N-octanoyl-Asn | 133849-10-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-octanoyl-Asn
• 英文别名: octanoyl-asparagine；(2S)-4-amino-2-(octanoylamino)-4-oxobutanoic acid
• CAS: 133849-10-2
• 化学式: C₁₂H₂₂N₂O₄
• mdl: MFCD19001344
• 分子量: 258.318
• InChiKey: HXVLHYNZFCBJGK-VIFPVBQESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-octanoyl-Asn 、 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[3-[[(2R)-2-amino-3-sulfanylpropanoyl]amino]propyl]pentanamide 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.33h， 生成 、
  参考文献：
  名称：

  一种用于鉴定硫代模板化代谢物的捕获策略

  摘要：

  非核糖体肽合成酶和聚酮化合物合成酶系统是复杂酶学的发源地，可产生具有重要治疗价值的化合物。尽管如此，由于它们的底物仍然通过硫酯键与酶结合，因此它们仍然难以表征。在这里，我们开发了一种直接捕获和表征硫酯结合酶中间体的策略，并将该策略应用于阿奇霉素生物合成途径。该方法最初在体外应用以评估其功效，随后转移到原位系统，在该系统中从天然生物体中分离出感兴趣的蛋白质以避免需要提供底物。当非核糖体肽合成酶 AziA3 从Streptomyces sahachiroi中分离出来时，捕获策略揭示了 AziA3 在阿齐霉素环氧化物部分形成后期的功能。该策略在体外用参与大肠杆菌素生物合成的非核糖体肽合成酶进一步验证。从长远来看，这种方法将用于表征硫酯结合的代谢物，不仅在阿齐霉素生物合成途径中，而且在其他隐秘代谢物途径中。

  DOI：

  10.1021/acschembio.1c00437
• 作为产物：
  描述：

  在 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 N-octanoyl-Asn
  参考文献：
  名称：

  A Prodrug Resistance Mechanism Is Involved in Colibactin Biosynthesis and Cytotoxicity

  摘要：

  Commensal Escherichia coli residing in the human gut produce colibactin, a small-molecule genotoxin of unknown structure that has been implicated in the development of colon cancer. Colibactin biosynthesis is hypothesized to involve a prodnig resistance strategy that entails initiation of biosynthesis via construction of an N-terminal prodrug scaffold and late-stage cleavage of this structural motif during product export. Here we describe the biochemical characterization of the prodrug synthesis, elongation, and cleavage enzymes from the colibactin biosynthetic pathway. We show that nonribosomal peptide synthetases ClbN and ClbB assemble and process an N-acyl-D-asparagine prodrug scaffold that serves as a substrate for the periplasmic D-amino peptidase ClbP. In addition to affording information about structural features of colibactin, this work reveals the biosynthetic logic underlying the prodrug resistance strategy and suggests that cytotoxicity requires amide bond cleavage.

  DOI：

  10.1021/ja312154m

文献信息

• Repurposing the 3‐Isocyanobutanoic Acid Adenylation Enzyme SfaB for Versatile Amidation and Thioesterification
  作者：Mengyi Zhu、Lijuan Wang、Jing He

  DOI：10.1002/anie.202010042

  日期：2021.1.25

  molecules with novel skeletons, but also to identify the enzymes that catalyze diverse chemical reactions. Exploring the substrate promiscuity and catalytic mechanism of those biosynthetic enzymes facilitates the development of potential biocatalysts. SfaB is an acyl adenylate‐forming enzyme that adenylates a unique building block, 3‐isocyanobutanoic acid, in the biosynthetic pathway of the diisonitrile

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。
• <i>N</i>-Carboxyanhydride-Mediated Fatty Acylation of Amino Acids and Peptides for Functionalization of Protocell Membranes
  作者：Enver Cagri Izgu、Anders Björkbom、Neha P. Kamat、Victor S. Lelyveld、Weicheng Zhang、Tony Z. Jia、Jack W. Szostak

  DOI：10.1021/jacs.6b08801

  日期：2016.12.28

  sulfide has been shown to generate short peptides via the formation of cyclic amino acid N-carboxyanhydrides (NCAs). Here, we show that the polymerization of valine-NCA in the presence of fatty acids yields acylated amino acids and peptides via a mixed anhydride intermediate. Notably, Nα-oleoylarginine, a product of the reaction between arginine and oleic acid in the presence of valine-NCA, partitions

  早期的原始细胞很可能是由 RNA、肽和脂质分子的自组装产生的，这些分子在地球早期的地质有利环境中生成和集中。这些成分在提供化学能源的益生元环境中的反应性可能会产生具有有利于原始细胞出现的特性的其他物种。羰基硫对氨基酸的地球化学上合理的活化已被证明通过形成环状氨基酸 N-羧酸酐 (NCA) 产生短肽。在这里，我们表明缬氨酸-NCA 在脂肪酸存在下的聚合通过混合酸酐中间体产生酰化氨基酸和肽。值得注意的是，Nα-油酰精氨酸，在缬氨酸-NCA 存在下，精氨酸和油酸反应的产物，自发地进入囊泡膜并介导 RNA 与囊泡的结合。我们的结果表明了一种潜在的机制，通过该机制，活化的氨基酸可以使脂肪酸膜的化学功能多样化，并在早期原始细胞的形成过程中将 RNA 与囊泡共定位。
• A Capture Strategy for the Identification of Thio-Templated Metabolites
  作者：Lauren A. Washburn、Keshav K. Nepal、Coran M. H. Watanabe

  DOI：10.1021/acschembio.1c00437

  日期：2021.9.17

  Nonribosomal peptide synthetase and polyketide synthase systems are home to complex enzymology and produce compounds of great therapeutic value. Despite this, they have continued to be difficult to characterize due to their substrates remaining enzyme-bound by a thioester bond. Here, we have developed a strategy to directly trap and characterize the thioester-bound enzyme intermediates and applied the strategy

  非核糖体肽合成酶和聚酮化合物合成酶系统是复杂酶学的发源地，可产生具有重要治疗价值的化合物。尽管如此，由于它们的底物仍然通过硫酯键与酶结合，因此它们仍然难以表征。在这里，我们开发了一种直接捕获和表征硫酯结合酶中间体的策略，并将该策略应用于阿奇霉素生物合成途径。该方法最初在体外应用以评估其功效，随后转移到原位系统，在该系统中从天然生物体中分离出感兴趣的蛋白质以避免需要提供底物。当非核糖体肽合成酶 AziA3 从Streptomyces sahachiroi中分离出来时，捕获策略揭示了 AziA3 在阿齐霉素环氧化物部分形成后期的功能。该策略在体外用参与大肠杆菌素生物合成的非核糖体肽合成酶进一步验证。从长远来看，这种方法将用于表征硫酯结合的代谢物，不仅在阿齐霉素生物合成途径中，而且在其他隐秘代谢物途径中。
• A Prodrug Resistance Mechanism Is Involved in Colibactin Biosynthesis and Cytotoxicity
  作者：Carolyn A. Brotherton、Emily P. Balskus

  DOI：10.1021/ja312154m

  日期：2013.3.6

  Commensal Escherichia coli residing in the human gut produce colibactin, a small-molecule genotoxin of unknown structure that has been implicated in the development of colon cancer. Colibactin biosynthesis is hypothesized to involve a prodnig resistance strategy that entails initiation of biosynthesis via construction of an N-terminal prodrug scaffold and late-stage cleavage of this structural motif during product export. Here we describe the biochemical characterization of the prodrug synthesis, elongation, and cleavage enzymes from the colibactin biosynthetic pathway. We show that nonribosomal peptide synthetases ClbN and ClbB assemble and process an N-acyl-D-asparagine prodrug scaffold that serves as a substrate for the periplasmic D-amino peptidase ClbP. In addition to affording information about structural features of colibactin, this work reveals the biosynthetic logic underlying the prodrug resistance strategy and suggests that cytotoxicity requires amide bond cleavage.