5'-O-2,2'-O-anhydrouridine | 175013-46-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5'-O-2,2'-O-anhydrouridine
• 英文别名: (2R,3R,3aS)-2-{[(tert-butyldiphenylsilyl)oxy]methyl}3-hydroxy-2,3,3a,9a-tetrahydro-6H-furo[2’,3’:4,5]oxazole[3,2a]-pyrimidin-6-one；('5’-O-tert-butyldiphenylsilyl-2,2’-anhydrouridine)；5'-O-TBDPS-2,2'- anhydrouridine；5 inverted exclamation mark-O-TBDPS-2,2 inverted exclamation mark-anhydrouridine；(2R,4R,5R,6S)-4-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-5-hydroxy-3,7-dioxa-1,9-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-8,11-dien-10-one
• CAS: 175013-46-4
• 化学式: C₂₅H₂₈N₂O₅Si
• 分子量: 464.593
• InChiKey: LDJBSUUNUJOJTI-XBYSBRQOSA-N

物化性质

• 沸点：
  558.0±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.84
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  80.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

制备方法与用途

5'－O-TBDPS-2,2'－脱水尿苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-2,2'-O-anhydrouridine 在 吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 1-[(3aR,4R,6R,6aS)-6-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3-[(2-nitrophenyl)methoxy]-2-oxo-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]oxazol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  2'-Deoxy-2'- alkoxylaminouridines：通过2,2'- O-脱水尿苷的分子内亲核开环制备的新型2'-取代的尿苷

  摘要：

  天然和非天然修饰的核苷和核苷酸在生物学，医学和生物医学研究工具中都起着重要作用。本文报道的是开发用于在尿苷核苷的2'-位立体和区域特异性引入结构修饰的合成方法的应用。一类新的修饰核苷，即2'-烷氧基氨基-2'-脱氧尿苷，是通过将3'-拴链的烷氧基氨基甲酸酯亲核体分子内亲核加成到2'-位置，并同时打开2,2'-脱水尿苷来制备的。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(96)00870-8
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-脱水尿苷 、 叔丁基二苯基氯硅烷 在 吡啶 作用下， 反应 96.0h， 以52%的产率得到5'-O-2,2'-O-anhydrouridine
  参考文献：
  名称：

  通过改进的阿拉伯糖基-异胞嘧啶核苷的制备合成受保护的酮基-赖氨酸类似物

  摘要：

  脱水尿苷与脂族胺反应生成N-烷基异胞嘧啶，但已报道的方法通常需要非常长的反应时间，并且收率低，范围狭窄。已经开发出一种用于此类反应的改进方法，该方法使用微波辐射，从而显着减少了反应时间，并允许以克为单位轻松获得各种新型核苷。该方法已用于制备赖氨酸新类似物的前体，赖氨酸是在t RNA中发现的天然亚氨基核苷。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.9b00086

文献信息

• [EN] NUCLEIC ACID CHEMICAL MODIFICATIONS<br/>[FR] MODIFICATIONS CHIMIQUES D'ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2010101951A1

  公开（公告）日：2010-09-10

  he present invention provides nucleosides of formula (1) and oligonucleotides comprising at least on nucleoside of formula (2): Another aspect of the invention relates to a method of inhibiting the expression of a gene in cell, the method comprising (a) contacting an oligonucleotide of the invention with the cell; and (b) maintaining the cell from step (a) for a time sufficient to obtain degradation of the mRNA of the target gene.

  本发明提供了式（1）的核苷和包含至少一种式（2）核苷的寡核苷酸；发明的另一个方面涉及一种抑制细胞中基因表达的方法，该方法包括（a）将本发明的寡核苷酸与细胞接触；和（b）维持步骤（a）中的细胞足够长的时间以获得目标基因mRNA的降解。
• Novel nucleosides via intramolecular functionalization of 2,2′-anhydrouridine derivatives
  作者：Danny P.C. McGee、David P. Sebesta、Sarah S. O'Rourke、Rogelio L. Martinez、Michael E. Jung、Wolfgang A. Pieken

  DOI：10.1016/0040-4039(96)00227-4

  日期：1996.3

  The generation of novel ribonucleoside analogues derived from 2,2′-anhydrouridines by a 3′-hydroxyl directed intramolecular nucleophilic substitution of the 2′-position is described. The methodology allows for the efficient, regio- and stereoselective elaboration of the 2′-position, often under exceptionally mild reaction conditions.

  描述了通过2'-位的3'-羟基定向分子内亲核取代衍生自2,2'-脱水尿苷的新型核糖核苷类似物。该方法通常可以在非常温和的反应条件下，对2'-位进行高效，区域和立体选择性修饰。
• Nucleosides and Nucleotides. 180. Synthesis and Antitumor Activity of Nucleosides That Have a Hydroxylamino Group Instead of a Hydroxyl Group at the 2‘- or 3‘-Position of the Sugar Moiety
  作者：Akira Ogawa、Motohiro Tanaka、Takuma Sasaki、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jm980466g

  日期：1998.12.1

  The cytotoxicity of 2'-DHAC (19) and 3'-DHAC (45) against L1210 cells in vitro was reversed by the addition of cytidine, while that of 3'-dDHAC (52) was reversed by 2'-deoxycytidine. 2'-DHAC (19) and 3'-dDHAC (52) mainly inhibited DNA synthesis in L1210 cells, while 3'-DHAC (45) inhibited RNA synthesis. We also evaluated the antitumor activities of 2'-DHAC (19) and 3'-DHAC (45) against murine Meth-A fibrosarcoma

  设计和合成潜在的抗肿瘤抗代谢物2'-脱氧-2'-（羟基氨基）尿苷（15），-胞苷（19，2'-DHAC）和-腺苷（35），其区域异构体，3'-脱氧- 3'-（羟基氨基）尿苷（40）和-胞苷（45，3'-DHAC）及其2'-脱氧类似物，2'，3'-二脱氧-3'-（羟基氨基）尿苷（49）和-描述了胞苷（52，3'-dDHAC）。我们使用13C NMR光谱法分别测量了15和40中羟氨基的pKa值与pH的关系，分别为2.9和3.4。我们还发现这些核苷在中性溶液中逐渐分解，而在酸性溶液中则不分解。这种分解可能与在糖部分上的氨氧基自由基的产生有关。使用L1210和KB细胞评估了这些核苷的体外细胞毒性。2' -DHAC（19）抑制L1210和KB细胞的生长，IC50值分别为1.58和1.99 microM。3'-DHAC（45）和3'-dDHAC（52）对L1210细胞也有细胞毒性，IC50值分别为4.03和1
• EXTRAHEPATIC DELIVERY
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20220125823A1

  公开（公告）日：2022-04-28

  The invention relates to a method of gene silencing, comprising administering to a cell or a subject in need thereof a therapeutically effective amount of the lipophilic moieties-conjugated double-stranded iRNAs at one or more internal positions on at least one strand, optionally via a linker or carrier.

  本发明涉及一种基因沉默方法，包括向细胞或需要治疗的受体中给予脂溶性基团偶联的双链iRNA，在至少一条链的一个或多个内部位置上给予治疗有效量，可选地通过连接剂或载体给予。
• Synthesis of a Protected <i>keto</i>-Lysidine Analogue via Improved Preparation of <i>Arabino</i>-isoCytosine Nucleosides
  作者：Joseph B. Sweeney、Paul A. Bethel、Duncan M. Gill、Agata M. Ochocińska、Anthony E. J. Walsh、Scarlett M. Walton

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b00086

  日期：2019.4.5

  reactions has been developed, using microwave irradiation, significantly reducing reaction time and allowing facile access to a diverse range of novel nucleosides on the gram scale. The method has been used to prepare a precursor to a novel analogue of lysidine, a naturally occurring iminonucleoside found in tRNA.

  脱水尿苷与脂族胺反应生成N-烷基异胞嘧啶，但已报道的方法通常需要非常长的反应时间，并且收率低，范围狭窄。已经开发出一种用于此类反应的改进方法，该方法使用微波辐射，从而显着减少了反应时间，并允许以克为单位轻松获得各种新型核苷。该方法已用于制备赖氨酸新类似物的前体，赖氨酸是在t RNA中发现的天然亚氨基核苷。