((2R,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-fluoro-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate | 105307-51-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: ((2R,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-fluoro-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate
• 英文别名: (2R,3R,4S,5R)-1-(3-fluoro-4-hydroxy-5-(monophosphoryloxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-(2-deoxy-2-fluoro-5-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；[(2R,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-fluoro-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 105307-51-5
• 化学式: C₉H₁₂FN₂O₈P
• 分子量: 326.175
• InChiKey: RTGGYPQTXNSBPD-PXBUCIJWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  146
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((2R,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-fluoro-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate 在 N,N'-羰基二咪唑 、 三正丁胺 、 bis(tri-n-butylammonium) salt of phosphoric acid 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 80.0h， 生成 (2R,3S,4R,5R)-1-(3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione cyclic-4,5-diphosphate
  参考文献：
  名称：

  尿苷 5'-二磷酸类似物在人 P2Y6 受体上的结构-活性关系。

  摘要：

  研究了尿嘧啶核苷酸激活的 P2Y6 受体的结构-活性关系和分子模型。合成了带有核糖部分、尿嘧啶环和二磷酸基团取代的尿苷 5'-二磷酸 (UDP) 类似物，并测定了其对人 P2Y6 受体的活性。尿嘧啶环在 4 位上进行修饰，合成 4-取代的硫尿苷 5'-二磷酸类似物，以及在 2、3 和 5 位进行修饰。研究了磷酸链水平修饰的影响通过制备环状3',5'-二磷酸类似物、3'-二磷酸类似物和几种二核苷酸二磷酸。 5-Iodo-UDP 32 (EC50 = 0.15 microM) 与 UDP 等价，而 2'-羟基（氨基、叠氮基）的取代会大大降低效力。与 UDP 相比，2- 和 4- 硫代类似物分别为 20 和 21 也相对有效。然而，大多数其他修改大大降低了效力。分子模型表明，5'-UDP 和类似物的 β-磷酸对于与受体的三个保守阳离子残基中的两个建立静电相互作用至关重要。在4-硫醚衍生物中，4-乙硫基类似物23显示出0

  DOI：

  10.1021/jm060485n
• 作为产物：
  描述：

  1-(2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃基)尿嘧啶 在 吡啶 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 ((2R,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-fluoro-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  Preparation of [11C]-thymidine and [11C]-2′-arabino-2′-fluoro-β-5-methyl-uridine (FMAU) using a hollow fiber membrane bioreactor system

  摘要：

  制备了一系列含有固定化酶的中空纤维膜，并将其用于合成 11C 标记的核苷。11C-甲醛在醇氧化酶/催化酶生物反应器中生成，并与适当的底物一起通过胸苷酸合成酶生物反应器循环，生成相应的 11C 核苷酸。这些标记的核苷酸随后在碱性磷酸酶生物反应器中去磷酸化。与传统化学方法相比，这种生物反应器方法适用于热细胞条件，并能以更高的产量和更短的合成时间获得 11C 产物。

  DOI：

  10.1002/jlcr.2580361204

文献信息

• Structure−Activity Relationship of Uridine 5‘<b>-</b>Diphosphoglucose Analogues as Agonists of the Human P2Y₁₄ Receptor
  作者：Hyojin Ko、Ingrid Fricks、Andrei A. Ivanov、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm061222w

  日期：2007.5.1

  moieties abolished activity; this is among the least permissive P2Y receptors. However, a 2-thiouracil modification in 15 (EC50 49 +/- 2 nM) enhanced the potency of UDPG (but not UDP-glucuronic acid) by 7-fold. 4-Thio analogue 13 was equipotent to UDPG, but S-alkylation was detrimental. Compound 15 was docked in a rhodposin-based receptor homology model, which correctly predicted potent agonism of UDP-fructose

  UDP葡萄糖（UDPG）及其衍生物是Gi蛋白偶联的P2Y14受体的天然激动剂，它存在于免疫系统中。我们合成并表征了在碱基，核糖和葡萄糖部分修饰的UDPG的药理学新类似物，作为结合建模设计新配体的基础。通过工程化的Galpha-q / i蛋白将在COS-7细胞中表达的重组人P2Y14受体与磷脂酶C偶联。尿嘧啶或核糖部分的大多数修饰废除了活性。这是最不被允许的P2Y受体之一。然而，在15（EC50 49 +/- 2 nM）中的2-硫尿嘧啶修饰将UDPG（而不是UDP-葡萄糖醛酸）的效力提高了7倍。4-硫代类似物13与UDPG等价，但是S-烷基化是有害的。化合物15停靠在基于罗丹蛋白的受体同源性模型中，该模型正确预测了UDP-果糖，UDP-甘露糖和UDP-肌醇的有效激动作用。UDPG的己糖部分与多个H键和带电荷的残基相互作用，并为激动剂修饰提供了肥沃的区域。