pUpU | 17489-65-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: pUpU
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 17489-65-5
• 化学式: C₁₈H₂₄N₄O₁₇P₂
• 分子量: 630.353
• InChiKey: DBKDQVLNTUFFMX-NCOIDOBVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.9
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  301
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 四氮唑 、 盐酸 、 二氯乙酸 、 ammonium hydroxide 、 水 、 碘 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 pUpU
  参考文献：
  名称：

  RNA二核苷酸uridylyl-（5'-> 3'）-[5'] uridylate（pUpU3-）的酸碱和金属离子结合特性。

  摘要：

  众所周知，Mg 2+和其他二价金属离子与核酸的磷酸基结合。这些金属离子与RNA尤其是核酶的配位特性之间的细微差异决定了它们是促进还是抑制催化活性。金属离子与两个相邻磷酸酯基团同时配位的能力对于核酶的结构和活性很重要。但是，这种相互作用尚未被量化。在这里，我们进行了电位pH滴定，以确定质子化的二核苷酸H2（pUpU）-的酸度常数，以及pUpU3-与Mg2 +，Mn2 +，Cd2 +，Zn2 +和Pb2 +的结合特性。Mg2 +，Mn2 +和Cd2 +仅与更碱性的5'-末端磷酸基团Pb2 +结合，并且在一定程度上也与Zn2 +结合，显示[M（pUpU）]-复合物的稳定性显着增强。这可以归因于通过这些金属离子桥接该二核苷酸内的两个磷酸基团而形成大螯合物。这样的大螯合物在寡核苷酸中也是可能的，因为尽管电荷不同，但是基本结构单元是相同的。[Zn（pUpU）]-和[Pb（pUpU）]-的大螯合物种的形

  DOI：

  10.1002/chem.200500013

文献信息

• Sequence- and Regioselectivity in the Montmorillonite-Catalyzed Synthesis of RNA
  作者：Shin Miyakawa、James P. Ferris

  DOI：10.1021/ja034328e

  日期：2003.7.1

  nucleotides (pN) with activated monomers (ImpN), the sequence- and regioselectivity was Pu(3')Py > Pu(3')Pu = Pu(2')Py > Pu(2')Pu. The 5'-pyrimidine initiated dimers formed less efficiently than the 5'-purine initiated dimers. Trimer formation was investigated by the synthesis of 8 dimers (pNpN) and measuring the yields of trimers formed in the reaction of each dimer with a mixture of equal molar amounts

  通过检查蒙脱石催化的 RNA 二聚体和三聚体形成中的序列和区域选择性，研究了催化在从活化单体形成有限数量的 RNA 中的可能作用。A 的反应性与 G 的相似，C 的反应性与 U 相当。但嘌呤核苷酸的反应性与嘧啶的反应性不同。在核苷酸 (pN) 与活化单体 (ImpN) 的反应中，序列和区域选择性为 Pu(3')Py > Pu(3')Pu = Pu(2')Py > Pu(2')Pu。5'-嘧啶引发的二聚体形成的效率低于 5'-嘌呤引发的二聚体。通过合成 8 个二聚体 (pNpN) 并测量每个二聚体与等摩尔量的四种活化单体的混合物的反应中形成的三聚体的产率来研究三聚体的形成。二聚体的反应性取决于连接到 RNA 3'-末端的核苷酸和磷酸二酯键的区域化学。提出了基于这些研究的规则来预测在蒙脱石催化反应中形成的 RNA 的序列和区域选择性。这些规则与等摩尔量的 ImpA 和 ImpC 反应形成的 2-5
• Oligonucleotide synthesis. Part 18. Synthesis of bis(5-chloro-8-quinolyl) nucleoside 5'-phosphates in oligoribonucleotide synthesis by the phosphotriester approach
  作者：Hiroshi Takaku、Kazuo Kamaike、Kenichi Kasuga

  DOI：10.1021/jo00146a022

  日期：1982.12
• Hartog, J. A. J. den; Boom, J. H. van, Recueil des Travaux Chimiques des Pays-Bas, 1981, vol. 100, # 7/8, p. 285 - 290
  作者：Hartog, J. A. J. den、Boom, J. H. van

  DOI：——

  日期：——
• A convenient method for insertion of the 5'-terminal phosphate group in the triester approach to oligoribonucleotide synthesis
  作者：Hiroshi Takaku、Masaatsu Kato、Masatoshi Yoshida、Ryuichi Yamaguchi

  DOI：10.1021/jo01304a042

  日期：1980.8
• COMPOSITION FOR PROMOTING ROOT NODULE FORMATION OF PLANTS AND A METHOD FOR PROMOTING ROOT NODULE FORMATION OF PLANTS
  申请人：Watanabe Kazuhiko

  公开号：US20110130285A1

  公开（公告）日：2011-06-02

  A composition for promoting root nodule formation, which can be easily applied to soil or plants, and enables efficient formation of root nodules, and a method for promoting root nodule formation using the composition are provided. A composition for promoting root nodule formation, which comprises a compound selected from the group consisting of a nucleoside, a nucleotide, and a nucleobase such as inosine, as an active ingredient, is applied to a leguminous plant to promote root nodule formation of the plant.