5-(hept-1-en-1-yl)-2'-deoxyuridine | 96962-44-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(hept-1-en-1-yl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-heptene-2'-deoxyuridine；5-hept-1-enyl-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 96962-44-6
• 化学式: C₁₆H₂₄N₂O₅
• 分子量: 324.377
• InChiKey: OPTJZBRBTBDEMV-BFHYXJOUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(hept-1-en-1-yl)-2'-deoxyuridine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 16.0h， 以75%的产率得到5-(hept-1-en-1-yl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Detection of methylcytosine by DNA photoligation via hydrophobic interaction of the alkyl group

  摘要：

  我们报告了通过使用模板引导的光连接通过 5-乙烯基-2'-脱氧尿苷衍生物进行高选择性的 5-甲基胞嘧啶非酶检测。在本文中，我们提出了一种利用疏水相互作用的新检测方法。 5-甲基胞嘧啶情况的光连接产率比胞嘧啶情况高约5.6倍。

  DOI：

  10.1039/b904941j
• 作为产物：
  描述：

  1-庚烯 、 碘苷 在 三正丁胺 、 palladium diacetate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 以97%的产率得到5-(hept-1-en-1-yl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Detection of methylcytosine by DNA photoligation via hydrophobic interaction of the alkyl group

  摘要：

  我们报告了通过使用模板引导的光连接通过 5-乙烯基-2'-脱氧尿苷衍生物进行高选择性的 5-甲基胞嘧啶非酶检测。在本文中，我们提出了一种利用疏水相互作用的新检测方法。 5-甲基胞嘧啶情况的光连接产率比胞嘧啶情况高约5.6倍。

  DOI：

  10.1039/b904941j

文献信息

• METHOD FOR DETECTING NUCLEIC ACID, CAPTURE PROBE, DETECTION PROBE SET, MICROARRAY, NUCLEIC ACID DETECTION KIT, NUCLEIC-ACID-IMMOBILIZED SOLID PHASE, AND FLUID DEVICE
  申请人：The University of Tokyo

  公开号：EP3170898A1

  公开（公告）日：2017-05-24

  A method for detecting a nucleic acid includes (a) bringing a solution including a nucleic acid and a detection probe labeled with a labeling substance into contact with a solid phase on which a capture probe is immobilized, the capture probe having a first portion including a sequence capable of hybridizing with the nucleic acid, a second portion including a sequence capable of hybridizing with the detection probe, and a stem portion for forming a double strand; (b) hybridizing the nucleic acid with the first portion, hybridizing the detection probe with the second portion, and forming a nucleic acid-detection probe-capture probe complex on the solid phase; (c) ligating the nucleic acid and the detection probe; (d) eliminating binding between the capture probe and the detection probe that has not been ligated with the nucleic acid; and (e) detecting the labeling substance in the complex.

  一种检测核酸的方法包括 (a) 使包括核酸和用标记物质标记的检测探针的溶液与固定了捕获探针的固相接触，捕获探针具有包括能与核酸杂交的序列的第一部分、包括能与检测探针杂交的序列的第二部分和用于形成双链的茎部；(b) 核酸与第一部分杂交，检测探针与第二部分杂交，并在固相上形成核酸-检测探针-捕获探针复合物； (c) 连接核酸和检测探针； (d) 消除捕获探针和未与核酸连接的检测探针之间的结合；以及 (e) 检测复合物中的标记物质。
• METHOD FOR DETECTION OF METHYLCYTOSINE USING PHOTORESPONSIVE PROBE
  申请人：Japan Advanced Institute of Science and Technology

  公开号：EP2264044B1

  公开（公告）日：2014-08-20
• [EN] METHOD FOR DETECTING NUCLEIC ACID, CAPTURE PROBE, DETECTION PROBE SET, MICROARRAY, NUCLEIC ACID DETECTION KIT, NUCLEIC-ACID-IMMOBILIZED SOLID PHASE, AND FLUID DEVICE<br/>[FR] PROCÉDÉ DE DÉTECTION D'UN ACIDE NUCLÉIQUE, SONDE DE CAPTURE, JEU DE SONDES DE DÉTECTION, MICRO-RÉSEAU, KIT DE DÉTECTION D'UN ACIDE NUCLÉIQUE, ACIDE NUCLÉIQUE IMMOBILISÉ SUR PHASE SOLIDE, ET DISPOSITIF FLUIDIQUE<br/>[JA] 核酸の検出方法、捕捉プローブ、検出プローブセット、マイクロアレイ、核酸検出キット、核酸固定化固相、及び流体デバイス
  申请人：UNIV TOKYO

  公开号：WO2016010047A1

  公开（公告）日：2016-01-21

  　以下の工程を有する核酸の検出方法。ａ）標識物質で標識されている検出プローブと核酸とを含む溶液を、核酸とハイブリダイズし得る配列からなる第１の部分と、前記検出プローブとハイブリダイズし得る配列からなる第２の部分と、二本鎖を形成するステム部と、を有する捕捉プローブが固定された固相に接触させる工程、ｂ）第１の部分に核酸をハイブリダイズさせ、第２の部分に検出プローブをハイブリダイズさせ、固相上に核酸―検出プローブ－捕捉プローブ複合体を形成させる工程、ｃ）核酸と検出プローブとをライゲーションさせる工程、ｄ）核酸とライゲーションされていない検出プローブと、捕捉プローブとの間の結合を解消させる工程、ｅ）前記複合体中の標識物質を検出する工程