3'-O-nitro-2'-deoxythymidine | 77421-84-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-nitro-2'-deoxythymidine
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl] nitrate
• CAS: 77421-84-2
• 化学式: C₁₀H₁₃N₃O₇
• 分子量: 287.229
• InChiKey: IETUTDWZXUFCPZ-XLPZGREQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.57±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,3'-anhydro-5'-O-benzoyl-2'-deoxythymidine 在 硝酸铵 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 3'-O-nitro-2'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  3'-和5'-硝基氧基嘧啶核苷硝酸酯的合成：“一氧化氮供体”试剂，作为抗癌药和抗病毒药进行评估。

  摘要：

  一组3'-O-硝基-2'-脱氧尿苷，3'-O-硝基-2'-脱氧胞苷和5'-O-硝基-2'-脱氧尿苷具有各种取代基（H，Me，F ，I）在C-5位被合成为具有抗癌/抗病毒剂的能力，所述抗癌/抗病毒剂具有伴随释放细胞毒性一氧化氮（* NO）的能力。尽管这些化合物通常在l-半胱氨酸或血清存在下孵育后释放的NO含量比参考药物异山梨醇二硝酸盐更高，但它们的细胞毒性（CC（50）= 10（-3）至10（-6）M范围）与5-碘-2'-脱氧尿苷相当，但对多种癌细胞系却比5-氟-2'-脱氧尿苷弱。对未转染的（KBALB，143B）和相应的转染的（KBALB-STK，观察到具有1型单纯疱疹病毒（HSV-1）胸苷激酶基因（TK（+））的143B-LTK）癌细胞系，表明病毒TK酶的表达未提供基因治疗作用。这些硝酸酯是无活性的抗病毒药，除了5-碘-3'-O-硝基-2'-脱氧尿苷对HSV-1，HSV-2和牛痘病毒表现出适度的活性。

  DOI：

  10.1021/jm020299r

文献信息

• New compound for sequencing by synthesis
  申请人：Roche Diagnostics GmbH

  公开号：EP2876166B1

  公开（公告）日：2016-12-14
• COMPOUND FOR SEQUENCING BY SYNTHESIS
  申请人：Roche Diagnostics Operations, Inc.

  公开号：US20150140561A1

  公开（公告）日：2015-05-21

  The present invention provides deoxynucleoside tri- or tetraphosphate comprising a 3′ nitrate and a detectable label covalently bound to the oxygen atom of an oxymethyl or oxyallyl or oxypropargyl substitution of a nucleobase. Such compounds provide new possibilities for future Sequencing by Synthesis technologies.
• US9410197B2
  申请人：——

  公开号：US9410197B2

  公开（公告）日：2016-08-09
• Synthesis of 3‘- and 5‘-Nitrooxy Pyrimidine Nucleoside Nitrate Esters:  “Nitric Oxide Donor” Agents for Evaluation as Anticancer and Antiviral Agents
  作者：Ebrahim Naimi、Aihua Zhou、Panteha Khalili、Leonard I. Wiebe、Jan Balzarini、Erik De Clercq、Edward E. Knaus

  DOI：10.1021/jm020299r

  日期：2003.3.1

  lines possessing the herpes simplex virus type 1 (HSV-1) thymidine kinase gene (TK(+)) were observed, indicating that expression of the viral TK enzyme did not provide a gene therapeutic effect. These nitrate esters were inactive antiviral agents except for 5-iodo-3'-O-nitro-2'-deoxyuridine that showed modest activity against HSV-1, HSV-2, and vaccinia virus.

  一组3'-O-硝基-2'-脱氧尿苷，3'-O-硝基-2'-脱氧胞苷和5'-O-硝基-2'-脱氧尿苷具有各种取代基（H，Me，F ，I）在C-5位被合成为具有抗癌/抗病毒剂的能力，所述抗癌/抗病毒剂具有伴随释放细胞毒性一氧化氮（* NO）的能力。尽管这些化合物通常在l-半胱氨酸或血清存在下孵育后释放的NO含量比参考药物异山梨醇二硝酸盐更高，但它们的细胞毒性（CC（50）= 10（-3）至10（-6）M范围）与5-碘-2'-脱氧尿苷相当，但对多种癌细胞系却比5-氟-2'-脱氧尿苷弱。对未转染的（KBALB，143B）和相应的转染的（KBALB-STK，观察到具有1型单纯疱疹病毒（HSV-1）胸苷激酶基因（TK（+））的143B-LTK）癌细胞系，表明病毒TK酶的表达未提供基因治疗作用。这些硝酸酯是无活性的抗病毒药，除了5-碘-3'-O-硝基-2'-脱氧尿苷对HSV-1，HSV-2和牛痘病毒表现出适度的活性。