5'-Desoxy-2',3'-O-isopropyliden-5'-adenosincarbonitril | 59696-80-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 5'-Desoxy-2',3'-O-isopropyliden-5'-adenosincarbonitril
• 英文别名: 5'-deoxy-5'-cyano-2',3'-isopropylidene adenosine；5'-Desoxy-2',3'-isopropylidenadenosin-5'-carbonitril；2-{(3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethylperhydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl}ethanenitrile；2-((4R,6R)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)acetonitrile；2-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)acetonitrile；5'-cyano-O²,O³-isopropylidene-5'-deoxy-adenosine；2-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]acetonitrile
• CAS: 59696-80-9
• 化学式: C₁₄H₁₆N₆O₃
• 分子量: 316.319
• InChiKey: AJVAXRQWKARFNK-QYVSTXNMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  121
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-Desoxy-2',3'-O-isopropyliden-5'-adenosincarbonitril 在 sodium tetrahydroborate 、 nickel(II) chloride hexahydrate 、 sodium hydride 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 mineral oil 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 tert-butyl (9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((3-tert-butyloxythioureido)-ethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  通过解构-重建和片段生长方法将 I 型蛋白精氨酸甲基转移酶的非选择性抑制剂转化为蛋白精氨酸甲基转移酶 4 的有效和选择性抑制剂

  摘要：

  蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 是重要的治疗靶点，在许多细胞过程的调节中起着至关重要的作用，并与许多疾病有关。然而，关于它们的功能和它们所涉及的生物学途径，以及可能推动 PRMT 活性选择性调节剂发展的结构要求，仍有许多有待了解。在这里，我们报告了一种解构-重建方法，该方法从我们之前鉴定的一系列 I 型 PRMT 抑制剂开始，允许鉴定 PRMT4 的有效和选择性抑制剂，无论细胞渗透性低如何，都显示精氨酸甲基化明显减少MCF7 细胞中的水平和增殖的显着减少。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00252
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(苄基磺酰基)-2',3'-O-异亚丙基腺苷 在 盐酸 、 sodium iodide 作用下， 以 甲醇 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 24.5h， 生成 5'-Desoxy-2',3'-O-isopropyliden-5'-adenosincarbonitril
  参考文献：
  名称：

  Singh, Ambarish K., Synthetic Communications, 1990, vol. 20, # 22, p. 3547 - 3551

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Synthesis and evaluation of protein arginine N-methyltransferase inhibitors designed to simultaneously occupy both substrate binding sites
  作者：Matthijs van Haren、Linda Quarles van Ufford、Ed E. Moret、Nathaniel I. Martin

  DOI：10.1039/c4ob01734j

  日期：——

  transferring a methyl group from the cofactor S-adenosyl-L-methionine (AdoMet) to the guanidine group of arginine residues in target proteins. The most notable is the PRMT-mediated methylation of arginine residues that are present in histone proteins which can lead to chromatin remodelling and influence gene transcription. A growing body of evidence now implicates dysregulated PRMT activity in a number of diseases

  蛋白质精氨酸N-甲基转移酶（PRMT）是一类酶，其作用是通过从辅助因子S-腺苷基L特异性转移甲基来发挥功能-甲硫氨酸（AdoMet）修饰靶蛋白中精氨酸残基的胍基。最值得注意的是组蛋白中存在的PRMT介导的精氨酸残基甲基化，可导致染色质重塑并影响基因转录。现在越来越多的证据表明PRMT活性失调可能导致多种疾病，包括各种形式的癌症。因此，PRMT抑制剂的开发可能具有开发新疗法的潜力。我们在此报告了一系列小分子PRMT抑制剂的合成和评估，这些抑制剂旨在同时占据胍基底物和AdoMet辅因子的结合位点。当针对一组甲基转移酶测试这些化合物时，观察到有效的抑制作用和令人惊讶的选择性。
• Bisubstrate inhibitors for the enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT): influence of inhibitor preorganisation and linker length between the two substrate moieties on binding affinity
  作者：Christian Lerner、Birgit Masjost、Armin Ruf、Volker Gramlich、Roland Jakob-Roetne、Gerhard Zürcher、Edilio Borroni、François Diederich

  DOI：10.1039/b208690p

  日期：——

  Inhibition of the enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT) is an important approach in the treatment of Parkinson's disease. A series of new potent bisubstrate inhibitors for COMT, resulting from X-ray structure-based design and featuring adenosine and catechol moieties have been synthesised. Biological results show a large dependence of binding affinity on inhibitor preorganisation and the length of the linker between nucleoside and catechol moieties. The most potent bisubstrate inhibitor for COMT has an IC50 value of 9 nM. It exhibits competitive kinetics for the SAM and mixed inhibition kinetics for the catechol binding site. Its bisubstrate binding mode was confirmed by X-ray structure analysis of the ternary complex formed by the inhibitor, COMT and a Mg2+ ion.

  抑制儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)是治疗帕金森病的重要方法。根据基于X射线结构设计的原理，一系列新型强效双底物COMT抑制剂已被合成，这些抑制剂具有腺苷和儿茶酚结构单元。生物学结果显示，结合亲和力对抑制剂的预组织结构及核苷与儿茶酚单元间连接链的长度有较大依赖性。对COMT最有效的双底物抑制剂的IC50值为9 nM。它对SAM结合位点表现出竞争性动力学特性，而对儿茶酚结合位点则呈现出混合抑制动力学特征。其双底物结合模式通过分析抑制剂、COMT及Mg2+离子形成的三元复合物的X射线结构得到确认。
• Structure-guided design and synthesis of ATP-competitive N-acyl-substituted sulfamide d-alanine-d-alanine ligase inhibitors
  作者：Rouven Becker、Jordan L. Pederick、Edward G. Dawes、John B. Bruning、Andrew D. Abell

  DOI：10.1016/j.bmc.2023.117509

  日期：2023.12

  the ATP-dependent formation of d-Ala-d-Ala, a critical component in bacterial cell wall biosynthesis and is a validated target for new antimicrobial agents. Here, we describe the structure-guided design, synthesis, and evaluation of ATP-competitive N-acyl-substituted sulfamides 27–36, 42, 46, 47 as inhibitors of Staphylococcus aureus Ddl (SaDdl). A crystal structure of SaDdl complexed with ATP and d-Ala-d-Ala

  d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶 (Ddl) 催化d -Ala- d -Ala 的 ATP 依赖性形成，d-Ala-d-Ala 是细菌细胞壁生物合成的关键成分，也是新型抗菌剂的有效靶点。在这里，我们描述了 ATP 竞争性N -酰基取代磺酰胺27 – 36, 42, 46, 47作为金黄色葡萄球菌Ddl ( Sa Ddl) 抑制剂的结构指导设计、合成和评估。 Sa Ddl 与 ATP 和d -Ala- d -Ala (PDB: 7U9K) 复合的晶体结构将 ATP 模拟物8确定为进一步抑制剂设计的初始支架。 Sa Ddl 酶抑制测定中对8的评估显示其能够将酶活性降低至 72 ± 8 % (IC 50 = 1.6 mM)。 8的磺酰胺接头用 2-(4-甲氧基苯基)乙醇延伸得到29 ，以研究与Sa Ddl 的d -Ala 口袋的进一步相互作用，如分子对接所预测的。该化合物将酶活性降低至 89 ± 1%，用替代苯基取代基（
• Meyer, Wilfried; Frollmann, Hartmut, Chemische Berichte, 1980, vol. 113, # 7, p. 2530 - 2544
  作者：Meyer, Wilfried、Frollmann, Hartmut

  DOI：——

  日期：——
• Hollmann, Juergen; Schlimme, Eckhard, Liebigs Annalen der Chemie, 1984, # 1, p. 98 - 107
  作者：Hollmann, Juergen、Schlimme, Eckhard

  DOI：——

  日期：——