((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl methanesulfonate | 29391-35-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: ((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl methanesulfonate
• 英文别名: 5'-O-methanesulfonyl-β-thymidine；5'-O-methanesulfonyl-thymidine；5'-O-methanesulfonylthymidine；thymidine 5'-mesylate；O^5'-methanesulfonyl-thymidine；5'-O-Mesyl-thymidin；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl methanesulfonate；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl methanesulfonate
• CAS: 29391-35-3
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₇S
• 分子量: 320.323
• InChiKey: FKTQFHRCQVZSHV-DJLDLDEBSA-N

物化性质

• 密度：
  1.502±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl methanesulfonate 在 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 以330 mg的产率得到5-叠氮基-5-脱氧胸腺嘧啶脱氧核苷
  参考文献：
  名称：

  Glycosyl–nucleoside–lipid based supramolecular assembly as a nanostructured material with nucleic acid delivery capabilities

  摘要：

  一种糖基-核苷酸-脂质自组装成高度有序的结构，如纤维和纳米管，这些结构能够稳定水凝胶；碳水化合物部分提供了一个适宜的环境，用于将核酸传递到人体细胞中。

  DOI：

  10.1039/b906212b
• 作为产物：
  描述：

  甲基磺酰氯 、 beta-胸苷 在 吡啶 作用下， 以62%的产率得到((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl methanesulfonate
  参考文献：
  名称：

  pH可裂解的核苷脂质：控制基于脂质的递送系统稳定性的新范例

  摘要：

  基于脂质的输送系统是一项成熟的技术，已在临床上获得了广泛认可，并在人体中得到了多种应用。在这里，我们报告新型，原酸酯核苷脂质（ONLs）的设计，合成和评估脂质体稳定性的调制。ONL包含带有3'-原酸酯核苷衍生物的头部基团，这些衍生物具有正电荷或负电荷。原酸酯功能在NL结构中的插入允许形成pH敏感的脂质体。可以水解基于ONL的脂质体以提供无毒产品，包括核苷衍生物和十六烷醇。为了使释放可以在不同的水解速率下调节，调节了极性头结构的电荷，并且可以在生物学上相关的pH值下释放头基。至关重要的是 当ONL与天然磷酸胆碱脂质（PC）混合时，所得脂质体向十六烷醇/ PC层状体系的形成方向发展。生物学评估表明，用ONL和siRNA配制的稳定的核酸脂质颗粒（SNALP）可以有效进入肿瘤细胞并响应细胞内酸性环境释放其核酸有效载荷。这导致比常规SNALPs高得多的抗肿瘤活性。使用pH可裂解的核苷酸控制基于脂质的

  DOI：

  10.1002/cmdc.201500381

文献信息

• [EN] NUCLEOSIDE-LIPID COMPOUNDS WITH PH-SENSITIVE DIALKYLORTHOESTER CHAINS AND THEIR USE FOR TRANSPORTATION OR VECTORIZATION OF AT LEAST ONE THERAPEUTIC AGENT<br/>[FR] COMPOSÉS NUCLÉOSIDES-LIPIDES AVEC DES CHAÎNES DIALKYLORTHOESTER SENSIBLES AU PH ET LEUR UTILISATION POUR LE TRANSPORT OU LA VECTORISATION D'AU MOINS UN AGENT THÉRAPEUTIQUE
  申请人：UNIV BORDEAUX

  公开号：WO2016188868A1

  公开（公告）日：2016-12-01

  The invention relates to new nucleoside-lipid compounds with pH-sensitive dialkylorthoesterchains, to the process for their preparation and to their uses, in particular their use for transportation or vectorization of at least one therapeutic agent.

  这项发明涉及具有pH敏感二烷基正酯链的新核苷脂类化合物，涉及它们的制备过程以及它们的用途，特别是用于运输或载体化至少一种治疗剂的用途。
• Synthesis and Evaluation of α-Thymidine Analogues as Novel Antimalarials
  作者：Huaqing Cui、Juana Carrero-Lérida、Ana P. G. Silva、Jean L. Whittingham、James A. Brannigan、Luis M. Ruiz-Pérez、Kevin D. Read、Keith S. Wilson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1021/jm301328h

  日期：2012.12.27

  Plasmodium falciparum thymidylate kinase (PfTMPK) is a key enzyme in pyrimidine nucleotide biosynthesis. 3-Trifluoromethyl-4-chloro-phenyl-urea-α-thymidine has been reported as an inhibitor of Mycobacterium tuberculosis TMPK (MtTMPK). Starting from this point, we designed, synthesized and evaluated a number of thymidine analogues as antimalarials. Both 5′-urea-α- and β-thymidine derivatives were moderate

  恶性疟原虫胸苷酸激酶 ( Pf TMPK) 是嘧啶核苷酸生物合成的关键酶。3-Trifluoromethyl-4-chloro-phenyl-urea-α-thymidine 已被报道为结核分枝杆菌TMPK ( Mt TMPK)的抑制剂。从这一点出发，我们设计、合成并评估了许多作为抗疟药的胸苷类似物。5'-尿素-α-和β-胸苷衍生物都是Pf TMPK 的中度抑制剂，并且还显示出对寄生虫生长的中度抑制。几种酶-抑制剂复合物的结构为改进抑制剂设计提供了基础。然而，我们发现某些 5'-尿素-α-胸苷类似物具有抗疟活性，其中PfTMPK 不是主要的作用方式。该系列的优化产生了具有有效抗疟活性的化合物（EC 50 = 28 nM；CC 50 = 29 μM）。
• Efficient Solid Phase Synthesis of Cleavable Oligodeoxynucleotides Based on a Novel Strategy for the Synthesis of 5?-S-(4,4?-Dimethoxytrityl)-2?-deoxy-5?-thionucleoside Phosphoramidites
  作者：Kerstin Jahn-Hofmann、Joachim?W. Engels

  DOI：10.1002/hlca.200490252

  日期：2004.11

  cleavage site into an oligodeoxynucleotide can be achieved by utilizing the four 5′-S-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-deoxy-5′-thionucleoside 3′-(2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidites) 5 and 15a–c (Fig. 1). Based on the silver ion assisted cleavage of PS and CS bonds, we synthesized oligodeoxynucleotides with an achiral 5′-phosphorothioate linkage 3′–O–P–S–5′ by the solid-phase phosphoramidite procedure

  通过使用四个5'- S-（4,4'-二甲氧基三苯甲基）-2'-脱氧-5'-硫代核苷3'-（2-氰基乙基二异丙基亚磷酰胺基）5可以实现将特定切割位点掺入寡脱氧核苷酸中和15a – c（图1）。基于银离子对PS和CS键的裂解，我们通过固相亚磷酰胺合成了具有非手性5'-硫代磷酸酯键3'–O–P–S–5'的寡脱氧核苷酸。这些修饰的寡脱氧核苷酸的有效裂解可通过HPLC，PAGE和表面等离振子共振（SPR）光谱进行检测。释放的5'-硫醇部分可直接用于带有适当功能化的报告基团的反应后标记。
• A New Concept for DNA-Arrays
  作者：Kerstin Jahn-Hofmann、Nancy Holzhey、Thomas Ellinger、Joachim W. Engels

  DOI：10.1081/ncn-120023015

  日期：2003.10

  will insert a cleavage site in an oligodeoxynucleotide, which can be used for a selective and quantitative cleavage. For that reason we synthesized the four 5′-S-(4,4′-dimethoxytrityl)-mercapto-2′-deoxynucleotide-3′-O-(2-cyanoethoxydiisopropylamino)-phosphites ( 5a–d ). The cleavage of P-S and C-S bonds is described (Mag, M.; Lücking, S.; Engels, J.W. Synthesis and selective cleavage of an oligodeoxy-nucleotide

  摘要我们将在寡聚脱氧核苷酸中插入一个切割位点，可用于选择性和定量切割。因此，我们合成了四个5'-S-（4,4'-二甲氧基三苯甲基）-巯基-2'-脱氧核苷酸-3'-O-（2-氰基乙氧基二异丙基氨基）-亚磷酸酯（5a–d）。描述了PS和CS键的裂解（Mag，M .;Lücking，S .; Engels，JW合成和选择性裂解含有桥连的核苷酸间5'-硫代磷酸酯键的低聚脱氧核苷酸Nucleic Acids Res。1991，19（7 ），1437–1441;万豪酒店，JH; Mottahedeh，M .;里斯（Reese），CB 9-（4-甲氧基苯基）氧杂蒽-9-硫醇：一种有用的硫醇试剂。Tetrahedron Lett。1990，31（51）， 7485–7488； Divakar，KJ； Mottoh，A。； Reese，CB； Shanghvi，YS合成嘧啶核糖苷2'硫代类似物的方法。珀金（
• Inhibitors of RecA activities for control of antibiotic-resistant bacterial pathogens
  申请人：Singleton Fain Scott

  公开号：US20060199768A1

  公开（公告）日：2006-09-07

  Compounds for modulating RecA protein activity are provided. In some embodiments, the compounds modulate RecA activity by interfering with assembly of monomeric RecA protein subunits into a nucleoprotein filament. In some embodiments, the compounds modulate RecA activity by interfering with adenosine triphosphate hydrolysis by the RecA protein. Methods of screening for and methods of using the compounds are also provided.

  提供了用于调节RecA蛋白活性的化合物。在某些实施例中，这些化合物通过干扰单体RecA蛋白亚基的组装成为核蛋白丝来调节RecA活性。在某些实施例中，这些化合物通过干扰RecA蛋白的三磷酸腺苷水解来调节RecA活性。还提供了筛选这些化合物的方法和使用这些化合物的方法。