3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA
• 英文别名: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 4-hydroxy-3-oxopentanethioate
• 化学式: C₂₆H₄₂N₇O₁₉P₃S
• 分子量: 881.642
• InChiKey: RECPWADZDPGZMO-JYDXGTDNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  426
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA 在 3,4-dihydroxypentanoyl-CoA dehydratase 、 3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA reductase 、 4-hydroxypent-2-enoyl-CoA dehydratase 作用下， 生成 2,4-pentadienoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  [EN] MICROORGANISMS FOR PRODUCING 4C-5C COMPOUNDS WITH UNSATURATION AND METHODS RELATED THERETO
  [FR] MICRO-ORGANISMES POUR LA PRODUCTION DE COMPOSÉS EN 4C-5 C AVEC UNE INSATURATION ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS

  摘要：

  该发明提供了一种具有丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇途径的非自然微生物生物体。该微生物生物体含有至少一个编码途径中酶的外源核酸。该发明还提供了一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的方法。该方法可以包括培养一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的微生物生物体，其中该微生物生物体表达至少一个编码途径酶的外源核酸，且在足够的量下，在适当的条件和足够的时间内产生丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇。

  公开号：

  WO2016004334A1
• 作为产物：
  描述：

  乙酰辅酶A 、 [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[(3R)-3-羟基-3-[2-[2-(2-羟基丙酰基硫基)乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]-2,2-二甲基-丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸 在 3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA thiolase 作用下， 生成 3-oxo-4-hydroxypentanoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  [EN] MICROORGANISMS FOR PRODUCING 4C-5C COMPOUNDS WITH UNSATURATION AND METHODS RELATED THERETO
  [FR] MICRO-ORGANISMES POUR LA PRODUCTION DE COMPOSÉS EN 4C-5 C AVEC UNE INSATURATION ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS

  摘要：

  该发明提供了一种具有丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇途径的非自然微生物生物体。该微生物生物体含有至少一个编码途径中酶的外源核酸。该发明还提供了一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的方法。该方法可以包括培养一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的微生物生物体，其中该微生物生物体表达至少一个编码途径酶的外源核酸，且在足够的量下，在适当的条件和足够的时间内产生丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇。

  公开号：

  WO2016004334A1

文献信息

• MICROORGANISMS AND METHODS FOR PRODUCING BUTADIENE AND RELATED COMPOUNDS BY FORMATE ASSIMILATION
  申请人：Genomatica, Inc.

  公开号：US20150050708A1

  公开（公告）日：2015-02-19

  Provided herein are non-naturally occurring microbial organisms having a formaldehyde fixation pathway and a formate assimilation pathway, which can further include a methanol metabolic pathway, a methanol oxidation pathway, a hydrogenase and/or a carbon monoxide dehydrogenase. These microbial organisms can further include a butadiene, 1,3-butanediol, crotyl alcohol or 3-buten-2-ol pathway. Additionally provided are methods of using such microbial organisms to produce butadiene, 1,3-butanediol, crotyl alcohol or 3-buten-2-ol.

  本文提供了一些非自然产生的微生物有甲醛固定途径和甲酸同化途径，这些微生物还可以包括甲醇代谢途径、甲醇氧化途径、氢化酶和/或一氧化碳脱氢酶。这些微生物还可以包括丁二烯、1,3-丁二醇、巴豆醇或3-丁烯-2-醇途径。此外，还提供了使用这些微生物生产丁二烯、1,3-丁二醇、巴豆醇或3-丁烯-2-醇的方法。
• Microorganisms for producing 4C-5C compounds with unsaturation and methods related thereto
  申请人：Genomatica, Inc.

  公开号：US10669561B2

  公开（公告）日：2020-06-02

  The invention provides a non-naturally occurring microbial organism having a butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol, pathway. The microbial organism contains at least one exogenous nucleic acid encoding an enzyme in a pathway. The invention additionally provides a method for producing butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol. The method can include culturing a butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol-producing microbial organism, where the microbial organism expresses at least one exogenous nucleic acid encoding a pathway enzyme in a sufficient amount, and under conditions and for a sufficient period of time to produce butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol.

  本发明提供了一种具有丁二烯、丙烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或 3-丁烯-1-醇途径的非天然微生物。微生物含有至少一种外源核酸，该核酸编码途径中的一种酶。本发明还提供了一种生产丁二烯、巴豆醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或 3-丁烯-1-醇的方法。该方法可包括培养生产丁二烯、巴豆醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或 3-丁烯-1-醇的微生物有机体，其中微生物有机体表达至少一种编码通路酶的外源核酸，其数量、条件和时间足以生产丁二烯、巴豆醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或 3-丁烯-1-醇。
• EP2783007A2
  申请人：——

  公开号：EP2783007A2

  公开（公告）日：2014-10-01
• EP2783007B1
  申请人：——

  公开号：EP2783007B1

  公开（公告）日：2017-08-16
• MICROORGANISM STRAINS FOR THE PRODUCTION OF 2,3-BUTANEDIOL
  申请人：Metabolic Explorer

  公开号：EP2783007B9

  公开（公告）日：2018-03-28