背景 M20
氨基肽酶(例如肽酶T(PepT))在蛋白质降解途径的最终阶段涉及寡肽的
水解,以维持营业额。因此,对PepT的特异性抑制作用对于新型下一代抗真菌药的开发很有效。这项工作描述了
金属依赖性,底物偏好和对PepT的抑制,并详细证明了其两个保守的底物结合残基的作用。 方法 使用肽底物和拟肽
抑制剂的方案纯化和鉴定PepT。用一系列生化,
生物物理和结构
生物学方法对残基T364和N378进行突变和表征。 结果 PepT序列带有M20肽酶典型的保守基序,我们的
生物化学工作表明,这种胞质酶具有广泛的底物特异性,对在P 1位置带有丙
氨酸的肽具有最佳的切割偏好。拟肽类阿马他汀和肌动蛋白通过与底物竞争结合到活性位点而占据了S 1口袋,并有效抑制了PepT,而香菜碱A和Bestatin的抑制作用较差。我们进一步表明,保守的底物结合残基(T364和N378)向丙
氨酸的突变影响了结构,降低了底物结合并改变了这种二聚酶的酰胺分解活性。