去甲万古霉素 | 91700-98-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 去甲万古霉素
• 中文别名: 万古霉素杂质
• 英文名称: N-Demethylvancomycin
• 英文别名: demethylvancomycin；demetyhlvancomycin；norvancomycin；(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-48-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3-[(2S,4S,5S,6S)-4-amino-5-hydroxy-4,6-dimethyloxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-19-[[(2R)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37-pentahydroxy-20,23,26,42,44-pentaoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaene-40-carboxylic acid
• CAS: 91700-98-0
• 化学式: C₆₅H₇₃Cl₂N₉O₂₄
• 分子量: 1435.25
• InChiKey: NUAQIRUAZSJTAI-YRPZDAAMSA-N

物化性质

• 密度：
  1.67±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.1
• 重原子数：
  100
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  545
• 氢给体数：
  19
• 氢受体数：
  26

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  去甲万古霉素 在 sodium hydroxide 、 硫代异氰酸苯酯 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 水 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 N-Des-leucylvancomycin aglycone
  参考文献：
  名称：

  从万古霉素和相关抗生素中选择性裂解凡可可胺，葡萄糖和N-甲基亮氨酸

  摘要：

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。

  DOI：

  10.1039/c39880001306

文献信息

• Design, Synthesis, and Antibacterial Activity of Demethylvancomycin Analogues against Drug-Resistant Bacteria
  作者：Jun Chang、Si-Ji Zhang、Yong-Wei Jiang、Liang Xu、Jian-Ming Yu、Wen-Jiang Zhou、Xun Sun

  DOI：10.1002/cmdc.201300011

  日期：2013.6

  evaluated. One of the compounds, N‐(6‐phenylheptyl)demethylvancomycin (12 a), was found to exhibit more potent antibacterial activity than vancomycin and demethylvancomycin. Compound 12 a was also found to be ∼18‐fold more efficacious than vancomycin against MRSA; however, the two compounds were found to have similar efficacy against MRS. Furthermore, compound 12 a exhibited a favorable pharmacokinetic profile

  通过使用基于结构的方法，合理设计和合成了五种新颖的N-取代的脱甲基万古霉素衍生物。评估了对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA），耐庆大霉素的粪便肠球菌（GRE），耐甲氧西林的肺炎链球菌（MRS）和耐万古霉素的粪便肠球菌（VRE）的体外抗菌活性。发现其中一种化合物N-（6-苯基庚基）脱甲基万古霉素（12 a）比万古霉素和脱甲基万古霉素显示出更强的抗菌活性。化合物12 a还发现抗MRSA的效力比万古霉素高约18倍；但是，发现这两种化合物对MRS的疗效相似。此外，化合物12中的表现出有利的药物动力学轮廓具有5.11±0.52小时的半衰期，这比万古霉素（4.3±1.9 H）的长。这些结果表明12 a是用于进一步临床前评估的有希望的抗菌药物候选物。
• Design, synthesis, and antibacterial evaluation of vancomycin-LPS binding peptide conjugates
  作者：Weiwei Shi、Feifei Chen、Xiangman Zou、Shang Jiao、Siqi Wang、Yu Hu、Lefu Lan、Feng Tang、Wei Huang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2021.128122

  日期：2021.8

  is ineffective against Gram-negative bacteria and vancomycin resistant bacteria. Herein, we report a series of novel vancomycin derivatives carrying LPS binding peptides, vancomycin-LPS binding peptide conjugates (VPCs). The LPS binding peptides were conjugated onto 4 sites of vancomycin via CuAAC or maleimide- sulfydryl addition, and the formed VPCs were screened against VISA/VRE and Gram-negative

  随着耐药性的紧急情况，迫切需要开发新型抗生素。万古霉素是治疗难治性革兰氏阳性菌感染的最后手段，对革兰氏阴性菌和万古霉素耐药菌无效。在此，我们报告了一系列带有 LPS 结合肽、万古霉素-LPS 结合肽偶联物 (VPC) 的新型万古霉素衍生物。LPS 结合肽通过 CuAAC 或马来酰亚胺-巯基添加缀合到万古霉素的 4 个位点上，并针对 VISA/VRE 和革兰氏阴性菌株筛选形成的 VPC。VPCs对万古霉素耐药菌表现出增强的活性，并在体外获得了对革兰氏阴性菌的活性，为万古霉素的修饰和糖肽类抗生素的合成提供了新的策略。
• Synthesis and antibacterial activity against Clostridium difficile of novel demethylvancomycin derivatives
  作者：Si-Ji Zhang、Qing Yang、Liang Xu、Jun Chang、Xun Sun

  DOI：10.1016/j.bmcl.2012.06.039

  日期：2012.8

  relationships (SAR) of demethylvancomycin (2) and find more effective new chemical entities than known glycopeptides for the treatment of Clostridium difficile (C. difficile), 17 novel N-substituted (N-arylmethylene or -aliphatic substituents) demethylvancomycin derivatives were prepared. These analogues have been evaluated in vitro for their antibacterial activities against C. difficile and Enterococcus

  探索去甲基万古霉素（2）的结构-活性关系（SAR），并发现比已知糖肽更有效的新化学实体，用于治疗艰难梭菌（C. difficile），17个新的N-取代的N-芳基亚甲基或-脂族取代基制备了去甲基万古霉素衍生物。这些类似物已经在体外评估了对艰难梭菌和粪肠球菌（E. faecium）的抗菌活性。具有N的化合物5d，5h和5i-arylmethylene取代基，结构上类似于奥利万星显示更有效的抗菌活性针对艰难梭菌比万古霉素（1）或去甲万古霉素（2）。同时，具有十一烷基侧链的化合物5k对屎肠球菌（耐万古霉素的菌株）表现出最强的抗菌活性。
• Design, synthesis and biological activity of novel demethylvancomycin dimers against vancomycin-resistant enterococcus faecalis
  作者：Yong-Wei Jiang、Liang Xu、Wei Fu、Hua Lin、Jian-Ming Yu、Xun Sun

  DOI：10.1016/j.tet.2018.04.091

  日期：2018.7

  to enhancing anti-vancomycin-resistant enterococci (VRE) activity emerged in recent years was connecting two vancomycin molecules by covalent linkers. Herein, we reported the design and synthesis of three different covalently linked demethylvancomycin dimers 7a-c by applying click chemistry. Interestingly, these dimers restored their activities against VRE. Furthermore, the interactions of molecules

  对万古霉素和其他糖肽类抗生素的抗药性的出现是临床实践中的一个严重问题，并已促使人们大力开发可克服抗药性的类似物。近年来出现的增强抗万古霉素抗性肠球菌（VRE）活性的主要策略之一是通过共价接头连接两个万古霉素分子。在这里，我们报道了通过应用点击化学的三种不同的共价连接的脱甲基万古霉素二聚体7a-c的设计和合成。有趣的是，这些二聚体恢复了针对VRE的活性。此外，还通过计算机建模研究了分子与肽聚糖的相互作用。
• Attempted introduction of a fourth amide NH into the carboxylate-binding pocket of glycopeptide antibiotics
  作者：Jochen Görlitzer、Thomas F. Gale、Dudley H. Williams

  DOI：10.1039/a906502d

  日期：——

  We report the synthesis of a novel derivative of the glycopeptide antibiotic vancomycin, modified at the N-terminus. This incorporates a fourth amide NH into the antibiotic, at the position which was formerly the N-terminus of the antibiotic-binding pocket. Although this modification gives the potential to form an extra hydrogen bond to the carboxylate anion of the bacterial cell-wall precursor analogue (N,N)-diacetyl-L-lysyl-D-alanyl-D-alanine, the modified antibiotic does not show enhanced binding to this precursor. This lack of enhanced binding is associated with an unfavourable conformational change (relative to the desired conformation) in the antibiotic.

  我们报告了一种新型糖肽抗生素万古霉素衍生物的合成过程，该衍生物在 N 端进行了修饰。它在抗生素结合袋 N 端位置加入了第四个酰胺 NH。虽然这种修饰有可能与细菌细胞壁前体类似物（N,N)-二乙酰基-L-赖氨酰-D-丙氨酰-D-丙氨酸的羧酸阴离子形成额外的氢键，但修饰后的抗生素与这种前体的结合力并没有增强。这种结合力不强的现象与抗生素的不利构象变化（相对于理想构象）有关。