4-((2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)amino)-4-oxobutanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 4-((2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)amino)-4-oxobutanoic acid
• 英文别名: 4-((2-(2-((6-Chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)amino)-4-oxobutanoic acid；4-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethylamino]-4-oxobutanoic acid
• 化学式: C₁₄H₂₆ClNO₅
• 分子量: 323.817
• InChiKey: IQTNPKHPETVRCU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-((2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)amino)-4-oxobutanoic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 (2S,5S,8S,11S)-2-benzyl-35-chloro-11-(3-guanidinopropyl)-5-(hydroxymethyl)-8-isopropyl-4,7,10,13,19,22-hexaoxo-15,26,29-trioxa-3,6,9,12,18,23-hexaazapentatriacontan-1-oic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] Phosphatase Binding Compounds and Methods of Using Same
  [FR] COMPOSÉS DE LIAISON À LA PHOSPHATASE ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION

  摘要：

  本发明提供了能够高效去磷酸化特定磷酸激活靶蛋白的双功能化合物。这些靶蛋白可以是与疾病或紊乱途径有关的任何蛋白质，比如但不限于癌症、神经退行性疾病、代谢性疾病、糖尿病、胰岛素抵抗等。

  公开号：

  WO2020146470A1
• 作为产物：
  描述：

  1-溴-6-氯己烷 在 4-二甲氨基吡啶 、 三氟乙酸 作用下， 以 乙醚 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 4-((2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)amino)-4-oxobutanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Photoactivatable trimethoprim-based probes for spatiotemporal control of biological processes

  摘要：

  DOI：

  10.1016/bs.mie.2020.03.015

文献信息

• Oligomers of Cyclic Oligochalcogenides for Enhanced Cellular Uptake
  作者：Rémi Martinent、Dongchen Du、Javier López‐Andarias、Naomi Sakai、Stefan Matile

  DOI：10.1002/cbic.202000630

  日期：2021.1.5

  dimers of dimers: Efficient thiol‐mediated cytosolic delivery with monomeric COCs (cyclic oligochalcogenides) called for the introduction of COC oligomers. The results from a comprehensive collection of trifunctional monomers, dimers and trimers of asparagusic, lipoic and diselenolipoic acid imply that in the best COC oligomers, COCs might work together, over short and long distances.

  二聚体的 COC 二聚体中的累积协同作用：有效的硫醇介导的细胞溶质递送与单体 COC（环状低聚硫属元素化物）需要引入 COC 低聚物。来自芦笋酸、硫辛酸和二硒硫辛酸的三官能单体、二聚体和三聚体的综合集合的结果表明，在最好的 COC 低聚物中，COC 可能在短距离和长距离内协同工作。
• Photocleavable Fluorescent Membrane Tension Probes: Fast Release with Spatiotemporal Control in Inner Leaflets of Plasma Membrane, Nuclear Envelope, and Secretory Pathway
  作者：Javier López‐Andarias、Krikor Eblighatian、Quentin T. L. Pasquer、Lea Assies、Naomi Sakai、Sascha Hoogendoorn、Stefan Matile

  DOI：10.1002/anie.202113163

  日期：2022.1.3

  Open, dynamic, and elusive membrane motifs are labeled without chemical or physical interference to image their order and tension in living cells: Fast release with light from specific targets liberates the original small-molecule flipper probe in the innermost leaflet of the nuclear envelope, the inner leaflet of the plasma membrane, or along the secretory pathway to address current questions of biological

  开放、动态且难以捉摸的膜基序在没有化学或物理干扰的情况下进行标记，以成像它们在活细胞中的顺序和张力：特定目标的光快速释放释放核膜最内层小叶中的原始小分子鳍状探针，即质膜的内部小叶，或沿着分泌途径，以解决当前具有生物学意义的问题。
• Uncoupling the Folding-Function Paradigm of Lytic Peptides to Deliver Impermeable Inhibitors of Intracellular Protein–Protein Interactions
  作者：Stephen E. Miller、Kohei Tsuji、Rachel P.M. Abrams、Terrence R. Burke、Joel P. Schneider

  DOI：10.1021/jacs.0c07921

  日期：2020.11.25

  clinical translation. For most linear MLPs, a prerequisite for membrane activity is their folding at cell surfaces. Modification of their backbone with N-methyl amides inhibits folding, which directly correlates to a reduction in lytic potential but only minimally affects cell entry. We synthesized a library of N-methylated peptides derived from MLPs and conducted structure-activity studies that demonstrated

  在这里，我们描述了使用肽主链 N-甲基化作为将膜溶解肽（MLP）转化为细胞相容性细胞内递送载体的新策略。裂解肽与细胞膜结合的能力已被用于药物递送，将不可渗透的货物携带到细胞中，但其固有的毒性导致治疗窗口狭窄，限制了其临床转化。对于大多数线性 MLP，膜活性的先决条件是它们在细胞表面的折叠。用 N-甲基酰胺对其主链进行修饰会抑制折叠，这与裂解电位的降低直接相关，但对细胞进入的影响很小。我们合成了源自 MLP 的 N-甲基化肽库，并进行了结构活性研究，证明了该方法在不同二级结构（包括 β-折叠肽和螺旋形成肽）中的广泛实用性。我们的策略的重点是提供一类众所周知的困难的蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂，这些抑制剂在细胞内显示出靶向活性。
• Macropinocytosis as a Key Determinant of Peptidomimetic Uptake in Cancer Cells
  作者：Daniel Y. Yoo、Stephanie A. Barros、Gordon C. Brown、Christian Rabot、Dafna Bar-Sagi、Paramjit S. Arora

  DOI：10.1021/jacs.0c02109

  日期：2020.8.26

  Peptides and peptidomimetics represent the middle space between small molecules and large proteins-they retain the relatively small size and synthetic accessibility of small molecules while providing high binding specificity for biomolecular partners typically observed with proteins. During the course of our efforts to target intracellular protein-protein interactions in cancer, we observed that the

  肽和肽模拟物代表小分子和大蛋白质之间的中间空间——它们保留了小分子相对较小的尺寸和合成可及性，同时为通常在蛋白质中观察到的生物分子伙伴提供了高结合特异性。在我们针对癌症中细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的努力过程中，我们观察到肽的细胞摄取是由细胞系特异性决定的，我们注意到肽在具有增强的巨胞饮指数的癌细胞中显示出更好的摄取。在这里，我们描述了不同类别的构象稳定肽对细胞渗透的分析结果。我们测试了线性肽、肽大环、稳定螺旋、β-发夹肽、和 11 种不同细胞系中的交联螺旋二聚体。这些构象定义的构建体的有效吸收与每个细胞系的巨胞饮活性直接相关：在某些信号通路突变的细胞中观察到化合物的高吸收。值得注意的是，该研究表明，受限肽遵循与巨胞饮细胞中蛋白质相同的摄取机制，但与蛋白质不同的是，肽模拟物可以很容易地设计成抵抗变性和蛋白水解降解。我们的研究结果通过设计的肽模拟物扩展了目前对癌细胞细胞摄取的理解，并表明具有
• Cell Penetration Profiling Using the Chloroalkane Penetration Assay
  作者：Leila Peraro、Kirsten L. Deprey、Matthew K. Moser、Zhongju Zou、Haydn L. Ball、Beth Levine、Joshua A. Kritzer

  DOI：10.1021/jacs.8b06144

  日期：2018.9.12

  poor cell penetration. High-throughput cell penetration assays are required for the optimization of biotherapeutics for enhanced cell penetration. We developed a HaloTag-based assay called the chloroalkane penetration assay (CAPA), which is quantitative, high-throughput, and compartment-specific. We demonstrate the ability of CAPA to profile extent of cytosolic penetration with respect to concentration

  生物治疗药物是药物发现中一类很有前途的分子，但由于细胞渗透性差，它们通常仅限于细胞外靶点。优化生物治疗药物以增强细胞渗透需要高通量细胞渗透测定。我们开发了一种基于 HaloTag 的测定法，称为氯烷渗透测定法 (CAPA)，它是定量、高通量且针对隔室的。我们证明了 CAPA 能够根据浓度、血清存在、温度和时间来分析细胞质渗透程度。我们还使用 CAPA 研究生物活性钉合肽和与细胞穿透序列融合的肽的结构-渗透关系。 CAPA 不仅限于测量细胞质渗透。使用 HaloTag 定位于细胞核的细胞系，我们展示了核穿透的定量测量。展望未来，CAPA 将成为测量和优化生物治疗药物细胞渗透的一种有价值的方法。