由于越来越多的细菌产生抗药性,具有新作用机理的化合物至关重要。DNA促旋酶B是在抗菌素发现领域进行过深入研究的治疗靶标之一。在本工作中,我们合成了一个潜在的DNA促旋酶B
抑制剂的有针对性的文库,该
抑制剂文库由两个关键的药效基团组成,它们通过三种类型的sp 3连接丰富的接头以获得化合物的三个结构类别。使用分子对接,分子动力学和结合位点中的保守
水的分析,我们确定了
哌啶-4-基和4-环己基
吡咯-2-羧酰胺的良好结合模式,同时预测了与
哌嗪吡咯-2的活性位点的不利相互作用-羧酰胺。制备的化合物在分离的酶DNA促旋酶B上的
生物学评估证实了我们的预测,并提供了多种DNA促旋酶B的中度有效
抑制剂。即反式-4-(4,5-二
溴-1 H-
吡咯-2-羧酰胺)环己基)甘
氨酸和具有IC 50的4-(4-(3,4-二
氯-5-甲基-1 H-
吡咯-2-羧酰胺基)
哌啶-1-基)-4-氧代
丁酸 分别为16和0.5μM。