N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine benzhydryl ester hydrochloride

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine benzhydryl ester hydrochloride
• 英文别名: N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine diphenylmethyl ester hydrochloride；diphenylmethyl (S)-3-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]amino-3-phenylpropionate hydrochloride；benzhydryl (3S)-3-[[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]amino]-3-phenylpropanoate;hydrochloride
• 化学式: C₂₈H₃₂N₂O₇*ClH
• 分子量: 545.032
• InChiKey: TWMXOJSXBYQRPM-UJCRVVIVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.74
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  164
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine benzhydryl ester hydrochloride 在 palladium on activated charcoal N-羟基丁二酰亚胺 、 氢气 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (S)-3-[(2S,3R,4R,5S)-2,3,4,6-tetrahydroxy-5-(L-valyl)aminohexanoyl]amino-3-phenylpropionic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Anti-Helicobacter pylori Activity of Pyloricidin Derivatives. I. Structure-activity Relationships on the Terminal Peptidic Moiety.

  摘要：

  新型天然抗生素喷菌素A、B和C对幽门螺杆菌具有强效且高度选择性的抗菌活性。为了研究末端肽部分的结构-活性关系，制备了一系列含不同氨基酸的喷菌素B和喷菌素C衍生物，并评估了它们的抗幽门螺杆菌活性。含有α-D-、β-和γ-氨基酸或肽模拟物的衍生物显示出显著降低的活性。另一方面，含有α-L-氨基酸的衍生物被发现能保持活性。在本工作中制备的衍生物中，烯丙基甘氨酸衍生物2s表现出最强的抗幽门螺杆菌活性，对幽门螺杆菌NCTC11637的最低抑制浓度（MIC）值小于0.006μg/ml，比原始化合物喷菌素C的活性高出60倍。

  DOI：

  10.7164/antibiotics.55.322
• 作为产物：
  描述：

  二苯基重氮甲烷 、 N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine 在 盐酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.5h， 以97%的产率得到N-[(2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl]-β-D-phenylalanine benzhydryl ester hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  幽门螺杆菌衍生物的合成及其抗幽门螺杆菌活性 二肽部分中氨基酸残基的组合及其对抗幽门螺杆菌活性的影响。

  摘要：

  新型天然抗菌素pyloricidin A，B和C，由常见的（2S，3R，4R，5S）-5-氨基-2,3,4,6-四羟基己酰基-β-D-苯丙氨酸部分和末端肽部分组成（pyloricidin A：L-缬氨酸-L-缬氨酸-L-亮氨酸； pyloricidin B：L-缬氨酸-L-亮氨酸； pyloricidin C：L-亮氨酸），具有有效且高度选择性的抗幽门螺杆菌活性。为了开发更有效的化合物并研究与肽的组合有关的肽部分的结构活性关系，制备了具有各种二肽部分的一系列衍生物，并评估了它们的抗-H。幽门螺杆菌活动。发现该部分中两个氨基酸的结合对活性有显着影响。具有Nva-Abu的化合物显示出优异的抗H值。幽门螺杆菌活性，MIC值为0。相对于幽门螺杆菌TN2为013微克/毫升。此外，发现该化合物在重复口服（10 mg / kg，中标7天）后，可从感染的蒙古沙鼠中清除60％的幽门螺杆菌。

  DOI：

  10.7164/antibiotics.55.499

文献信息

• Polyol-amino acid compounds having anti-helicobacter pylori activity
  申请人：Takeda Chemical Industries, Inc.

  公开号：US06423869B1

  公开（公告）日：2002-07-23

  A compound of the formula (I): wherein R1 represents an amino group which may be substituted; R2 represents a carboxy group which may be esterified or amidated; R3, R4, R5 and R6 each represent a hydroxy group which may be protected; Q represents an aryl group which may be substituted; or a salt thereof is disclosed. The compound (I) possesses ant-Helicobacter pylori activity, and is useful in the prevention or treatment of various diseases associated with Helicobacter bacteria, such as duodenal ulcer, gastric ulcer, chronic gastritis and cancer of the stomach.

  公式（I）的化合物如下： 其中R1代表可能被取代的氨基团；R2代表可能被酯化或酰胺化的羧基团；R3、R4、R5和R6分别代表可能被保护的羟基团；Q代表可能被取代的芳基团；或其盐。该化合物（I）具有抗幽门螺杆菌活性，并可用于预防或治疗与幽门螺杆菌相关的各种疾病，如十二指肠溃疡、胃溃疡、慢性胃炎和胃癌。
• Synthesis and Anti-Helicobacter pylori Activity of Pyloricidin Derivatives. II. The Combination of Amino Acid Residues in the Dipeptidic Moiety and its Effect on the Anti-Helicobacter pylori Activity.
  作者：ATSUSHI HASUOKA、YUJI NISHIKIMI、YUTAKA NAKAYAMA、KEIJI KAMIYAMA、MASAFUMI NAKAO、KEN-ICHIRO MIYAGAWA、OSAMU NISHIMURA、MASAHIKO FUJINO

  DOI：10.7164/antibiotics.55.499

  日期：——

  The novel natural antibiotics pyloricidin A, B and C, consisting of a common (2S,3R,4R,5S)-5-amino-2,3,4,6-tetrahydroxyhexanoyl-beta-D-phenylalanine moiety and a terminal peptidic moiety (pyloricidin A: L-valine-L-valine-L-leucine; pyloricidin B: L-valine-L-leucine; pyloricidin C: L-leucine), exhibit potent and highly selective anti-Helicobacter pylori activity. In order to develop more potent compounds

  新型天然抗菌素pyloricidin A，B和C，由常见的（2S，3R，4R，5S）-5-氨基-2,3,4,6-四羟基己酰基-β-D-苯丙氨酸部分和末端肽部分组成（pyloricidin A：L-缬氨酸-L-缬氨酸-L-亮氨酸； pyloricidin B：L-缬氨酸-L-亮氨酸； pyloricidin C：L-亮氨酸），具有有效且高度选择性的抗幽门螺杆菌活性。为了开发更有效的化合物并研究与肽的组合有关的肽部分的结构活性关系，制备了具有各种二肽部分的一系列衍生物，并评估了它们的抗-H。幽门螺杆菌活动。发现该部分中两个氨基酸的结合对活性有显着影响。具有Nva-Abu的化合物显示出优异的抗H值。幽门螺杆菌活性，MIC值为0。相对于幽门螺杆菌TN2为013微克/毫升。此外，发现该化合物在重复口服（10 mg / kg，中标7天）后，可从感染的蒙古沙鼠中清除60％的幽门螺杆菌。
• Synthesis and Anti-Helicobacter pylori Activity of Pyloricidin Derivatives. I. Structure-activity Relationships on the Terminal Peptidic Moiety.
  作者：ATSUSHI HASUOKA、YUJI NISHIKIMI、YUTAKA NAKAYAMA、KEIJI KAMIYAMA、MASAFUMI NAKAO、KEN-ICHIRO MIYAGAWA、OSAMU NISHIMURA、MASAHIKO FUJINO

  DOI：10.7164/antibiotics.55.322

  日期：——

  The novel natural antibiotics pyloricidin A, B and C possess potent and highly selective antibacterial activity against Helicobacter pylori. In order to investigate the structure activity relationships for the terminal peptidic moiety, a series of pyloricidin B and pyloricidin C derivatives, bearing various amino acids in the moiety, were prepared and evaluated for their anti-H. pylori activity. The derivatives bearing α-D-, β- and γ-amino acids or peptidemimetics showed drastically decreased activity. On the other hand, the derivatives with α-L-amino acids were found to maintain the activity. Among the derivatives prepared in this work, the allylglycine derivative 2s showed the most potent anti-H. pylori activity, with an MIC value of less than 0.006μg/ml against H. pylori NCTC11637, which is 60-fold greater than the activity of the lead compound pyloricidin C.

  新型天然抗生素喷菌素A、B和C对幽门螺杆菌具有强效且高度选择性的抗菌活性。为了研究末端肽部分的结构-活性关系，制备了一系列含不同氨基酸的喷菌素B和喷菌素C衍生物，并评估了它们的抗幽门螺杆菌活性。含有α-D-、β-和γ-氨基酸或肽模拟物的衍生物显示出显著降低的活性。另一方面，含有α-L-氨基酸的衍生物被发现能保持活性。在本工作中制备的衍生物中，烯丙基甘氨酸衍生物2s表现出最强的抗幽门螺杆菌活性，对幽门螺杆菌NCTC11637的最低抑制浓度（MIC）值小于0.006μg/ml，比原始化合物喷菌素C的活性高出60倍。