N-benzoyl-2',3',5'-tris-O-tert-butyldimethylsilylcytidine | 72429-32-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N-benzoyl-2',3',5'-tris-O-tert-butyldimethylsilylcytidine
• 英文别名: N⁴-benzoyl-O^2'_,O3'_,O5'-tris-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-cytidine；N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 72429-32-4
• 化学式: C₃₄H₅₉N₃O₆Si₃
• 分子量: 690.115
• InChiKey: SUXWDFSKKMIISW-MZAPLOMJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.2
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  98.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzoyl-2',3',5'-tris-O-tert-butyldimethylsilylcytidine 在 氨 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 6-(N-tert-butylhydroxylamino)-2',3',5'-tris-O-tert-butyldimethylsilylcytidine
  参考文献：
  名称：

  一类新的带有N-叔丁基氨基木糖基自由基的自旋标记核糖核苷的分子设计。

  摘要：

  我们设计了一种新的自旋标记核苷，其带有一个N-叔丁基氨基羟自由基，该自由基被直接引入到核碱基中。合成了含有氨基基团（例如1a-d，2、3和4）的嘌呤和嘧啶核糖核苷，以研究N-叔丁基氨基甲氧基在核碱基上的稳定性和行为。三-O-甲硅烷基化的6-氯嘌呤核糖核苷（5）的锂化，然后与2-甲基-2-亚硝基丙烷（MNP）反应，得到关键化合物6a，将其进一步转化为6b-d。用Ag（2）O氧化获得的6a-d及其三醇（7a-d）导致形成相应的稳定自旋标记核苷（8a-d和1a-d），这已通过EPR光谱法确认。同样，自旋标记的嘧啶的前体（13，20，通过将三-O-保护的嘧啶衍生物（9、18和21）进行位点选择性锂化，然后与MNP反应并进行脱保护，来合成α-α和β-α和β-α和β-α-α-β-α-β-α-α-β-氨基吗啉。EPR研究表明，氨氧自由基（2、3和4）是稳定的，它们的超精细结构取决于自由基的位置。嘧啶的电子密度也影响超精细结构。

  DOI：

  10.1021/jo015532s
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 苯甲酰胞苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-benzoyl-2',3',5'-tris-O-tert-butyldimethylsilylcytidine
  参考文献：
  名称：

  超声波辅助交叉复分解直接合成芳氧基膦酰胺核苷酸前药

  摘要：

  芳氧基膦酰胺核苷酸前药（A、G、C 和 U）的直接合成策略是通过超声辐射辅助的 CM 反应以及在 61-82% 溶液中分配添加 12 mol% 的 Hoveyda-Grubbs (HG) II 催化剂来开发的。产生由芳氧基乙烯基膦酰胺和 5'-乙烯基核苷部分组成的E- / Z-异构体 (∼2:1) 的混合物。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.4c00094

文献信息

• A Practical Method for Regioselective 5′-O-tert-Butyldimethylsilyl Deprotection of Persilylated Nucleosides by Methanolic Phosphomolybdic Acid
  作者：Shan-Shan Gong、Qi Sun、Hua-Shan Huang、Rui Kong、Xiu-An Zheng、Wei-Jie Chen、Shuai-Bo Han、De-Yun Zeng

  DOI：10.1055/s-0037-1610300

  日期：2018.11

  In nucleoside/nucleotide chemistry, the regioselective cleavage of 5′-O-TBS groups of persilylated nucleosides is a desired approach for structural functionalization at the 5′-position. However, efficient and practical methods for this purpose are still limited. In our research, we found that homogeneous methanolic phosphomolybdic acid (PMA) efficiently catalyzes the regioselective deprotection of

  在核苷/核苷酸化学中，全甲硅烷基化核苷的 5'-O-TBS 基团的区域选择性切割是 5' 位结构功能化的理想方法。然而，用于此目的的有效和实用的方法仍然有限。在我们的研究中，我们发现均相甲醇磷钼酸 (PMA) 可有效催化多种全甲硅烷基化核苷底物的 5'-O-TBS 基团的区域选择性脱保护，并可用于实际合成，规模可达 15 g。31P NMR 结果表明形成了阴离子簇，且均相 PMA 的路易斯酸度取决于有机溶剂。甲醇 PMA 的功效和显着的区域选择性是由于磷酸钼阴离子溶剂化后路易斯酸强度降低的结果。
• Facile and highly selective 5′-desilylation of multisilylated nucleosides
  作者：Xue-Feng Zhu、Howard J. Williams、A. Ian Scott

  DOI：10.1039/b003562i

  日期：——

  Efficient methods for selective 5'-desilylation of multisilylated nucleosides are described.

  介绍了选择性地对多硅烷基化核苷进行 5'-去硅烷基化的高效方法。
• Aqueous Trichloroacetic Acid: Another Useful Reagent for Highly Selective 5′-Desilylation of Multisilylated Nucleosides
  作者：Xue-Feng Zhu、Howard J. Williams、A. Ian Scott

  DOI：10.1081/scc-120021027

  日期：2003.7

  Highly selective 5'-desilylation of multisilylated nucleosides can be achieved in excellent yield by treatment with 4.2 M aqueous trichloroacetic acid:THF (1:4) at 0degreesC.