3-(α-iodo-p-tolyl)-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine | 95758-92-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-(α-iodo-p-tolyl)-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine
• 英文别名: 3-(α-iodo-4-tolyl)-3-(trifluormethyl)-3H-diazirine；3-[4-(iodomethyl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine；3-(α-iodo-4-tolyl)-3-trifluoromethyl-3H-diazirine；3-(4-(Iodomethyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine；3-[4-(iodomethyl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)diazirine
• CAS: 95758-92-2
• 化学式: C₉H₆F₃IN₂
• 分子量: 326.06
• InChiKey: NXZFAVYPSDBXKJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  24.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险类别：
  4.1
• 危险性防范说明：
  P240,P210,P241,P264,P280,P302+P352,P370+P378,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313
• 危险品运输编号：
  1325
• 危险性描述：
  H315,H319,H228
• 包装等级：
  II
• 储存条件：
  存储于阴凉处，无氧环境中，温度保持在2-8℃。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(α-iodo-p-tolyl)-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine 在 sodium carbonate 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 生成 N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-4-[3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl]-L-phenylalanine
  参考文献：
  名称：

  SN-（9-芴基甲氧基羰基）-4'-（1-azi-2,2,2-三氟乙基）苯丙氨酸的有效途径

  摘要：

  描述了光学上可光活化的苯丙氨酸衍生物1的极其有效的合成。关键步骤涉及手性甘氨酸等效物的高度非对映选择性烷基化。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)60743-8
• 作为产物：
  描述：

  O-叔-丁基二甲基硅烷基-苄醇4-(2,2,2-三氟乙烷酮) 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸羟胺 、 四丁基氟化铵 、 甲基三苯氧基碘磷 、 氨 、 N,N-二异丙基乙胺 、 silver(l) oxide 作用下， 反应 6.0h， 生成 3-(α-iodo-p-tolyl)-3-(trifluoromethyl)-3H-diazirine
  参考文献：
  名称：

  SN-（9-芴基甲氧基羰基）-4'-（1-azi-2,2,2-三氟乙基）苯丙氨酸的有效途径

  摘要：

  描述了光学上可光活化的苯丙氨酸衍生物1的极其有效的合成。关键步骤涉及手性甘氨酸等效物的高度非对映选择性烷基化。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)60743-8

文献信息

• Synthesis of highly functionalized oligobenzamide proteomimetic foldamers by late stage introduction of sensitive groups
  作者：George M. Burslem、Hannah F. Kyle、Panchami Prabhakaran、Alexander L. Breeze、Thomas A. Edwards、Stuart L. Warriner、Adam Nelson、Andrew J. Wilson

  DOI：10.1039/c6ob00078a

  日期：——

  compounds that can be used to access mimetics that are challenging to synthesize using previously described methodologies, permitting access to compounds functionalized with multiple sensitive side chains and accelerated library assembly through late stage derivatisation.

  α-螺旋蛋白质模拟物代表了一类新兴的配体，可用于抑制一系列螺旋介​​导的蛋白质-蛋白质相互作用。在此类抑制剂中，芳香族低聚苯甲酰胺折叠体已被广泛且成功地使用。本手稿描述了这些化合物的替代合成方法，可用于获取使用先前描述的方法合成具有挑战性的模拟物，从而允许获取具有多个敏感侧链的功能化化合物，并通过后期衍生化加速文库组装。
• Mapping the Orthosteric Binding Site of the Human 5-HT₃ Receptor Using Photo-cross-linking Antagonists
  作者：Thomas Jack、Michele Leuenberger、Marc-David Ruepp、Sanjeev Kumar V. Vernekar、Andrew J. Thompson、Sophie Braga-Lagache、Manfred Heller、Martin Lochner

  DOI：10.1021/acschemneuro.8b00327

  日期：2019.1.16

  Ligand binding poses in the orthosteric binding site have been largely predicted from mutagenesis and docking studies. We report the synthesis of a series of photo-cross-linking compounds whose structures are based on the clinically used antiemetic drug granisetron (Kytril). These displaced [3H]granisetron from the orthosteric binding site with low nanomolar affinities and showed specific photo-cross-linking

  5-羟色胺门控 5-HT3 受体是一种配体门控离子通道。它位于中枢和周围神经系统的突触处，使其成为主要的药理学靶点，例如，用于以高亲和力结合神经递质结合位点并阻止通道打开的止吐药物。结构生物学技术的进步导致公开的三维受体结构激增；然而，迄今为止尚未实现解决配体结合的高分辨率 5-HT3 受体结构。正构结合位点中的配体结合位点已在很大程度上从诱变和对接研究中预测。我们报告了一系列光交联化合物的合成，其结构基于临床使用的止吐药格拉司琼 (Kytril)。这些以低纳摩尔亲和力从正构结合位点置换的[3H]格拉司琼并显示出与人5-HT3受体的特异性光交联。通过蛋白质-MS/MS 进行的详细分析确定了结合环 C 尖端附近的一个残基 (Met-228) 作为共价修饰位点。
• Polyunsaturated fatty acids inhibit a pentameric ligand-gated ion channel through one of two binding sites
  作者：Noah M Dietzen、Mark J Arcario、Lawrence J Chen、John T Petroff、K Trent Moreland、Kathiresan Krishnan、Grace Brannigan、Douglas F Covey、Wayland WL Cheng

  DOI：10.7554/elife.74306

  日期：——

  receptor. Using photo-affinity labeling and coarse-grained molecular dynamics simulations, we identified two fatty acid binding sites in the outer transmembrane domain (TMD) of ELIC. Fatty acid binding to the photolabeled sites is selective for DHA over palmitic acid, and specific for an agonist-bound state. Hexadecyl-methanethiosulfonate modification of one of the two fatty acid binding sites in the outer

  多不饱和脂肪酸 (PUFA) 可抑制五聚配体门控离子通道 (pLGIC)，但其抑制机制尚不清楚。PUFA，二十二碳六烯酸 (DHA)，比棕榈酸更有效地抑制 pLGIC、ELIC 的激动剂反应，类似于在 GABA A中观察到的效果受体和烟碱型乙酰胆碱受体。使用光亲和标记和粗粒度分子动力学模拟，我们确定了 ELIC 的外跨膜结构域 (TMD) 中的两个脂肪酸结合位点。与光标记位点结合的脂肪酸对 DHA 的选择性高于棕榈酸，并且对激动剂结合状态具有特异性。外部 TMD 中两个脂肪酸结合位点之一的十六烷基-甲硫代磺酸盐修饰概括了 PUFA 在 ELIC 中的抑制作用。结果表明，DHA 选择性地与 ELIC 的外部 TMD 中的多个位点结合，但与单个亚基内位点的状态依赖性结合介导了 ELIC 的 DHA 抑制。
• Trifluoromethyldiazirine: an effective photo-induced cross-linking probe for exploring amyloid formation
  作者：David P. Smith、Jon Anderson、Jeffrey Plante、Alison E. Ashcroft、Sheena E. Radford、Andrew J. Wilson、Martin J. Parker

  DOI：10.1039/b813504e

  日期：——

  The separative and analytical power of ion mobility spectrometry-mass spectrometry combined with photo-induced cross-linking of site-specifically incorporated trifluoromethyldiazirine provides a powerful approach towards structural characterisation of amyloid fibrils.

  离子迁移谱-质谱法的分离和分析能力与光诱导交联的特定位点三氟甲基二氮丙啶相结合，为淀粉样纤维的结构表征提供了一种强有力的方法。
• Validation of Trifluoromethylphenyl Diazirine Cholesterol Analogues As Cholesterol Mimetics and Photolabeling Reagents
  作者：Kathiresan Krishnan、Mingxing Qian、McKenna Feltes、Zi-Wei Chen、Sarah Gale、Lei Wang、Yusuke Sugasawa、David E. Reichert、Jean E. Schaffer、Daniel S. Ory、Alex S. Evers、Douglas F. Covey

  DOI：10.1021/acschembio.1c00364

  日期：2021.8.20

  in photolabeling efficiencies and residues identified. Photolabeling of mammalian (HEK) cell membranes demonstrated differences in the pattern of proteins labeled by the two classes of probes. Collectively, these date indicate that cholesterol photoaffinity labeling reagents containing an aliphatic diazirine or TPD group provide complementary information and will both be useful tools in future studies

  胆固醇的脂肪族二氮丙啶类似物以前已被用于详细说明胆固醇蛋白质组并确定蛋白质上的胆固醇结合位点。含有三氟甲基苯基二氮丙啶 (TPD) 基团的胆固醇类似物尚未见报道。两类二氮丙啶都已准备好用于神经类固醇光标记研究，它们的组合使用提供了单独使用任一二氮丙啶类都无法获得的信息。因此，我们准备了胆固醇TPD类似物，并用它们与先前报告的脂族二吖丙因类似物作为光亲和标记试剂一起以获得关于胆固醇结合五聚体的位点的附加信息Gloeobacter配体门控离子通道 (GLIC)。我们首先验证了 TPD 类似物作为胆固醇替代品，并将它们的作用与先前报道的脂肪族二氮丙啶在细胞培养试验中的作用进行了比较。所有探针都与 GLIC 上的相同胆固醇结合位点结合，但在光标记效率和识别的残留物方面存在差异。哺乳动物 (HEK) 细胞膜的光标记表明两类探针标记的蛋白质模式存在差异。总的来说，这些日期表明含有脂肪族二氮丙啶或 TPD