2,4(1H,3H)-嘧啶二酮,5-甲基-1-(2,3,5-三-O-苯甲酰-b-L-呋喃核糖基)- | 237060-98-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 2,4(1H,3H)-嘧啶二酮,5-甲基-1-(2,3,5-三-O-苯甲酰-b-L-呋喃核糖基)-
• 英文名称: 2',3',5'-tri-O-benzoyl-5-methyl-L-uridine
• 英文别名: 2′,3′,5′-tri-O-benzoyl-L-ribothymidine；[(2S,3S,4S,5S)-3,4-dibenzoyloxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 237060-98-9
• 化学式: C₃₁H₂₆N₂O₉
• 分子量: 570.555
• InChiKey: BJGXIHNHRIWKHA-XLXZRNDBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,4(1H,3H)-嘧啶二酮,5-甲基-1-(2,3,5-三-O-苯甲酰-b-L-呋喃核糖基)- 在 4-二甲氨基吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 四丁基氟化铵 、 三正丁基氢锡 、 sodium methylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 替比夫定
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Enzymatic Digestion of an RNA Nonamer in Both Enantiomeric Forms

  摘要：

  The D- and L-RNA nonamers of the sequence r(GCUUCGGC)T have been synthesised for X-ray crystallographic purposes. In vitro digestion of the unnatural optical antipode by snake venom phosphodiesterase I takes place at an approximately 1800-fold slower rate than that of the natural D-nonamer. The digestion experiments showed-to our knowledge for the first time-that L-RNA can indeed be cleaved enzymatically when phosphodiesterase I from snake venom is used-as opposed to a number of cellular ribonucleases-which sheds an interesting light on the evolution and possibly structure/function relationship of venom versus cellular degradation enzymes. The broad substrate specificity of this enzyme could be taken advantage of to study and further optimise the resistance towards biodegradation of therapeutic L-RNA aptamers. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00046-6
• 作为产物：
  描述：

  1-乙酰氧基-2,3,5-三苯甲酰氧基-β-L-呋喃核糖 、 胸腺嘧啶 在 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 反应 3.67h， 以50%的产率得到2,4(1H,3H)-嘧啶二酮,5-甲基-1-(2,3,5-三-O-苯甲酰-b-L-呋喃核糖基)-
  参考文献：
  名称：

  人酪氨酰-DNA 磷酸二酯酶 1 (Tdp1) 对亲脂性核苷立体异构形式的抑制的体外和计算机研究：碳水化合物立体化学在配体-酶相互作用中的作用

  摘要：

  研究了不同手性亲脂性核苷衍生物对人 DNA 修复酶酪氨酰-DNA 磷酸二酯酶 1 (Tdp1) 的抑制作用。在一系列研究化合物中发现了新的 Tdp1 抑制剂，IC 50 = 2.7–6.7 μM。结果表明，D-亲脂性核苷衍生物比它们的 L-类似物表现出更高的抑制活性，并且碳水化合物部分的构型可以影响 Tdp1 抑制的机制。

  DOI：

  10.3390/molecules27082433

文献信息

• 2'-deoxy-L-nucleosides
  申请人：Watanabe Kyoichi

  公开号：US20050090660A1

  公开（公告）日：2005-04-28

  This invention provides processes for the preparation of compounds having the structure: wherein X and Y are same or different, and H, OH, OR, SH, SR, NH 2 , NHR′, or NR′R″ Z is H, F, Cl, Br, I, CN, or NH 2 . R is hydrogen, halogen, lower alkyl of C 1 -C 6 or aralkyl, NO 2 , NH 2 , NHR′, NR′R″, OH, OR, SH, SR, CN, CONH 2 , CSNH 2 , CO 2 H, CO 2 R′, CH 2 CO 2 H, CH 2 CO 2 R′, CH═CHR, CH 2 CH═CHR, or C═CR. R′ and R″ are same or different, and lower alkyl of C 1 -C 6 . R 13 is hydrogen, alkyl, acyl, phosphate (monophosphate, diphosphate, triphosphate, or stabilized phosphate) or silyl; and

  这项发明提供了制备具有以下结构的化合物的方法： 其中 X和Y相同或不同，且H、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR′或NR′R″ Z为H、F、Cl、Br、I、CN或NH2 R为氢、卤素、C1-C6的低碳烷基或芳基烷基、NO2、NH2、NHR′、NR′R″、OH、OR、SH、SR、CN、CONH2、CSNH2、CO2H、CO2R′、CH2CO2H、CH2CO2R′、CH═CHR、CH2CH═CHR或C═CR。 R′和R″相同或不同，且为C1-C6的低碳烷基。 R13为氢、烷基、酰基、磷酸酯（单磷酸酯、二磷酸酯、三磷酸酯或稳定磷酸酯）或硅基。
• Synthesis of 2'-deoxy-l-nucleosides
  申请人：Pharmasset Limited

  公开号：EP1600451A2

  公开（公告）日：2005-11-30

  The present invention provides a process for the preparation of a 2'-deoxy-L-nucleoside comprising the steps of: a) preparing a 2'-halo-L-nucleoside of the following formula:    wherein B is a heterocyclic or heteroaromatic base, R8 and R9 are independently hydrogen or a suitable protecting group, V is a halogen; and b) reducing the 2'-halo-L-nucleoside to a 2'-deoxy-L-nucleoside.

  本发明提供了一种制备 2'-脱氧-L-核苷的工艺，包括以下步骤： a) 制备下式的 2'-卤代-L-核苷： 其中 B 是杂环或杂芳族基团，R8 和 R9 独立地为氢或合适的保护基团，V 是卤素；以及 b) 将 2'-卤代-L-核苷还原成 2'-脱氧-L-核苷。
• Synthesis of 2'-deoxy-L-nucleosides
  申请人：Pharmasset Limited

  公开号：EP1600452A2

  公开（公告）日：2005-11-30

  The present invention provides a process for the preparation of a 2'-deoxy-L-nucleoside comprising the following steps: a) preparing from a suitably protected and activated L-furanose a 2-S-substituted-2-deoxy-L-furanose of the following formula: wherein B is a heterocyclic or heteroaromatic base, R8 and R9 are independently hydrogen or a suitable protecting group; R7 is a suitable protecting group; b) cyclizing the 2-S-substituted-2-deoxy-L-furanose to form a cyclonucleoside of the following formula: and c) reducing the cyclonucleoside to a 2'-deoxy-L-nucleoside.

  本发明提供了一种制备 2'-脱氧-L-核苷的工艺，包括以下步骤： a) 由适当保护和活化的 L-呋喃糖制备下式的 2-S-取代的-2-脱氧-L-呋喃糖： 其中 B 是杂环基或杂芳香基，R8 和 R9 独立地为氢或合适的保护基团；R7 是合适的保护基团； b) 环化 2-S-取代的-2-脱氧-L-呋喃糖，形成下式的环核苷： 和 c) 将环核苷还原成 2'-脱氧-L-核苷。
• AN ECONOMICAL SYNTHESIS OF D- AND L-PYRIMIDINE ARABINO- AND RIBONUCLEOSIDES
  作者：Hassan B. Lazrek、Driss Ouzebla、Abdesslem Faraj

  DOI：10.1080/15257770.2011.568033

  日期：2011.1

  The one-step synthesis of several -D/L-arabino- and ribonucleosides was performed in good yields under reflux or microwave-assisted fusion method. A comparison of the two methods showed that better yields were obtained using the reflux conditions.
• L-R_{ibonucleosides for}R_acemicRNA
  作者：E. Moyroud、O. Botta、P. Strazewski

  DOI：10.1080/15257779908041544

  日期：1999.4

  Two L-ribosyl donors were synthesised from L-xylose, then submitted to a glycosidation reaction according to Vorbruggen's conditions to furnish L-ribonucleosides in high yield.