Evidence for a Boat Conformation at the Transition State of GH76 α-1,6-Mannanases-Key Enzymes in Bacterial and Fungal Mannoprotein Metabolism
作者:Andrew J. Thompson、Gaetano Speciale、Javier Iglesias-Fernández、Zalihe Hakki、Tyson Belz、Alan Cartmell、Richard J. Spears、Emily Chandler、Max J. Temple、Judith Stepper、Harry J. Gilbert、Carme Rovira、Spencer J. Williams、Gideon J. Davies
DOI:10.1002/anie.201410502
日期:2015.4.27
QM/MM metadynamics that show how the enzyme surface restricts the conformational landscape of the substrate, rendering the B2,5 conformation the most energetically stable on‐enzyme. We conclude that GH76 enzymes perform catalysis using an itinerary that passes through OS2 and B2,5≠ conformations, information that should inspire the development of new antifungal agents.
α-甘露糖苷酶和 α-甘露聚糖酶因其在 α-甘露糖苷受阻异头中心的亲核取代以及甘露糖苷酶抑制剂作为细胞探针和治疗剂的潜力而引起了人们的关注。我们报告了通过对米氏复合物的结构分析以及新型氮杂/亚氨基糖抑制剂的合成和评估研究的 GH76 α-甘露聚糖家族的构象路线。O S 2构象的米氏复合物,加上抑制剂复合物中的氮杂糖变形为高能B 2,5构象,通过从头算 QM/MM 元动力学合理化,显示酶表面如何限制酶的构象景观基板,呈现B 2,5构象是能量最稳定的酶。我们得出结论,GH76 酶使用通过O S 2和B 2,5 ≠构象的路线进行催化,这些信息应该会激发新抗真菌剂的开发。