2'-deoxy-4-thiouridine | 5580-20-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-4-thiouridine
• 英文别名: 4-thio-2'-deoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4-sulfanylidenepyrimidin-2-one
• CAS: 5580-20-1
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₄S
• 分子量: 244.271
• InChiKey: PHNDUXLWAVSUAL-SHYZEUOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P264,P270,P271,P280,P301+P312,P302+P352,P304+P340,P305+P351+P338,P330,P332+P313,P337+P313,P362,P403+P233,P405,P501
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  存放于惰性气体中，避免与空气接触。

制备方法与用途

4-硫代-2'-脱氧尿苷是一种嘌呤核苷类似物，它具有广泛的抗肿瘤活性，特别针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-4-thiouridine 在 磷酸三甲酯 、 三正丁胺 、 三氯氧磷 、 三丁基焦磷酸铵 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 1.75h， 以20%的产率得到4-thio-2'-deoxyuridine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  修饰的核苷酸作为末端脱氧核苷酸转移酶的底物。

  摘要：

  新型修饰核苷酸的合成及其掺入DNA序列为改变寡核苷酸（ON）的化学性质提供了许多可能性，因此，拓宽了修饰DNA的实际应用领域。进行了核苷酸衍生物的化学合成，包括带有硫基，肼基，氰基和羧基基团的衍生物以及含2-吡啶酮核碱基的核苷酸。测试了制备的化合物作为末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）的底物。含有N +-氨基胞嘧啶，4-硫尿嘧啶以及2-吡啶酮，4-氯-和4-溴-2-吡啶酮作为核碱基的核苷酸被TdT接受，因此可以进行3'-末端修饰的ONs的酶促合成。成功进行了紫外线诱导的含4-硫尿嘧啶的ONs与TdT的交联。

  DOI：

  10.3390/molecules22040672
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-di(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyuridine 在 ammonium hydroxide 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 2'-deoxy-4-thiouridine
  参考文献：
  名称：

  S-氰乙基保护的4-硫尿苷和2'-脱氧-4-硫尿苷的合成及稳定性

  摘要：

  提出了方便的制备S-（2-氰乙基）保护的2'-脱氧-4-硫尿苷（5a）和4-硫尿苷（5b）的方法。该小号氰乙基保护基团是稳定的固相寡核苷酸合成的亚磷酰胺方法中通常遇到的试剂，并使用浓NH容易脱保护4 OH在25℃下。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(91)80679-z

文献信息

• Three Novel Spin-Labeled Substrates for Enzymatic Incorporation into Nucleic Acid Lattices
  作者：Charles R. Toppin、Gary T. Pauly、Prabu Devanesan、David Kryak、Albert M. Bobst

  DOI：10.1002/hlca.19860690213

  日期：1986.3.19

  The synthesis of one C(4)-spin-labeled uridine-5′-diphosphate (C(4)-UDP) and two nitroxide-containing 2′-deoxyuridine-5′-triphosphate (dUTP) analogs are reported. The C(4)-UDP derivative was incorporated into copolymers by polynucleotide phosphoxylase (PNPase); one of the two dUTP analogs, substituted at position C(4), was a good substrate for TdT, whereas the other one, substituted at position C(5)

  报道了一个C（4）-自旋标记的尿苷5'-二磷酸（C（4）-UDP）和两个含氮氧化物的2'-脱氧尿苷-5'-三磷酸（dUTP）类似物的合成。C（4）-UDP衍生物通过多核苷酸磷酸化酶（PNPase）掺入共聚物中；在位置C（4）处被取代的两个dUTP类似物之一是TdT的良好底物，而在位置C（5）处被取代的另一个被用作大肠杆菌DNA聚合酶的底物（Pol I）。
• NMR and UV Studies of 4-Thio-2′-deoxyuridine and Its Derivatives
  作者：Xiaohui Zhang、Yao-Zhong Xu

  DOI：10.3390/molecules16075655

  日期：——

  5-Substituted-4-thio-2'-deoxyuridine nucleosides have been chemically synthesized and studied by NMR and UV spectroscopy. The results have been analyzed and discussed in connection with the previous data. The imino proton signal and the carbon signal of the thiocarbonyl group in the 5-substituted-4-thio-2'-deoxyuridines were found to be at much lower field, offering a potential for monitoring these

  5-Substituted-4-thio-2'-deoxyuridine nucleosides 已被化学合成并通过 NMR 和 UV 光谱进行了研究。已经结合先前的数据对结果进行了分析和讨论。发现 5-取代-4-硫代-2'-脱氧尿苷中的亚氨基质子信号和硫代羰基的碳信号处于低得多的场中，为在 DNA 水平上监测这些修饰碱基提供了潜力。所有 4-硫代核苷在 340 nm 附近都有很强的吸收，因此可用作潜在的 UVA 诱导的抗癌剂。
• Systematic assignment of NMR spectra of 5-substituted-4-thiopyrimidine nucleosides
  作者：Xiaohui Zhang、Jian Wang、Yao-Zhong Xu

  DOI：10.1002/mrc.3980

  日期：2013.9

  characterization of 5‐substituted‐4‐thiopyrimidine nucleosides (ribonucleosides and 2'‐deoxynucleosides) was performed using NMR spectroscopy. Assignments of all proton and carbon signals of 5‐bromo‐4‐thiouridine and related nucleosides were systematically carried out and firmly established by COSY and HMQC techniques. The NMR data of various 4‐thiopyrimidine nucleosides are compared, and the key contributing

  使用 NMR 光谱对 5-取代-4-硫代嘧啶核苷（核糖核苷和 2'-脱氧核苷）进行明确表征。5-溴-4-硫尿苷和相关核苷的所有质子和碳信号的分配是通过 COZY 和 HMQC 技术系统地进行并牢固建立的。比较了各种 4-硫代嘧啶核苷的 NMR 数据，并讨论了关键影响因素。这里介绍的方法适用于其他修饰的核苷和核苷酸，以及核碱基。版权所有 © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.
• 4-硫代尿嘧啶脱氧核苷磷酸酯及其抗病毒药物用途
  申请人：南京颐媛生物医学研究院有限公司

  公开号：CN113501853A

  公开（公告）日：2021-10-15

  本发明公开了一种4‑硫代尿嘧啶脱氧核苷磷酸酯，结构式为：Q06，发现新的药物分子不仅是对治疗乙肝药物有了新的选择，对开发更理想的治疗乙肝药物也具有重要意义。
• Modified 5′-Trityl Nucleosides as Inhibitors of<i>Plasmodium falciparum</i>dUTPase
  作者：Gian Filippo Ruda、Corinne Nguyen、Przemysław Ziemkowski、Krzysztof Felczak、Ganasan Kasinathan、Alexander Musso-Buendia、Christian Sund、Xiao Xiong Zhou、Marcel Kaiser、Luis M. Ruiz-Pérez、Reto Brun、Tadeusz Kulikowski、Nils Gunnar Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1002/cmdc.201000445

  日期：2011.2.7

  2′‐Deoxyuridine triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) is a potential drug target for the treatment of malaria. We previously reported the discovery of 5′‐tritylated analogues of deoxyuridine as selective inhibitors of this Plasmodium falciparum enzyme. Herein we report further structure–activity studies; in particular, variations of the 5′‐trityl group, the introduction of various substituents

  2'-脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）是治疗疟疾的潜在药物靶标。我们之前曾报道过发现脱氧尿苷的5'-三苯甲基化类似物可作为恶性疟原虫的选择性抑制剂酶。在这里，我们报告了进一步的结构活动研究；特别是5'-三苯甲基的变体，在脱氧尿苷的3'-位置引入了各种取代基以及修饰了碱基。测试了针对酶和寄生虫的化合物。5'-三苯甲基和3'-取代基的变异具有良好的耐受性，并产生了活性化合物。然而，由于尿嘧啶环的修饰导致酶抑制作用的丧失和抗血浆作用的显着降低，因此对尿嘧啶碱基的活性有明确的要求。