2-苄基-5,6-二羟基-嘧啶-4-羧酸甲酯 | 519032-07-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 2-苄基-5,6-二羟基-嘧啶-4-羧酸甲酯
• 英文名称: methyl 2-benzyl-5,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxylate
• 英文别名: 2-Benzyl-5,6-dihydroxy-pyrimidine-4-carboxylic acid methyl ester；methyl 2-benzyl-5-hydroxy-6-oxo-1H-pyrimidine-4-carboxylate
• CAS: 519032-07-6
• 化学式: C₁₃H₁₂N₂O₄
• 分子量: 260.249
• InChiKey: MGZAUOBOIKCIEW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  88
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 海关编码：
  2933599090
• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  室温

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-苄基-5,6-二羟基-嘧啶-4-羧酸甲酯 在 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 methyl 5-(benzoyloxy)-2-benzyl-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  N-烷基-5-羟基嘧啶酮羧酰胺作为新型抗结核药，靶向癸二烯基磷酸基-β-d-核糖2'-氧化酶的发现与结构-活性-关系研究。

  摘要：

  镁在结核分枝杆菌（Mtb）的感染中起着重要的作用，它是细胞外环境的信号，是许多酶的辅助因子，也是重要大分子中的结构元素。Raltegravir是一种抑制HIV-1整合酶的抗逆转录病毒药物，除了结合疏水口袋外，还可以通过选择性螯合活性位点镁离子来发挥其功效。为了确定是否可以以类似的方式破坏与Mtb相关的必需磷酸基转移，对带有整合酶抑制剂样药效团（N-烷基-5-羟基嘧啶酮羧酰胺）的已知分子进行了定向筛选。最初的打击提供了对Mtb具有低微摩尔效价，可接受的细胞毒性和PK特性以及强大的SAR的化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b00883
• 作为产物：
  描述：

  以 间二甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2-苄基-5,6-二羟基-嘧啶-4-羧酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  RNase H Active Site Inhibitors of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse Transcriptase: Design, Biochemical Activity, and Structural Information

  摘要：

  Pyrimidinol carboxylic acids were designed as inhibitors of HIV-1 RNase H function. These molecules can coordinate to two divalent metal ions in the RNase H active site. Inhibition of enzymatic activity was measured in a biochemical assay, but no antiviral effect was observed. Binding wits demonstrated via a solid state structure of the isolated p15-Ec domain of HIV-1 RT showing inhibitor and two Mn(II) ions bound to the RNase H active site.

  DOI：

  10.1021/jm900597q

文献信息

• Dihydroxypyrimidine carbonic acid derivatives and their use in the treatment, amelioration or prevention of a viral disease
  申请人：SAVIRA PHARMACEUTICALS GMBH

  公开号：US20140038990A1

  公开（公告）日：2014-02-06

  The present invention relates to a compound having the general formula (Di), (Dii), or (Diii), optionally in the form of a pharmaceutically acceptable salt, solvate, polymorph, codrug, cocrystal, prodrug, tautomer, racemate, enantiomer, or diastereomer or mixture thereof, which are useful in treating, ameloriating or preventing a viral disease. Furthermore, specific combination therapies are disclosed.

  本发明涉及具有一般式（Di）、（Dii）或（Diii）的化合物，可选地为药学上可接受的盐、溶剂合物、多型体、共药、共晶、前药、互变异构体、消旋体、对映体或二对映体或其混合物，这些化合物在治疗、改善或预防病毒性疾病方面是有用的。此外，还披露了特定的联合疗法。
• Dihydroxypyrimidine-4-carboxamides as Novel Potent and Selective HIV Integrase Inhibitors
  作者：Paola Pace、M. Emilia Di Francesco、Cristina Gardelli、Steven Harper、Ester Muraglia、Emanuela Nizi、Federica Orvieto、Alessia Petrocchi、Marco Poma、Michael Rowley、Rita Scarpelli、Ralph Laufer、Odalys Gonzalez Paz、Edith Monteagudo、Fabio Bonelli、Daria Hazuda、Kara A. Stillmock、Vincenzo Summa

  DOI：10.1021/jm070027u

  日期：2007.5.1

  chemotherapeutic intervention in the treatment of AIDS that has also recently been confirmed in the clinical setting. We report here on the design and synthesis of N-benzyl-5,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxamides as a class of agents which exhibits potent inhibition of the HIV-integrase-catalyzed strand transfer process. In the current study, structural modifications on these molecules were made in order

  人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）整合酶是复制所需的三种组成型病毒酶之一，是化学疗法干预AIDS的合理靶标，最近在临床环境中也得到了证实。我们在这里报告的N-苄基5,6-二羟基嘧啶-4-羧酰胺的设计和合成作为一类药物，对HIV整合酶催化的链转移过程具有有效的抑制作用。在当前的研究中，对这些分子进行了结构修饰，以检查其对HIV整合酶抑制效能的影响。该系列中最有趣的化合物之一是2- [1-（二甲基氨基）-1-甲基乙基] -N-（4-氟苄基）-5,6-二羟基嘧啶-4-羧酰胺38，CIC95为78 nM。在血清蛋白存在下进行基于细胞的测定。
• [EN] NOVEL DXR INHIBITORS FOR ANTIMICROBIAL THERAPY<br/>[FR] NOUVEAUX INHIBITEURS DE DXR POUR THÉRAPIE ANTIMICROBIENNE
  申请人：BAYLOR COLLEGE MEDICINE

  公开号：WO2011046920A1

  公开（公告）日：2011-04-21

  The present invention generally concerns particular methods and compositions for antimicrobial therapy. In particuarl embodiments, the compositions target DXR. In specific embodiments, the compositions are electron-deficient heterocyclic rings.

  本发明一般涉及特定的抗微生物治疗方法和组合物。在特定实施例中，这些组合物以DXR为靶点。在具体实施例中，这些组合物是电子亏缺的杂环环。
• 4,5-Dihydroxypyrimidine Methyl Carboxylates, Carboxylic Acids, and Carboxamides as Inhibitors of Human Cytomegalovirus pUL89 Endonuclease
  作者：Tianyu He、Tiffany C. Edwards、Jiashu Xie、Hideki Aihara、Robert J. Geraghty、Zhengqiang Wang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c00203

  日期：2022.4.14

  Human cytomegalovirus (HCMV) terminase complex entails a metal-dependent endonuclease at the C-terminus of pUL89 (pUL89-C). We report herein the design, synthesis, and characterization of dihydroxypyrimidine (DHP) acid (14), methyl ester (13), and amide (15) subtypes as inhibitors of HCMV pUL89-C. All analogs synthesized were tested in an endonuclease assay and a thermal shift assay (TSA) and subjected

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14
• [EN] DIHYDROXYPYRIMIDINE CARBOXAMIDE INHIBITORS OF HIV INTEGRASE<br/>[FR] INHIBITEURS DE L'INTEGRASE DU VIH A BASE DE DIHYDROXYPYRIMIDINE CARBOXAMIDE
  申请人：ANGELETTI P IST RICHERCHE BIO

  公开号：WO2003035076A1

  公开（公告）日：2003-05-01

  4,5-Dihydroxypyrimidine-6-carboxamides of formula (I); are described as inhibitors of HIV integrase and inhibitors of HIV replication, wherein R?1, R2, R3 and R4¿ are defined herein. These compounds are useful in the prevention and treatment of infection by HIV and in the prevention, delay in the onset, and treatment of AIDS. The compounds are employed against HIV infection and AIDS as compounds per se or in the form of pharmaceutically acceptable salts. The compounds and their salts can be employed as ingredients in pharmaceutical compositions, optionally in combination with other antivirals, immunomodulators, antibiotics or vaccines. Methods of preventing, treating or delaying the onset of AIDS and methods of preventing or treating infection by HIV are also described.

  公式为（I）的4,5-二羟基嘧啶-6-羧酰胺被描述为HIV整合酶抑制剂和HIV复制抑制剂，其中R?1，R2，R3和R4¿在此定义。这些化合物对于预防和治疗HIV感染以及预防、延迟发病和治疗艾滋病非常有用。这些化合物作为化合物本身或药物可接受的盐的形式用于对抗HIV感染和艾滋病。这些化合物及其盐可作为药物组合中的成分，可选地与其他抗病毒药物、免疫调节剂、抗生素或疫苗组合使用。还描述了预防、治疗或延迟艾滋病发病的方法以及预防或治疗HIV感染的方法。