5'-O-tert-butyldimethylsilyl-(E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine | 376393-38-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-tert-butyldimethylsilyl-(E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-[(E)-2-bromoethenyl]-1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 376393-38-3
• 化学式: C₁₇H₂₇BrN₂O₅Si
• 分子量: 447.401
• InChiKey: AQFWBDSHRKLGKR-XXWFEYIXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.57
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-tert-butyldimethylsilyl-(E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine 在 叔丁基过氧化氢 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.83h， 生成 cyclo(3-methylsaligenyl)-5'-O-((E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxy-3'-O-L-phenylalanyluridinyl)phosphate
  参考文献：
  名称：

  CycloSal-BVDUMP前核苷酸：如何将抗病毒非活性核苷类似物转化为针对EBV的生物活性化合物。

  摘要：

  关于其潜在的抗EBV活性，研究了新型cycloSal-BVDUMP三酯2-4 5-[（（E）-2-溴乙烯基）-2'-脱氧尿苷（BVDU，1）。除了3'-未修饰的cycloSal-BVDUMP三酯2a-f外，3'-羟基官能团还被不同的脂肪族羧酸（3a-g）和具有天然和非天然Calpha-构型（4a- m）。除了这些化合物的合成以外，还将报道新衍生物的不同物理化学性质，即亲脂性和水解行为。可以证明，通过在pH 6.8和7.3的磷酸盐缓冲液以及P3HR-1细胞提取物中进行化学水解，可以从大多数化合物中释放出单磷酸盐BVDUMP而不是3'，5'-环状BVDUMP。最后，测试了新化合物的抗EBV活性。结果，原型化合物，特别是三酯2c，显示出明显的抗EBV活性，使这些化合物有望成为进一步开发的候选物。但是，3'-酯衍生物没有任何抗病毒活性，而3'-氨基酰基衍生物显示出取决于氨基酸和Calpha-构型的抗病毒活性。

  DOI：

  10.1021/jm0209275
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 溴夫定 在 吡啶 作用下， 反应 14.0h， 以84%的产率得到5'-O-tert-butyldimethylsilyl-(E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  CycloSal-BVDUMP前核苷酸：如何将抗病毒非活性核苷类似物转化为针对EBV的生物活性化合物。

  摘要：

  关于其潜在的抗EBV活性，研究了新型cycloSal-BVDUMP三酯2-4 5-[（（E）-2-溴乙烯基）-2'-脱氧尿苷（BVDU，1）。除了3'-未修饰的cycloSal-BVDUMP三酯2a-f外，3'-羟基官能团还被不同的脂肪族羧酸（3a-g）和具有天然和非天然Calpha-构型（4a- m）。除了这些化合物的合成以外，还将报道新衍生物的不同物理化学性质，即亲脂性和水解行为。可以证明，通过在pH 6.8和7.3的磷酸盐缓冲液以及P3HR-1细胞提取物中进行化学水解，可以从大多数化合物中释放出单磷酸盐BVDUMP而不是3'，5'-环状BVDUMP。最后，测试了新化合物的抗EBV活性。结果，原型化合物，特别是三酯2c，显示出明显的抗EBV活性，使这些化合物有望成为进一步开发的候选物。但是，3'-酯衍生物没有任何抗病毒活性，而3'-氨基酰基衍生物显示出取决于氨基酸和Calpha-构型的抗病毒活性。

  DOI：

  10.1021/jm0209275

文献信息

• Membrane-permeable Triphosphate Prodrugs of Nucleoside Analogues
  作者：Tristan Gollnest、Thiago Dinis de Oliveira、Anna Rath、Ilona Hauber、Dominique Schols、Jan Balzarini、Chris Meier

  DOI：10.1002/anie.201511808

  日期：2016.4.18

  approved, as well as potentially antivirally active, nucleoside analogues was synthesized. The enzyme‐triggered delivery of NTPs was demonstrated by pig liver esterase, in human T‐lymphocyte cell extracts and by a polymerase chain reaction using a prodrug of thymidine triphosphate. The TriPPPro‐compounds of some HIV‐inactive nucleoside analogues showed marked anti‐HIV activity. For cellular uptake

  核苷类似物代谢转化为三磷酸酯的过程常常进行得不充分。速率限制可以在单磷酸化步骤中进行，也可以在二磷酸化和三磷酸化步骤中进行。我们开发了核苷三磷酸（NTP）递送系统（Tri PPP方法）。通过这种方法，NTP被γ-磷酸盐处的两个生物可逆单元掩盖。使用涉及H-膦酸酯化学的方法，合成了一系列带有批准的以及可能具有抗病毒活性的核苷类似物的衍生物。猪肝酯酶，人T淋巴细胞提取物中的酶触发的NTPs传递以及使用三磷酸胸苷的前药的聚合酶链式反应证明了这一点。三重PPP一些对HIV无活性的核苷类似物的ro-化合物显示出显着的抗HIV活性。为了进行细胞摄取研究，制备了荧光Tri PPP ro-化合物，该化合物将三磷酸化的代谢物递送至完整的CEM细胞。
• SYNTHESIS, HYDROLYSIS AND ANTI-EBV ACTIVITY OF A SERIES OF 3′-MODIFIED<i>cyclo</i>Sal-BVDUMP PRONUCLEOTIDES
  作者：C. Meier、A. Lomp、A. Meerbach、P. Wutzler

  DOI：10.1081/ncn-100002301

  日期：2001.3.31

  A series of cycloSal-BVDUMP phosphate triesters has been prepared. The prototype compound was 3-methyl-cycloSal-BVDUMP 2. Furthermore, a series of 3'-O-acyl-modified derivatives having carboxylic acids with different lipophilicity or a L-configurated alpha -amino acid (phenylalanine) was prepared. The hydrolysis properties in phosphate buffer PBS as well as in PBS containing pig liver esterase (PLE) will be described. Finally, the biological activity against EBV has been determined.