| 1564287-32-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• CAS: 1564287-32-6
• 化学式: C₂₆H₄₂N₃O₁₀P
• 分子量: 587.607
• InChiKey: GMGHEKMSPTUMAJ-IJEPHFKASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  162.56
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 溶剂黄146 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.05h， 生成 ((2R,3S,5R)-3-(((2,6-dichloro-3-hydroxy-4-methoxybenzylidene)amino)oxy)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl (((3R)-2,5-dihydroxytetrahydrofuran-3-yl)methyl) methylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  DNA 损伤的小分子模拟物对 DNA 聚合酶 β 的不可逆抑制

  摘要：

  无碱基位点是无处不在的 DNA 损伤，具有致突变性和细胞毒性，但可通过碱基切除修复途径去除。DNA 聚合酶 β 在碱基切除修复过程中执行四个步骤中的两个，包括裂解酶反应，该反应在切割其 5'-磷酸后从 DNA 中去除脱碱基位点。DNA聚合酶β在癌细胞中过度表达，是潜在的抗癌靶点。最近，由强效抗肿瘤剂产生的 DNA 氧化脱碱基位点被证明可以使 DNA 聚合酶 β 失活。合成了结构受氧化脱碱基位点启发的小分子文库，并筛选了不可逆抑制 DNA 聚合酶 β 的能力。一名候选人 (3a) 接受了更彻底的审查，磷酸骨架的修饰和修饰导致分子在溶液中不可逆地灭活 DNA 聚合酶 β (IC50 ≈ 21 μM)，并抑制细胞裂解物中酶的裂解酶活性。双乙酸酯类似物在细胞裂解物中转化为 3a。双乙酸盐在细胞裂解物中更有效，在前列腺癌细胞中比 3a 具有更强的细胞毒性，并将甲磺酸甲酯的细胞毒性增强 2 到 5 倍。这是

  DOI：

  10.1021/ja411733s
• 作为产物：
  描述：

  在 5-(乙硫基)-1H-四唑 、 肼 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.58h， 生成
  参考文献：
  名称：

  DNA 损伤的小分子模拟物对 DNA 聚合酶 β 的不可逆抑制

  摘要：

  无碱基位点是无处不在的 DNA 损伤，具有致突变性和细胞毒性，但可通过碱基切除修复途径去除。DNA 聚合酶 β 在碱基切除修复过程中执行四个步骤中的两个，包括裂解酶反应，该反应在切割其 5'-磷酸后从 DNA 中去除脱碱基位点。DNA聚合酶β在癌细胞中过度表达，是潜在的抗癌靶点。最近，由强效抗肿瘤剂产生的 DNA 氧化脱碱基位点被证明可以使 DNA 聚合酶 β 失活。合成了结构受氧化脱碱基位点启发的小分子文库，并筛选了不可逆抑制 DNA 聚合酶 β 的能力。一名候选人 (3a) 接受了更彻底的审查，磷酸骨架的修饰和修饰导致分子在溶液中不可逆地灭活 DNA 聚合酶 β (IC50 ≈ 21 μM)，并抑制细胞裂解物中酶的裂解酶活性。双乙酸酯类似物在细胞裂解物中转化为 3a。双乙酸盐在细胞裂解物中更有效，在前列腺癌细胞中比 3a 具有更强的细胞毒性，并将甲磺酸甲酯的细胞毒性增强 2 到 5 倍。这是

  DOI：

  10.1021/ja411733s

文献信息

• Irreversible inhibitors of DNA polymerase beta
  申请人：The Johns Hopkins University

  公开号：US09029346B1

  公开（公告）日：2015-05-12

  Methods and compounds are disclosed for irreversibly inhibiting a DNA repair enzyme that possesses lyase activity.

  本发明揭示了一种用于不可逆抑制具有裂解酶活性的DNA修复酶的方法和化合物。