benzyl 2-(1-methylhydrazinyl)acetate | 55501-33-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl 2-(1-methylhydrazinyl)acetate
• 英文别名: Benzyl 2-(N-methylhydrazino)acetate；benzyl (1-methylhydrazino)acetate；benzyl 1-(methylhydrazino)acetate；benzyl (1-methylhydrazino)acetat；benzyl(1-methylhydrazinoacetate)；benzyl 1-methylhydrazinoacetate；Benzyl 2-[amino(methyl)amino]acetate
• CAS: 55501-33-2
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₂
• 分子量: 194.233
• InChiKey: MINBDNRKQVHNBK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  55.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl 2-(1-methylhydrazinyl)acetate 在 氢氟酸 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 {N'-[(3R,5S)-6-Azido-5-hydroxy-3-((4S,5R)-2-oxo-4,5-diphenyl-oxazolidin-3-yl)-hexanoyl]-N-methyl-hydrazino}-acetic acid benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  Palladium(II)-assisted difunctionalization of monoolefins: total synthesis of (+)-negamycin and (-)-5-epi-negamycin

  摘要：

  (+)-内加霉素和(-)-5-表内加霉素的合成过程包括以下步骤：首先，对具有光学活性的烯基碳酸酯进行钯(II)辅助的烷基化反应，随后将其与三烷基乙烯基锡进行羰基化偶联反应。(+)-内加霉素的合成共需15步，总产率为13%。而(-)-5-表内加霉素的合成则在12步内完成，总产率为20%。在制备这些化合物的过程中，还实现了不对称还原反应中的高度非对映选择性酮的还原，以及高效的分子内Mitsunobu反应的实施。

  DOI：

  10.1021/jo00069a012
• 作为产物：
  描述：

  benzyl (2-tert-butoxycarbonyl-1-methylhydrazino)acetate 在 三氟乙酸 作用下， 生成 benzyl 2-(1-methylhydrazinyl)acetate
  参考文献：
  名称：

  肽类似物合成的新构件：减少的二氮杂-β3-二肽

  摘要：

  N-保护的氮杂-β3-氨基酯的还原和醇的氧化得到氮杂-β3-氨基醛。未保护的氮杂-β 3 -氨基酯缩合为所得醛-非天​​然低聚物是设计用于模拟肽和其他生物聚合物并提高其生物利用度的合成化合物。1 在过去十年中，这些化合物已成为药物发现和构象分析的重要研究目标。因此，对具有确定序列的低聚物的固相合成的研究正在激增。通过重复相同类型的偶联反应，可以在载体上形成精心设计的低聚物。它们可以具有化学上不同的侧链，但它们需要具有非蛋白水解不稳定的酰胺键。一类不可水解的肽是还原肽。2肽核酸（PNA），它是一种 DNA 类似物（磷酸二酯骨架已被假肽骨架取代），由氨基乙基甘氨酸单元或还原的二肽骨架构成的骨架组成（图 1），这使得它们在生物体液中非常稳定。3 尽管它对细胞酶（如核酸酶和蛋白酶）具有抗性，但混淆其应用的主要限制是在水性介质中溶解度差，细胞摄取效率低，这是由于不带电的骨架和结合方向选择性的模糊性。

  DOI：

  10.1055/s-2005-917100

文献信息

• COMPOUND HAVING READ-THROUGH ACTIVITY
  申请人：THE UNIVERSITY OF TOKYO

  公开号：US20140364642A1

  公开（公告）日：2014-12-11

  [Problem] Provision of a novel compound having read-through activity and a drug for the treatment of nonsense mutation-type disease containing this compound. [Solution] A compound represented by the following general formula (1): and a pharmaceutical composition containing this compound.

  一种具有读穿活性的新化合物以及包含该化合物的用于治疗无义突变型疾病的药物。 一种由以下一般式（1）表示的化合物： 以及含有该化合物的药物组合物。
• Structure–Activity Relationship Studies of 3-<i>epi</i>-Deoxynegamycin Derivatives as Potent Readthrough Drug Candidates
  作者：Keisuke Hamada、Akihiro Taguchi、Masaya Kotake、Suguru Aita、Saori Murakami、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.5b00121

  日期：2015.6.11

  (+)-Negamycin (1), a natural dipeptidic antibiotic bearing a hydrazide structure, exhibits a readthrough activity toward the nonsense mutation of the dystrophin gene and restores dystrophin expression in muscles of Duchenne muscular dystrophy model mdx mice. Herein to develop more potent readthrough compounds, we performed a structure activity relationship (SAR) study of 3-epi-deoxynegamycin (2), which is also another natural readthrough compound with little antimicrobial activity, focusing on the main carbon chain length. We found that one carbon atom shorter derivative 9b shows a higher readthrough activity than 1 and 2. Further derivatization at the carboxylic acid part of 9b demonstrates that its meta-chlorobenzyl ester derivative 17e, which has a higher ClogP value, exhibits a more potent readthrough activity than 9b. Interestingly, in the cell-free protein expression system, the readthrough activity of 17e drastically decreases compared to that in the cell-based assay. These results suggest that benzyl ester-type derivatives enhance the hydrophobicity and function as prodrugs to produce active compound 9b in living cell systems.

  (+)奈加霉素(1)为一种带有肼结构的天然二肽类抗生素,对 dystrophin 基因的无义突变具有通读活性,并在杜兴氏肌肉营养不良症模型 md x 小鼠肌肉中恢复 dystrophin 的表达。为了开发更有效的通读化合物,我们对携带少量抗微生物活性的另一种天然通读化合物 3-表脱氧奈加霉素(2)进行了结构活性关系研究,侧重于主碳链长度的研究。我们发现比(1)和(2)少一个碳原子的衍生物 9b 拥有更高的通读活性。进一步对 9b 的羧酸部分进行衍化发现,它的邻氯苯甲酯衍生物17e 具有更高的 ClogP 值,17e 的通读活性比 9b 更强。有趣的是,在细胞自由蛋白表达系统中,17e 的通读活性相比于细胞基的测定有着大幅下降。这些结果表明,苯甲酯类衍生物提高了疏水性,并作为前药在活细胞体系中生成具有活性的化合物9b。
• A total synthesis of (+)-negamycin through isoxazolidine allylation
  作者：Roderick W. Bates、Rab'iah Nisha Khanizeman、Hajime Hirao、Yu Shan Tay、Patcharaporn Sae-Lao

  DOI：10.1039/c4ob00537f

  日期：——

  The β-amino acid antibiotic (+)-negamycin has been synthesised in ten steps from epichlorohydrin via Sakurai allylation of an isoxazolidine intermediate. The key allylation reaction proceeded with complete trans-selectivity, which is attributed to electrostatic attraction between the chlorine atom and the iminium ion in the Sakurai intermediate.

  β-氨基酸抗生素（+）-内伽霉素已通过十个步骤从环氯丙烷合成，过程中采用了对异噁唑烷中间体的Sakurai烯基化反应。关键的烯基化反应以完全的反式选择性进行，这归因于氯原子与Sakurai中间体中的亚胺离子之间的静电吸引。
• Enantioselective total synthesis of (+)-negamycin
  作者：David Tanner、Peter Somfai

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)86063-3

  日期：1988.1

  An efficient enantioselective total synthesis of the antibiotic (+)-negamycin is described, the absolute stereochemistry deriving from (R)-(+)-malic acid and subsequent use of the Sharpless asymmetric epoxidation reaction.

  描述了一种有效的对映体选择性合成的抗生素（+）-新霉素，其绝对立体化学衍生自（R）-（+）-苹果酸，随后使用了Sharpless不对称环氧化反应。
• A simple and efficient approach to 1,3-aminoalcohols: application to the synthesis of (+)-negamycin
  作者：S. Vasudeva Naidu、Pradeep Kumar

  DOI：10.1016/j.tetlet.2007.03.169

  日期：2007.5

  A short and practical enantioselective synthesis of (+)-negamycin has been achieved in high enantio- and diastereomeric excess using an iterative Jacobsen’s hydrolytic kinetic resolution as the key step.

  使用迭代的Jacobsen水解动力学拆分作为关键步骤，在高对映体和非对映异构体过量的条件下，实现了对（+）-新霉素的短而实用的对映选择性合成。