1-<5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-deoxy-3-C-(4,5-dihydro-5-methyl-1,3,5-dithiazin-2-yl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>thymine | 129678-64-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-<5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-deoxy-3-C-(4,5-dihydro-5-methyl-1,3,5-dithiazin-2-yl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>thymine
• 英文别名: 1-[5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-deoxy-3-C-(4,5-dihydro-5-methyl-1,3,5-dithiazin-2-yl)-β-D-arabino-pentofuranosyl]thymine；1-[(2R,3S,4S,5S)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3-hydroxy-4-(5-methyl-1,3,5-dithiazinan-2-yl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 129678-64-4
• 化学式: C₃₀H₃₉N₃O₅S₂Si
• 分子量: 613.874
• InChiKey: XOUMJQXIXXQHTM-HIQYAUPDSA-N

物化性质

• 密度：
  1.30±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.95
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  96.79
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-<5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-deoxy-3-C-(4,5-dihydro-5-methyl-1,3,5-dithiazin-2-yl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>thymine 在 sodium tetrahydroborate 、 四丁基氟化铵 、 mercury dichloride 、 mercury(II) oxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 0.58h， 生成 1-<3-deoxy-3-C-(hydroxymethyl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>thymine
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷的合成及其抗病毒活性。

  摘要：

  已经合成了一系列的3'-支链糖核苷，特别是3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷，并将其评估为抗病毒剂。尿嘧啶和胸腺嘧啶的1-（2,3-环氧-5-O-三苯甲基-β-D-lyxo-五氟呋喃糖基）衍生物12和13分别与5,6-二氢-2-lithio-5-甲基-1,3,5-二噻嗪14分别提供相应的3'-官能化核苷15和16。用叔丁基二苯基甲硅烷基取代三苯甲基可高产率地水解3'-官能团，得到3'-脱氧-3'-C-甲酰基-β-D-阿拉伯糖基-戊呋喃糖基核苷21和22。甲硅烷基化得到1-（ 3-脱氧-3-C-甲酰基-β-D-lyxo-戊呋喃糖基）3'，5'-O-半缩醛核苷33和34。还原21和22的甲酰基，然后进行甲硅烷基化，分别产生3'-脱氧-3'-C-（羟甲基）-β-D-阿拉伯糖基-呋喃呋喃糖基）类似物7和8。将7的尿嘧啶碱基部分转化为5-碘尿嘧啶，然后转化为（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶，以提供B

  DOI：

  10.1021/jm00171a025
• 作为产物：
  描述：

  1-(2,3-epoxy-5-O-trityl-β-D-lyxo-pentofuranosyl)thymine 在 二氯乙酸 、 六甲基磷酰三胺 、 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.67h， 生成 1-<5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3-deoxy-3-C-(4,5-dihydro-5-methyl-1,3,5-dithiazin-2-yl)-β-D-arabino-pentofuranosyl>thymine
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷的合成及其抗病毒活性。

  摘要：

  已经合成了一系列的3'-支链糖核苷，特别是3'-脱氧-3'-C-羟甲基核苷，并将其评估为抗病毒剂。尿嘧啶和胸腺嘧啶的1-（2,3-环氧-5-O-三苯甲基-β-D-lyxo-五氟呋喃糖基）衍生物12和13分别与5,6-二氢-2-lithio-5-甲基-1,3,5-二噻嗪14分别提供相应的3'-官能化核苷15和16。用叔丁基二苯基甲硅烷基取代三苯甲基可高产率地水解3'-官能团，得到3'-脱氧-3'-C-甲酰基-β-D-阿拉伯糖基-戊呋喃糖基核苷21和22。甲硅烷基化得到1-（ 3-脱氧-3-C-甲酰基-β-D-lyxo-戊呋喃糖基）3'，5'-O-半缩醛核苷33和34。还原21和22的甲酰基，然后进行甲硅烷基化，分别产生3'-脱氧-3'-C-（羟甲基）-β-D-阿拉伯糖基-呋喃呋喃糖基）类似物7和8。将7的尿嘧啶碱基部分转化为5-碘尿嘧啶，然后转化为（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶，以提供B

  DOI：

  10.1021/jm00171a025

文献信息

• Synthesis and antiviral activity of some 3'-C-difluoromethyl- and 3'-deoxy-3'-C-fluoromethyl nucleosides
  作者：Mark J. Bamford、Paul L. Coe、Richard T. Walker

  DOI：10.1021/jm00171a024

  日期：1990.9

  The synthesis and antiviral activity of a number of 3'-C-difluoromethyl and 3'-deoxy-3'-C-fluoromethyl nucleosides are reported. The 3'-C-difluoromethyl nucleosides 26a and 26b were obtained by treatment of the corresponding 2',5'-di-O-protected-3'-C-formyl nucleosides 25a and 25b with (diethylamino)sulfur trifluoride (DAST). Removal of the 2'-O-protecting group from 26a and subsequent reaction with

  报道了许多3'-C-二氟甲基和3'-脱氧-3'-C-氟甲基核苷的合成和抗病毒活性。通过用（二乙基氨基）三氟化硫（DAST）处理相应的2'，5'-二-O-保护的-3'-C-甲酰基甲酰基核苷25a和25b，获得3'-C-二氟甲基核苷26a和26b。从26a除去2'-O-保护基，然后与DAST反应，得到2'-脱氧-2'-氟-β-D-核糖-戊呋喃糖基核苷29。用DAST对5'-O-进行选择性氟化保护的类似物3'-脱氧-3'-C-羟甲基衍生物13a和13b得到3'-脱氧-3'-C-氟甲基衍生物30a和30b，而非选择性氟化得到2'，3'-二脱氧-2' -氟-3'-C-氟甲基类似物31a和31b。将去保护的尿嘧啶类似物17a碘化为5-碘尿嘧啶衍生物18。评估了完全去保护的氟化的3'-C-分支的核苷14-18和32的抗病毒活性。在浓度高达100 microM的情况下，没有一种对人类1型免疫缺陷病毒（HI
• Synthesis of 2′‐Substituted MMI Linked Nucleosidic Dimers: An Optimization Study in Search of High Affinity Oligonucleotides for Use in Antisense Constructs
  作者：Didier Peoc'h、Eric E. Swayze、Balkrishen Bhat、Yogesh S. Sanghvi

  DOI：10.1081/ncn-120028337

  日期：2004.1.1

  The synthesis of a series of methylene(methylimino) (MMI) linked oligodeoxyribonucleotide dimers modified at the 2'-position with fluoro and/or methoxy groups and their incorporation into different sequences has been accomplished. From these dimers, his 2'-OMe MMI dimer was selected for further studies based on its synthetic accessibility and the increased thermodynamic stability conferred upon oligonucleotides incorporating this modification.
• VINNICHENKO, A. I.;LIVENSKAYA, O. A.;TSURKAN, I. V., XIMIYA PRIROD. SOED.,(1990) N, S. 842-844
  作者：VINNICHENKO, A. I.、LIVENSKAYA, O. A.、TSURKAN, I. V.

  DOI：——

  日期：——