。在不牺牲DNA序列纯度的情况下，证明了纯化过程的可扩展性和高通量特征。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b01020
• 作为产物：
  描述：

  7-羰基辛酸 、 4-hydroxy-N-methyl-N-(2-(methylamino)ethyl)butanamide 在 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 26.0h， 以78%的产率得到N-(2-(4-hydroxy-N-methylbutanamido)ethyl)-N-methyl-7-oxooctanamide
  参考文献：
  名称：

  固相纯化合成的DNA序列

  摘要：

  尽管目前可用于合成生物学应用的用于DNA序列固相合成的高通量方法，并且已将大规模生产基于核酸的药物的技术用于各种治疗适应症，但为开发高通量所做的工作很少合成核酸序列的纯化方法。本文描述了用于纯化硫代磷酸酯和天然DNA序列的有效方法。该过程包括用氨氧基烷基官能化功能化商业化的氨基丙基化硅胶，以通过肟化反应捕获带有5'-甲氧基醚连接基的带有“酮”功能的DNA序列。用5'-甲硅烷氧基醚接头官能化的脱氧核糖核苷亚磷酰胺的产率为75-83％，最后掺入DNA序列的固相组装中。从合成载体中释放的脱碱基保护的碱基和磷酸脱保护的DNA序列的捕获已证明接近定量进行。从捕获载体上洗短于全长的DNA序列后，经四氢萘处理，从该载体上释放出纯化的DNA序列。在干DMSO中的正丁基氟化铵。释放的DNA序列的纯度超过98％。在不牺牲DNA序列纯度的情况下，证明了纯化过程的可扩展性和高通量特征。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b01020

文献信息

• [EN] SOLID-PHASE PURIFICATION OF SYNTHETIC NUCLEIC ACID SEQUENCES<br/>[FR] PURIFICATION EN PHASE SOLIDE DE SÉQUENCES D'ACIDES NUCLÉIQUES SYNTHÉTIQUES
  申请人：US HEALTH

  公开号：WO2018005630A1

  公开（公告）日：2018-01-04

  The invention provides a compound of the formula (I), and a capture support of the formula (9), wherein R1, R2, R3, R6, A, B, D, E, J, K, Q, W, and Z are as defined herein. The invention also provides a method of purifying an oligonucleotide or an oligonucleotide analog composed of "b" nucleotides from a mixture comprising the oligonucleotide or oligonucleotide analog and at least one oligonucleotide or oligonucleotide analog composed of "a" nucleotides, wherein b ≠ a, comprising use of the compound and the capture support.

  该发明提供了一个公式(I)的化合物，以及一个公式(9)的捕获支持物，其中R1、R2、R3、R6、A、B、D、E、J、K、Q、W和Z如本文所定义。该发明还提供了一种从包括寡核苷酸或寡核苷酸类似物和至少一种由"a"核苷酸组成的寡核苷酸或寡核苷酸类似物的混合物中纯化由"b"核苷酸组成的寡核苷酸或寡核苷酸类似物的方法，其中b ≠ a，包括使用该化合物和捕获支持物。
• Solid-Phase Purification of Synthetic DNA Sequences
  作者：Andrzej Grajkowski、Jacek Cieslak、Serge L. Beaucage

  DOI：10.1021/acs.joc.6b01020

  日期：2016.8.5

  for solid-phase synthesis of DNA sequences are currently available for synthetic biology applications and technologies for large-scale production of nucleic acid-based drugs have been exploited for various therapeutic indications, little has been done to develop high-throughput procedures for the purification of synthetic nucleic acid sequences. An efficient process for purification of phosphorothioate

  尽管目前可用于合成生物学应用的用于DNA序列固相合成的高通量方法，并且已将大规模生产基于核酸的药物的技术用于各种治疗适应症，但为开发高通量所做的工作很少合成核酸序列的纯化方法。本文描述了用于纯化硫代磷酸酯和天然DNA序列的有效方法。该过程包括用氨氧基烷基官能化功能化商业化的氨基丙基化硅胶，以通过肟化反应捕获带有5'-甲氧基醚连接基的带有“酮”功能的DNA序列。用5'-甲硅烷氧基醚接头官能化的脱氧核糖核苷亚磷酰胺的产率为75-83％，最后掺入DNA序列的固相组装中。从合成载体中释放的脱碱基保护的碱基和磷酸脱保护的DNA序列的捕获已证明接近定量进行。从捕获载体上洗短于全长的DNA序列后，经四氢萘处理，从该载体上释放出纯化的DNA序列。在干DMSO中的正丁基氟化铵。释放的DNA序列的纯度超过98％。在不牺牲DNA序列纯度的情况下，证明了纯化过程的可扩展性和高通量特征。