我们报告了原子特异性13 C 修饰结构单元的合成,这些结构单元可以通过固相合成整合到 DNA 中,以促进通过 NMR 光谱研究结构和动态特征。具体而言,合成了 6- 13 C 修饰的
嘧啶和 8- 13 C
嘌呤 DNA 亚
磷酰胺,并将其掺入多聚
嘌呤束 DNA/RNA 混合双链体中,以展示使用位点特异性标记的简便共振分配。我们还研究了 mini-cTAR DNA 中的微到毫秒动力学。该 DNA 参与 HIV 复制周期,我们的数据表明发夹下茎中的交换过程在 HIV-1 核衣壳蛋白 7 存在的情况下上调。作为另一个例子,我们选择了 G-先前已证明以两个折叠形式存在的四联体。使用位点特异性 8- 13 C-2΄脱氧
鸟苷标记,我们能够在
化学位移时间尺度上验证两种形式之间的缓慢交换。在实时NMR实验中,可以监测T跳跃后倍数分布的重新平衡,产生0.012 min -1的速率。最后,我们使用13 C-ZZ