7-(3-fluoropyridin-4-yl)-3H-imidazol[4,5-b]pyridin-2-amine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: 7-(3-fluoropyridin-4-yl)-3H-imidazol[4,5-b]pyridin-2-amine
• 英文别名: 7-(3-fluoranylpyridin-4-yl)-1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine；7-(3-fluoropyridin-4-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine
• 化学式: C₁₁H₈FN₅
• 分子量: 229.216
• InChiKey: AYORLAGKWMLGEX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  80.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-氟吡啶 在 正丁基锂 、 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 sodium carbonate 、 二异丙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 水 、 甲苯 为溶剂， -60.0~90.0 ℃ 、500.01 kPa 条件下， 反应 102.0h， 生成 7-(3-fluoropyridin-4-yl)-3H-imidazol[4,5-b]pyridin-2-amine
  参考文献：
  名称：

  通过结合位点类比进行配体重靶向

  摘要：

  DNA修复酶MutT同源物1（MTH1）是广泛肿瘤的潜在靶标。它的底物结合位点具有天冬氨酸的非催化对，类似于天冬氨酸蛋白酶的催化二元组。我们假设尽管这两种酶具有不同的底物并催化不同的反应，但后者的抑制剂可能会重新靶向MTH1。我们从全天冬氨酸蛋白酶的晶体结构中选择了将近350种抑制剂进行计算机筛选的库。通过基于力场的能量与连续介电溶剂化，通过对接和评分确定了三个碎片命中。这些片段在比色测定（MW）中显示出良好的配体效率<300达和IC 50<50 μ M）。进行分子动力学模拟以确定最有利的相互作用模式。根据模拟结果，我们在体外评估了7种市售化合物，其中2种显示出MTH1的亚微摩尔效价。以获得预测的结合模式的确切的证据，我们解决了所预测的10抑制剂的5晶体结构，在硅片。命中优化的最后一步由蛋白质晶体学指导，涉及单个化合物铅11的合成，在两次正交结合试验中显示出对MTH1的纳摩尔亲和力，相对于

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.04.037

文献信息

• Ligand retargeting by binding site analogy
  作者：Lars Wiedmer、Claude Schärer、Dimitrios Spiliotopoulos、Marianne Hürzeler、Paweł Śledź、Amedeo Caflisch

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.04.037

  日期：2019.8

  substrate binding site features a non-catalytical pair of aspartic acids which resembles the catalytic dyad of aspartic proteases. We hypothesized that inhibitors of the latter might be re-targeted for MTH1 despite the two enzyme classes having different substrates and catalyze different reactions. We selected from the crystal structures of holo aspartic proteases a library of nearly 350 inhibitors for in

  DNA修复酶MutT同源物1（MTH1）是广泛肿瘤的潜在靶标。它的底物结合位点具有天冬氨酸的非催化对，类似于天冬氨酸蛋白酶的催化二元组。我们假设尽管这两种酶具有不同的底物并催化不同的反应，但后者的抑制剂可能会重新靶向MTH1。我们从全天冬氨酸蛋白酶的晶体结构中选择了将近350种抑制剂进行计算机筛选的库。通过基于力场的能量与连续介电溶剂化，通过对接和评分确定了三个碎片命中。这些片段在比色测定（MW）中显示出良好的配体效率<300达和IC 50<50 μ M）。进行分子动力学模拟以确定最有利的相互作用模式。根据模拟结果，我们在体外评估了7种市售化合物，其中2种显示出MTH1的亚微摩尔效价。以获得预测的结合模式的确切的证据，我们解决了所预测的10抑制剂的5晶体结构，在硅片。命中优化的最后一步由蛋白质晶体学指导，涉及单个化合物铅11的合成，在两次正交结合试验中显示出对MTH1的纳摩尔亲和力，相对于