合成了具有酮
酚和异羟
肟酸单元的
蒽酮配体(1 – 12),并通过限制酶抑制试验进行了评估。由多个CGCG或CGG位点组成的DNA底物被对每个序列具有选择性的限制酶完全
水解。在这种条件下,全长DNA底物仅在
配体结合所有结合位点并保护其不受限制酶
水解时保留。在使用Acc II和以不同的非结合AT碱基对间隔包含不同数量CGCG位点的50-mer DNA底物的测定中,CGCG位点越多,全长DNA越增加。即同时结合
配体(5)到CGCG的位置按(CGCG)5 >(CGCG)2 >(CGCG)1的顺序增加。此外,异羟
肟酸与
蒽酮骨架的间隔长度在CGCG位点之间的d(A / T)碱基对数目的偏爱中起着重要作用。长的间隔
配体(5)相对于具有五个AT对的CGCG位点优先,而短的间隔
配体(10)相对于具有两个AT对的CGCG位点优先。在使用限制性内切酶Fnu的测定中,间隔最短的
配体(12)在同时结合由16个连续CGG位点组成的54-mer