(2R,3S,5R)-2-(((bis(benzyloxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl (4-nitrophenyl) carbonate | 1608113-35-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: (2R,3S,5R)-2-(((bis(benzyloxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl (4-nitrophenyl) carbonate
• CAS: 1608113-35-4
• 化学式: C₃₁H₃₀N₃O₁₂P
• 分子量: 667.566
• InChiKey: KGOKZJDUANYVFD-UPRLRBBYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.18
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  187.52
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-2-(((bis(benzyloxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl (4-nitrophenyl) carbonate 在 茴香硫醚 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 41.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  为细菌细胞中的核苷酸递送定制肽-核苷酸偶联物 (PNC)

  摘要：

  介绍了肽-2'-脱氧胸苷-5'-O-单磷酸结合物的设计和合成，作为核苷酸进入营养缺陷型大肠杆菌菌株的潜在活性传递系统。通过形成生物不稳定的化学连接，允许一系列寡肽与 5'-O-（二苄基磷酸酯）-2'-脱氧胸苷或其适当的 3'-衍生类似物反应，得到相关的肽-核苷酸加合物。使用基于正交保护和激活原理的策略，对接头和肽部分进行了合理的变化，以调整缀合物的代谢稳定性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201301781
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-benzoyl-5'-O-monomethoxytritylthymidine 在 吡啶 、 四氮唑 、 氨 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 70.5h， 生成 (2R,3S,5R)-2-(((bis(benzyloxy)phosphoryl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl (4-nitrophenyl) carbonate
  参考文献：
  名称：

  为细菌细胞中的核苷酸递送定制肽-核苷酸偶联物 (PNC)

  摘要：

  介绍了肽-2'-脱氧胸苷-5'-O-单磷酸结合物的设计和合成，作为核苷酸进入营养缺陷型大肠杆菌菌株的潜在活性传递系统。通过形成生物不稳定的化学连接，允许一系列寡肽与 5'-O-（二苄基磷酸酯）-2'-脱氧胸苷或其适当的 3'-衍生类似物反应，得到相关的肽-核苷酸加合物。使用基于正交保护和激活原理的策略，对接头和肽部分进行了合理的变化，以调整缀合物的代谢稳定性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201301781

文献信息

• Synthesis of new biocarrier–nucleotide systems for cellular delivery in bacterial auxotrophic strains
  作者：Swarup De、Elisabetta Groaz、Mohitosh Maiti、Valérie Pezo、Philippe Marlière、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/j.tet.2014.09.096

  日期：2014.11

  approach for thymidine monophosphate (TMP) in bacterial cells, we have synthesized a series of conjugates of TMP with biotin having an oxymethyleneoxy ester, a carboxy ester, and different carboxamide linkers between the carboxyl group of biotin and the 3′-OH group of TMP. The synthetic strategy starts from 5′-O-(dibenzylphosphate)-thymidine having the linkers already connected at the 3′-position. Likewise

  为寻找细菌细胞中胸苷单磷酸（TMP）的递送方法，我们合成了一系列TMP与生物素结合物，该结合物在生物素的羧基和3'之间具有羟甲基氧酸酯，羧基酯和不同的羧酰胺连接基。 TMP的-OH基。合成策略从具有在3'-位已经连接的接头的5'- O-（磷酸二苄基酯）-胸苷开始。同样，卡那霉素A使用氨基甲酰基或硫代乙基氨基甲酰基在TMP的3'-位连接。这些缀合物均不能维持ΔthyA，ΔphoA大肠杆菌菌株的生长。