N-芴甲氧羰基-L-苏氨酸五氟苯基酯 | 86061-06-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-L-苏氨酸五氟苯基酯
• 英文名称: N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-threonine pentafluorophenyl ester
• 英文别名: N^α-(Fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-L-threonine pentafluorophenyl ester；N-α-Fmoc-Thr-OPfp；(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) (2S,3R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-hydroxybutanoate
• CAS: 86061-06-5
• 化学式: C₂₅H₁₈F₅NO₅
• 分子量: 507.414
• InChiKey: DTNNEIDNILVUPB-XFNZEKPQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-L-苏氨酸五氟苯基酯 在 3 A molecular sieve 、 silver trifluoromethanesulfonate 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 Acetic acid (2R,3S,4R,4aR,7S,8R,9aR)-3-acetoxy-2-acetoxymethyl-7-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-8-methyl-6-oxo-octahydro-1,9-dioxa-5-aza-benzocyclohepten-4-yl ester
  参考文献：
  名称：

  从 N-二硫代琥珀酰保护衍生物合成 2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖O-糖肽1-3

  摘要：

  2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖 (β-d-GlcpNAc)，在与丝氨酸 (Ser) 和苏氨酸 (Thr) 残基侧链羟基的 O-糖苷键中，经常在细胞核和细胞质中发现蛋白质。固相糖肽合成的“活性酯”方法需要 Nα-(9-芴基甲氧羰基)氨基酸五氟苯基酯 (Nα-Fmoc-AA-OPfp's) 的直接糖基化。所需的 Ser(β-d-GlcpNAc) 和 Thr(β-d-GlcpNAc) 结构单元的合成带来了由相应糖基供体中的 2-氨基取代基引起的特殊问题。用 2-N-酰基基团激活供体提供了相对不活泼的恶唑啉中间体，而原本有希望的邻苯二甲酰基 (Phth) 基团需要在高温下长时间进行碱处理才能将其去除，并且经常遇到不完全脱保护。二硫代琥珀酰基 (Dts) 基团以与 Phth 基团相同的方式提供二价保护，但具有在温和条件下快速去除的优点...

  DOI：

  10.1021/ja953529i
• 作为产物：
  描述：

  9-芴甲基五氟苯基碳酸酯 在 碳酸氢钠 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 水 、 乙酸乙酯 、 丙酮 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-芴甲氧羰基-L-苏氨酸五氟苯基酯
  参考文献：
  名称：

  Schoen, Istvan; Kisfaludy, Lajos, Synthesis, 1986, # 4, p. 303 - 305

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Removal of Acyl Protective Groups from Glycopeptides:  Base Does Not Epimerize Peptide Stereocenters, and β-Elimination Is Slow
  作者：Petter Sjölin、Mikael Elofsson、Jan Kihlberg

  DOI：10.1021/jo951817r

  日期：1996.1.1

  conditions, which are required for removal of O-benzoyl groups, beta-elimination occurred slowly and was accompanied by slight (<5%) epimerization. The surprisingly low tendency of glycopeptides to undergo base catalyzed epimerization and beta-elimination is most likely due to protection of the alpha-carbon stereocenters by deprotonation of the adjacent amide groups.

  糖肽立体中心的差向异构和β-消除被认为是糖肽脱酰作用的重要潜在副反应，所述糖肽具有被O-酰基保护的碳水化合物部分。由于没有关于这些副反应的系统研究的报道，因此制备了一个模型化的乙酰化，O-连接的糖三肽及其在α-碳立体中心的三个差向异构体。如通过（1）H NMR光谱法所确定的，在通常用于糖肽脱乙酰的各种条件下，模型糖肽没有经历任何差向异构化（＜1％）或β消除。在更严格的条件下，这是除去O-苯甲酰基所必需的，β-消除作用缓慢发生，并伴有轻微（<5％）差向异构化。
• Studies directed toward the synthesis of protein-bound GPI anchor
  作者：Yasuko Tanaka、Yuko Nakahara、Hironobu Hojo、Yoshiaki Nakahara

  DOI：10.1016/s0040-4020(03)00615-x

  日期：2003.6

  Mannobioside-linked phosphoethanolamine 10, a prototype model of the GPI anchor, was synthesized via glycosidation of the monosaccharide donor and acceptor, and subsequent phosphorylation. In order to test the reactivity of the amino group involved in 10 against the activated amino acid esters, 10 was reacted with N-protected amino acid pentafluorophenyl esters in the presence of HOBt. The reactions

  通过单糖供体和受体的糖基化和随后的磷酸化，合成了甘露糖苷连接的磷酸乙醇胺10（GPI锚的原型模型）。为了测试10所涉及的氨基对活化的氨基酸酯的反应性，在HOBt的存在下使10与N-保护的氨基酸五氟苯基酯反应。反应以中等收率得到氨基酰化产物。当将Fmoc-SER-OPFP 12和Fmoc-半胱氨酸（SBU吨）-OPfp 14与进行反应10，副产物19，20和21衍生自N-和O-酰化反应。相反，用AgNO 3，HOSu和DIEA促进10和N-保护的氨基酸硫酯的反应，以提供偶联产物而没有不希望的O-酰化。在肽硫酯方法的片段偶联条件以及天然化学连接的片段偶联条件下，用合成的寡肽硫酯24和27的10的肽基化也是成功的。
• Internally quenched fluorogenic, α-helical dimeric peptides and glycopeptides for the evaluation of the effect of glycosylation on the conformation of peptides
  作者：Seema Mehta、Morten Meldal、Vito Ferro、Jens Ø. Duus、Klaus Bock

  DOI：10.1039/a607624f

  日期：——

  A panel of α-helical, dimeric coiled-coil peptides has been designed and synthesized for the evaluation of the effect of glycosylation on the conformation of these coiled-coil peptides. Two glycosylated building blocks, Nα -(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(2,3,4-tri- O-acetyl-6-azido-6-deoxy-β-D -glucopyranosyl)-L-threonine pentafluorophenyl ester 8 and Nα -(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-2,3,4-tri- O-acetyl-6-[2′-(tert -butoxycarbonylamino)benzoylamino]-6-deoxy-β-D -glucopyranosyl}-L-threonine pentafluorophenyl ester 9 containing the fluorogenic 2-aminobenzamide (Abz) group, have been synthesized. These compounds have been obtained by the glycosylation of Nα-Fmoc-Thr-OPfp with the corresponding glycosyl trichloroacetimidate donors and have been incorporated into the solid-phase synthesis of the peptides 1–3 and 7 and glycopeptides 4–6. Compounds 1 and 4–7 have been synthesized as internally quenched fluorogenic compounds where the Abz group has been employed as the fluorogenic probe and 3-nitrotyrosine Tyr(NO2) as the quenching chromophore. Steady-state fluorescence studies have provided evidence to support the dimerization of the α-helical peptides. Denaturation studies, by fluorescence as well as CD spectroscopy, indicate that the introduction of a carbohydrate moiety into the coiled-coil peptides has a significant destabilizing effect on the α-helicity.

  设计并合成了一组α-螺旋二聚体缠绕螺旋肽，以评估糖基化对这些缠绕螺旋肽构象的影响。合成了两个糖基化构建块，Nα-(荧光-9-基甲氧基碳酰基)-O-(2,3,4-三-O-乙酰-6-氮化-6-脱氧-β-D-葡萄糖吡喃糖)-L-苏氨酸五氟苯酯8和Nα-(荧光-9-基甲氧基碳酰基)-O-2,3,4-三-O-乙酰-6-[2'-(叔丁氧羰基氨基)苯甲酰氨基]-6-脱氧-β-D-葡萄糖吡喃糖}-L-苏氨酸五氟苯酯9，这些分子含有荧光基团2-氨基苯酰胺（Abz）。这些化合物是通过Nα-Fmoc-Thr-OPfp与相应的糖基三氯乙酰亚胺供体糖基化而获得的，并已整合到肽1-3和7以及糖肽4-6的固相合成中。化合物1和4-7被合成为内部猝灭荧光化合物，其中Abz基团作为荧光探针，3-硝基酪氨酸Tyr(NO2)作为猝灭颜料。稳态荧光研究提供了支持α-螺旋肽二聚化的证据。荧光及圆二色谱的变性研究表明，向缠绕螺旋肽中引入糖类基团对α-螺旋的稳定性有显著的破坏作用。
• Novel sequential solid-phase synthesis of N-linked glycopeptides from natural sources
  作者：Ernst Meinjohanns、Morten Meldal、Hans Paulsen、Raymond A. Dwek、Klaus Bock

  DOI：10.1039/a705528e

  日期：——

  In the present report a practical and versatile procedure for the solid-phase synthesis of N-linked glycopeptides from natural sources has been demonstrated. The approach is based on the mild hydrazinolysis procedure to release N-linked oligosaccharides in their intact unreduced form from the natural glycoproteins, e.g. fetuin and ribonuclease B and subsequent formation of the corresponding glycosylamines. Treatment of the reducing sugars 1–7 with a saturated solution of ammonium hydrogen carbonate in either water or dimethyl sulfoxide (DMSO) gives in almost quantitative yields the glycosylamines 8–14. Coupling of the unprotected glycosylamines 8–14 to the side-chain-activated aspartic acid derivative Fmoc-Asp(ODhbt)-OBut 16 affords the N-glycosylated asparagine derivatives 17–23. Subsequent acetylation of the carbohydrate hydroxy groups and cleavage of the tert-Bu ester by trifluoroacetic acid (TFA) treatment yields the glycosylated N-linked building blocks 31–37. The building blocks 31–37 are then incorporated into the multiple-column peptide-synthesis protocol of the glycopeptide T-cell epitope analogues 40–46 of the mouse haemoglobin-derived decapeptide Hb (67–76), VITAFNEGLK. The decapeptide sequence VITAFNEGLK binds well to the MHC Class II Ek molecule and is non-immunogenic in CBA/J mice. Syntheses of several natural and unnatural glycosylations, e.g. N-acetylglucosamine, N,N′-diacetylchitobiose, glucose, maltotriose, maltoheptose and di- and tri-antennary complex oligosaccharides on the decapeptide Hb (67–76) affording the N-linked glycopeptides 40–46 are described. The N-linked glycopeptides 40–46 have been fully characterised by 1D- and 2D-1H and 13C NMR spectroscopy and by ES-MS.

  本报告展示了一种从天然来源固相合成 N-连接糖肽的实用且多功能的方法。该方法基于温和的肼解程序，以完整的未还原形式从天然糖蛋白（如胎盘素和核糖核酸酶 B）中释放出 N-连接寡糖，随后形成相应的糖基胺。用碳酸氢铵在水或二甲基亚砜（DMSO）中的饱和溶液处理还原糖 1-7，几乎可以得到定量的糖基胺 8-14。将未受保护的糖基胺 8-14 与侧链激活的天冬氨酸衍生物 Fmoc-Asp(ODhbt)-OBut 16 偶联，可得到 N-糖基化的天冬酰胺衍生物 17-23。随后通过三氟乙酸（TFA）处理对碳水化合物羟基进行乙酰化并裂解叔丁酯，可得到糖基化的 N-连接构筑模块 31-37。然后，将这些结构单元 31-37 加入小鼠血红蛋白衍生的十肽 Hb（67-76）VITAFNEGLK 的糖肽 T 细胞表位类似物 40-46 的多柱肽合成方案中。十肽序列 VITAFNEGLK 与 MHC II 类 Ek 分子结合良好，对 CBA/J 小鼠无免疫原性。本文介绍了在十肽 Hb（67-76）上进行几种天然和非天然糖基化，如 N-乙酰葡糖胺、N,N′-二乙酰壳寡糖、葡萄糖、麦芽三糖、麦芽庚糖以及二元和三元泛酰复合寡糖，从而得到 N-连接的糖肽 40-46。通过 1D- 和 2D-1H 和 13C NMR 光谱以及 ES-MS 对 N-连接的糖肽 40-46 进行了全面鉴定。
• Dithiasuccinoyl (Dts) amino-protecting group used in syntheses of 1,2-trans-amino sugar glycosides
  作者：Ernst Meinjohanns、Morten Meldal、Hans Paulsen、Klaus Bock

  DOI：10.1039/p19950000405

  日期：——

  N-dithiasuccinoyl protecting group was easy to remove by thiolysis using 2-sulfanylethanol or dithiothreitol or reductively using sodium boranuide, thus affording, after N-acetylation, the corresponding N-acetyl-β-D-glucosamine glycosides. It has been demonstrated that it is possible to reduce the Dts group in the presence of an azido group selectively by sodium boranuide or the Dts- and the azido group simultaneously

  具有氨基官能团的N-二硫代琥珀酰（N- Dts）保护基的合适的受保护的D-葡糖胺衍生物已经以新的替代途径应用于1，2-反式-糖基化。所述ø - （3,4,6-三- ø -乙酰基-2-脱氧-2- dithiasuccinoylamino-β- d吡喃葡萄糖基）三- chloroacetimidate 7已被用于制备相应的以良好的收率由路易斯酸促进β糖苷。所述Ñ -dithiasuccinoyl保护基团是很容易通过硫解使用2- sulfanylethanol或二硫苏糖醇或还原使用boranuide钠，从而得到去除，之后Ñ-乙酰化，相应的N-乙酰基-β - D-葡糖胺糖苷。已经证明，可以在使用叠氮基的情况下，通过硼氢化钠选择性地还原Dts基团，或者通过二硫苏糖醇通过二硫苏糖醇同时还原Dts-和叠氮基团，使用二异丙基乙胺作为催化剂。构建块的合成。Ñ α -Fmoc-SER（AC 3 -β- d -GlcNDts）-OPfp