(R)-β-bromo-N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)alanine tert-butyl ester | 634182-11-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (R)-β-bromo-N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)alanine tert-butyl ester
• 英文别名: tert-butyl N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-β-bromo-L-alaninate；tert-butyl 2-(R)-(9-fluorenylmethyloxycarbonylamino)-3-bromopropanoate；tert-butyl N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-β-bromo-L-alanine；tert-butyl (R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-bromopropanoate；Fmoc-β-bromo-L-Ala-OtBu；(R)-tert-Butyl 2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-bromopropanoate；tert-butyl (2R)-3-bromo-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoate
• CAS: 634182-11-9
• 化学式: C₂₂H₂₄BrNO₄
• 分子量: 446.341
• InChiKey: PKKRRRXPQCRJOD-IBGZPJMESA-N

物化性质

• 沸点：
  549.6±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.349±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  64.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-β-bromo-N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)alanine tert-butyl ester 在 哌啶 、 吗啉 、 四(三苯基膦)钯 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 (2R,6R)-N²,N⁶-bis(palmitoyl)lanthionine-ε-hexadecylamide α-tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  Lipolanthionine Peptides Act as Inhibitors of TLR2-Mediated IL-8 Secretion. Synthesis and Structure−Activity Relationships

  摘要：

  Lipoproteins from Gram-positive and -negative bacteria, mycoplasma, and shorter synthetic lipopeptide analogues activate cells of the innate immune system via the Toll-like receptor TLR2/TLR1 or TLR2/TLR6 heterodimers. For this reason, these compounds constitute highly active adjuvants for vaccines either admixed or covalently linked. The lanthionine scaffold has structural similarity with the S-(2,3-dihydroxypropyl)cysteine core structure of the lipopeptides. Therefore, lanthionine-based lipopeptide amides were synthesized and probed for activity as potential TLR2 agonists or antagonists. A collection of analytically defined lipolanthionine peptide amides exhibited an inhibitory effect of the TLR2-mediated IL-8 secretion when applied in high molar excess to the agonistic synthetic lipopeptide Pam(3)Cys-Ser-(LyS)(4)-OH. Structure-activity relationships revealed the influence of the chirality of the two alpha-carbon atoms, the chain lengths of the attached fatty acids and fatty amines, and the oxidation level of the sulfur atom on the inhibitory activity of the lipolanthionine peptide amides.

  DOI：

  10.1021/jm050585d
• 作为产物：
  描述：

  L-serine tert-butyl ester 在 四溴化碳 、 碳酸氢钠 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 生成 (R)-β-bromo-N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)alanine tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  用于制备叠氮肽的 Fmoc 叠氮基氨基酸的优化合成。

  摘要：

  CuI 催化点击化学的兴起引发了对氨基酸的叠氮基和炔烃衍生物作为点击肽合成前体的需求增加。然而，叠氮基和炔氨基酸在肽化学中的使用因其高成本而变得复杂。为此，我们研究了内部制备一组五种 Fmoc 叠氮基氨基酸的可能性：β-叠氮基l-丙氨酸和d-丙氨酸、γ-叠氮基l-高丙氨酸、δ-叠氮基l-鸟氨酸和ω叠氮升-赖氨酸。我们研究了文献中描述的几种反应途径，提出了一些改进建议，并提出了几种合成高纯度化合物的替代途径。在这里，我们证明可以在一两周内以用户友好的成本制备多克数量的这些 Fmoc 叠氮基氨基酸。我们还将这些叠氮基氨基酸并入几种模型三肽中，我们观察到在与 2-(1 H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸盐/DIPEA。我们希望我们详细的合成方案能激励一些肽化学家在他们的实验室中制备这些 Fmoc 叠氮酸，并帮助他们避免叠氮肽合成过于庞大的成本。

  DOI：

  10.1002/psc.2968

文献信息

• Decarbonylative Approach to the Synthesis of Enamides from Amino Acids: Stereoselective Synthesis of the (<i>Z</i>)-Aminovinyl-<scp>d</scp>-Cysteine Unit of Mersacidin
  作者：Pablo García-Reynaga、Angela K. Carrillo、Michael S. VanNieuwenhze

  DOI：10.1021/ol203399x

  日期：2012.2.17

  The Pd- and Ni-promoted decarbonylation of amino acid thioesters proceeds smoothly to yield enamides. The synthesis of the (S)-(Z)-AviMeCys subunit of mersacidin, an MRSA-active lantibiotic, via this approach, is described.

  Pd 和 Ni 促进的氨基酸硫酯脱羰反应顺利进行，生成烯酰胺。描述了通过这种方法合成MRSA 活性羊毛硫抗生素 mersacidin的 ( S )-( Z )-AviMeCys 亚基。
• Glycopeptide Self-Assembly Modulated by Glycan Stereochemistry through Glycan–Aromatic Interactions
  作者：Changdong He、Shuang Wu、Dangliang Liu、Changbiao Chi、Weilin Zhang、Ming Ma、Luhua Lai、Suwei Dong

  DOI：10.1021/jacs.0c06360

  日期：2020.10.7

  other results from spectroscopic, microscopic and rheological experiments, indicate an unusual carbohydrate-aromatic CH-π bonding that promotes glycopeptide self-assembly. These mechanistic findings, particularly evidences obtained at the angstrom scale, illuminate an intriguing role that carbohydrates can play in building supramolecules. Potential biomaterials exploiting the CH-π bond-based stabilization

  碳水化合物通常用于在自组装糖肽中提供亲水性和基于羟基的氢键，提供在生物医学研究中具有广泛适用性的多功能支架。然而，碳水化合物的立体化学如何影响自组装过程仍不清楚。在这里，我们建立了一个二聚体富含酪氨酸的糖肽系统，用于在位点和立体特异性糖基化的影响下探测相应的水凝胶化行为。在 Tyr4 和 Tyr4' 处带有单糖的 18 种糖型的比较表明，当聚糖部分含有轴向羟基时，具有 α-或 β-端基异构体的糖肽表现出相反的胶凝能力。含 β-半乳糖凝胶剂的高分辨率 X 射线晶体结构，以及其他光谱结果，显微和流变学实验表明，一种不寻常的碳水化合物-芳香族 CH-π 键可促进糖肽自组装。这些机械发现，特别是在埃尺度上获得的证据，阐明了碳水化合物在构建超分子中可以发挥的有趣作用。因此，可以开发利用基于 CH-π 键的稳定性的潜在生物材料，例如抗酶水凝胶。
• Design of α-<i>S</i>-Neoglycopeptides Derived from MUC1 with a Flexible and Solvent-Exposed Sugar Moiety
  作者：Víctor Rojas-Ocáriz、Ismael Compañón、Carlos Aydillo、Jorge Castro-Loṕez、Jesús Jiménez-Barbero、Ramón Hurtado-Guerrero、Alberto Avenoza、María M. Zurbano、Jesús M. Peregrina、Jesús H. Busto、Francisco Corzana

  DOI：10.1021/acs.joc.6b00833

  日期：2016.7.15

  linker between the carbohydrate (GalNAc) and the peptide backbone. The main conformations of these molecules in solution have been evaluated by combining NMR experiments and molecular dynamics simulations. The linker plays a key role in the modulation of the conformation of these compounds at different levels, blocking a direct contact between the sugar moiety and the backbone, promoting a helix-like conformation

  使用基于MUC1糖肽的疫苗是治疗癌症的有前途的方法。我们在本文中提出了几种并入MUC1序列的磺胺类Tn抗原，它们在碳水化合物（GalNAc）和肽主链之间具有可变的接头。这些分子在溶液中的主要构象已经通过结合NMR实验和分子动力学模拟进行了评估。接头在调节这些化合物在不同水平上的构象，阻止糖部分与骨架之间的直接接触，促进糖基化残基的螺旋状构象并促进糖单元的正确呈递中起关键作用。用于分子识别事件。这些新化合物作为MUC1抗原模拟物的可行性已通过与抗MUC1单克隆抗体复合的这些非天然衍生物之一的X射线衍射结构进行了验证。这些特征以及潜在的缺乏免疫抑制的特性使得这些非天然糖肽成为有希望的候选者，用于设计针对癌症的替代性治疗疫苗。
• Synthesis of the Antimicrobial S-Linked Glycopeptide, Glycocin F
  作者：Margaret A. Brimble、Pat J. Edwards、Paul W. R. Harris、Gillian E. Norris、Mark L. Patchett、Tom H. Wright、Sung-Hyun Yang、Sarah E. Carley

  DOI：10.1002/chem.201405692

  日期：2015.2.23

  The first total synthesis of glycocin F, a uniquely diglycosylated antimicrobial peptide bearing a rare S‐linked N‐acetylglucosamine (GlcNAc) moiety in addition to an O‐linked GlcNAc, has been accomplished using a native chemical ligation strategy. The synthetic and naturally occurring peptides were compared by HPLC, mass spectrometry, NMR and CD spectroscopy, and their stability towards chymotrypsin

  糖蛋白F是一种独特的双糖基化抗菌肽，除了O-连接的GlcNAc外，还带有一个罕见的S-连接的N-乙酰氨基葡萄糖（GlcNAc）部分，它的第一个全合成过程已经使用天然化学连接策略完成了。通过HPLC，质谱，NMR和CD光谱对合成的和天然存在的肽进行了比较，并测量了它们对胰凝乳蛋白酶消化的稳定性和抗菌活性。这是天然存在的糖蛋白与活性合成类似物的首次全面结构和功能比较。
• Efficient Synthesis of S-Linked Glycopeptides in Aqueous Solution by a Convergent Strategy
  作者：Xiangming Zhu、Richard R. Schmidt

  DOI：10.1002/chem.200305163

  日期：2004.2.20

  In naturally occurring glycopeptides and glycoproteins the glycan residues generally possess N- and O-linkages to the peptide backbone. Here we report the synthesis of the corresponding S-linked glycopeptides by a convergent strategy to provide compounds which should be quite stable to glycosidases. To this end, peptides that contain beta-bromoalanine and gamma-bromohomoalanine were generated either

  在天然存在的糖肽和糖蛋白中，聚糖残基通常具有与肽主链的N-和O-键。在这里，我们报告了通过收敛策略合成相应的S-连接糖肽，以提供对糖苷酶应相当稳定的化合物。为此，分别通过丝氨酸和高丝氨酸残基的溴化或通过相应氨基酸的标准连接直接产生含有β-溴丙氨酸和γ-溴高丙氨酸的肽。通过已知方法制备了O-乙酰基保护的GalNAc，GlcNAc和乳糖的1-硫代糖。在含有TBAHS和NaHCO（3）的乙酸乙酯/水两相系统中，或在由DMF /水组成且含有NaHCO（3）的单相系统中，硫糖与这些肽的反应，可以干净，几乎定量地得到所需的S-连接糖肽。该反应对于O-未保护的1-硫代糖也很好地起作用。