Ac-Leu-Gly-Lys-(7-amino-4-methylcoumarin) trifluoroacetate | 1379469-23-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Ac-Leu-Gly-Lys-(7-amino-4-methylcoumarin) trifluoroacetate
• 英文别名: Ac-Leu-Gly-Lys-(7-amino-4-methyl-coumarin) trifluoroacetate salt
• CAS: 1379469-23-4
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₂₆H₃₇N₅O₆
• 分子量: 629.634
• InChiKey: GPDLUOMQWIQTNS-GUTACTQSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.95
• 重原子数：
  44.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  209.93
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Ac-Leu-Gly-Lys-(7-amino-4-methylcoumarin) trifluoroacetate 在 水 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.66h， 生成 Ac-Leu-Gly-Lys(malonyl)-(7-amino-4-methylcoumarin)
  参考文献：
  名称：

  使用NAD依赖的Sirtuin 5赖氨酸脱酰基酶（KDAC）酶进行高效荧光筛查的底物

  摘要：

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。

  DOI：

  10.1021/jm300526r
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (S)-(5-amino-6-((4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)-amino)-6-oxohexyl) carbamate 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.84h， 生成 Ac-Leu-Gly-Lys-(7-amino-4-methylcoumarin) trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  使用NAD依赖的Sirtuin 5赖氨酸脱酰基酶（KDAC）酶进行高效荧光筛查的底物

  摘要：

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。

  DOI：

  10.1021/jm300526r

文献信息

• Histone Deacetylase 11 Is an ε-N-Myristoyllysine Hydrolase
  作者：Carlos Moreno-Yruela、Iacopo Galleano、Andreas S. Madsen、Christian A. Olsen

  DOI：10.1016/j.chembiol.2018.04.007

  日期：2018.7

  Histone deacetylase (HDAC) enzymes regulate diverse biological function, including gene expression, rendering them potential targets for intervention in a number of diseases, with a handful of compounds approved for treatment of certain hematologic cancers. Among the human zinc-dependent HDACs, the most recently discovered member, HDAC11, is the only member assigned to subclass IV. It is the smallest protein and has the least well understood biological function. Here, we show that HDAC11 cleaves long-chain acyl modifications on lysine side chains with remarkable efficiency. We further show that several common types of HDAC inhibitors, including the approved drugs romidepsin and vorinostat, do not inhibit this enzymatic activity. Macrocyclic hydroxamic acid-containing peptides, on the other hand, potently inhibit HDAC11 demyris-toylation activity. These findings should be taken carefully into consideration in future investigations of the biological function of HDAC11 and will serve as a foundation for the development of selective chemical probes targeting HDAC11.