2'-deoxy-2'-fluoro-5'-O-TBDMS-cytidine | 1246253-27-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-2'-fluoro-5'-O-TBDMS-cytidine
• 英文别名: 5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-2'-fluorocytidine；4-amino-1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-3-fluoro-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1246253-27-9
• 化学式: C₁₅H₂₆FN₃O₄Si
• 分子量: 359.473
• InChiKey: ZWSAIAKEHLKNAF-OJAKKHQRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.44
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  97.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-2'-fluoro-5'-O-TBDMS-cytidine 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 四丁基氟化铵 、 silver nitrate 、 sodium hydroxide 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 1-((2R,3R,4R)-3-fluoro-5,5-bis(hydroxymethyl)-4-((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-4-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)pyrimidin-2(1H)-one
  参考文献：
  名称：

  发现用于治疗人类呼吸道合胞病毒的一流​​RSV聚合酶抑制剂4'-氯甲基-2'-脱氧3'，5'-二-O-异丁酰基-2'-氟胞苷（ALS-8176）感染

  摘要：

  呼吸道合胞病毒（RSV）是儿童期的主要病原体，与明显的发病率和死亡率有关。迄今为止，利巴韦林是唯一获准使用的小分子药物，用途有限。唯一的其他RSV药物是帕利珠单抗（palivizumab），一种单克隆抗体，可用于RSV预防。显然，迫切需要小分子RSV药物。本文报道了一系列4'-取代胞苷核苷的设计，合成，抗RSV活性，代谢和药代动力学。在测试的化合物中，4'-氯甲基-2'-脱氧-2'-氟胞苷（2c）在RSV复制子测定中表现出最有希望的活性，EC 50为0.15μM。2c（2c - TP的5'-三磷酸）抑制RSV聚合酶的IC 50为0.02μM，而对100μM的人DNA和RNA聚合酶没有明显的抑制作用。ALS-8176（71）是2c的3'，5'-二-O-异丁酰基前药，在体内具有良好的口服生物利用度和2c - TP高水平。化合物71是一流的核苷RSV聚合酶抑制剂，在2期临床RSV攻击研究中显示出优异的抗RSV功效和安全性。

  DOI：

  10.1021/jm5017279
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 2'-脱氧-2-氟胞苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 以77%的产率得到2'-deoxy-2'-fluoro-5'-O-TBDMS-cytidine
  参考文献：
  名称：

  2',3'-Dideoxy-2'-fluoro-3'-(hydroxyimino)-、-3'-(甲氧基亚氨基)-和-3'-(羟基氨基)嘧啶核苷的合成

  摘要：

  合成了新系列的 2',3'-dideoxy-2'-fluoro-3'-(羟基亚氨基)-、-3'-(甲氧基亚氨基)-和-3'-(羟基氨基)嘧啶核苷。作为 (E) 和 (Z) 异构体不可分离的混合物获得的前两种衍生物的结构分配基于 1 H 和 19 F NMR 光谱分析。特别是，我们观察到 19F NMR 光谱的显着差异，这是由具有近邻氮（肟）和氟原子的化合物通过空间 N-F 耦合引起的，其中孤对原子正确定向以重叠。评估了靶核苷的抗病毒和细胞毒活性；然而，它们都没有表现出任何抗病毒活性。只有 2',3'-dideoxy-2'-fluoro-3'-(hydroxyamino)cytidine (19) 对鼠白血病细胞 (L1210) 的增殖显示出中等活性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201200119

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF<br/>[FR] NUCLÉOSIDES, NUCLÉOTIDES SUBSTITUÉS ET LEURS ANALOGUES
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2014209979A1

  公开（公告）日：2014-12-31

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and analogs thereof, pharmaceutical compositions that include one or more of nucleosides, nucleotides and analogs thereof, and methods of synthesizing the same. Also disclosed herein are methods of ameliorating and/or treating a disease and/or a condition, including an infection from a norovirus, with a nucleoside, a nucleotide and an analog thereof.

  本文揭示了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还揭示了利用核苷、核苷酸及其类似物改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物治疗诺如病毒感染的方法。
• [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE ANALOGS<br/>[FR] NUCLEOSIDE SUBSTITUE ET ANALOGUES NUCLEOTIDIQUES
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2010108140A1

  公开（公告）日：2010-09-23

  Disclosed herein are nucleotide analogs with protected phosphates, methods of synthesizing nucleotide analogs with protected phosphates and methods of treating diseases and/or conditions such as viral infections, cancer, and/or parasitic diseases with the nucleotide analogs with protected phosphates.

  本文披露了具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物，以及合成具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物的方法，以及利用具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物治疗病毒感染、癌症和/或寄生虫病等疾病和/或症状的方法。
• Synthesis of 2′,3′-Dideoxy-2′-fluoro-3′-(hydroxyimino)-, -3′-(methoxyimino)- and -3′-(hydroxyamino)pyrimidine Nucleosides
  作者：Ahmed Khalil、Christophe Mathé、Christian Périgaud

  DOI：10.1002/ejoc.201200119

  日期：2012.6

  New series of 2′,3′-dideoxy-2′-fluoro-3′-(hydroxyimino)-, -3′-(methoxyimino)- and -3′-(hydroxyamino)pyrimidine nucleosides were synthesized. Structural assignments of the former two derivatives, which were obtained as inseparable mixtures of (E) and (Z) isomers, were based upon 1H and 19F NMR spectroscopic analysis. In particular, we observed striking differences in 19F NMR spectra resulting from through-space

  合成了新系列的 2',3'-dideoxy-2'-fluoro-3'-(羟基亚氨基)-、-3'-(甲氧基亚氨基)-和-3'-(羟基氨基)嘧啶核苷。作为 (E) 和 (Z) 异构体不可分离的混合物获得的前两种衍生物的结构分配基于 1 H 和 19 F NMR 光谱分析。特别是，我们观察到 19F NMR 光谱的显着差异，这是由具有近邻氮（肟）和氟原子的化合物通过空间 N-F 耦合引起的，其中孤对原子正确定向以重叠。评估了靶核苷的抗病毒和细胞毒活性；然而，它们都没有表现出任何抗病毒活性。只有 2',3'-dideoxy-2'-fluoro-3'-(hydroxyamino)cytidine (19) 对鼠白血病细胞 (L1210) 的增殖显示出中等活性。
• SUBSTITUTED NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE ANALOGS
  申请人：Beigelman Leonid

  公开号：US20100249068A1

  公开（公告）日：2010-09-30

  Disclosed herein are nucleotide analogs with protected phosphates, methods of synthesizing nucleotide analogs with protected phosphates and methods of treating diseases and/or conditions such as viral infections, cancer, and/or parasitic diseases with the nucleotide analogs with protected phosphates.

  本文公开了一种具有保护磷酸酯的核苷酸类似物，合成具有保护磷酸酯的核苷酸类似物的方法以及使用具有保护磷酸酯的核苷酸类似物治疗病毒感染、癌症和/或寄生虫病等疾病和/或病况的方法。
• Discovery of 4′-Chloromethyl-2′-deoxy-3′,5′-di-<i>O</i>-isobutyryl-2′-fluorocytidine (ALS-8176), A First-in-Class RSV Polymerase Inhibitor for Treatment of Human Respiratory Syncytial Virus Infection
  作者：Guangyi Wang、Jerome Deval、Jin Hong、Natalia Dyatkina、Marija Prhavc、Joshua Taylor、Amy Fung、Zhinan Jin、Sarah K. Stevens、Vladimir Serebryany、Jyanwei Liu、Qingling Zhang、Yuen Tam、Sushmita M. Chanda、David B. Smith、Julian A. Symons、Lawrence M. Blatt、Leo Beigelman

  DOI：10.1021/jm5017279

  日期：2015.2.26

  Clearly, there is an urgent need for small molecule RSV drugs. This article reports the design, synthesis, anti-RSV activity, metabolism, and pharmacokinetics of a series of 4′-substituted cytidine nucleosides. Among tested compounds 4′-chloromethyl-2′-deoxy-2′-fluorocytidine (2c) exhibited the most promising activity in the RSV replicon assay with an EC50 of 0.15 μM. The 5′-triphosphate of 2c (2c-TP)

  呼吸道合胞病毒（RSV）是儿童期的主要病原体，与明显的发病率和死亡率有关。迄今为止，利巴韦林是唯一获准使用的小分子药物，用途有限。唯一的其他RSV药物是帕利珠单抗（palivizumab），一种单克隆抗体，可用于RSV预防。显然，迫切需要小分子RSV药物。本文报道了一系列4'-取代胞苷核苷的设计，合成，抗RSV活性，代谢和药代动力学。在测试的化合物中，4'-氯甲基-2'-脱氧-2'-氟胞苷（2c）在RSV复制子测定中表现出最有希望的活性，EC 50为0.15μM。2c（2c - TP的5'-三磷酸）抑制RSV聚合酶的IC 50为0.02μM，而对100μM的人DNA和RNA聚合酶没有明显的抑制作用。ALS-8176（71）是2c的3'，5'-二-O-异丁酰基前药，在体内具有良好的口服生物利用度和2c - TP高水平。化合物71是一流的核苷RSV聚合酶抑制剂，在2期临床RSV攻击研究中显示出优异的抗RSV功效和安全性。