(4S)-azido-(2R)-(N⁴-benzyloxycarbonylcytosin-1-ylmethyl)pyrrolidin-N-1-acetic acid ethyl ester | 787615-27-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (4S)-azido-(2R)-(N⁴-benzyloxycarbonylcytosin-1-ylmethyl)pyrrolidin-N-1-acetic acid ethyl ester
• 英文别名: ethyl 2-[(2R,4S)-4-azido-2-[[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]methyl]pyrrolidin-1-yl]acetate
• CAS: 787615-27-4
• 化学式: C₂₁H₂₅N₇O₅
• 分子量: 455.473
• InChiKey: ZTHCRTGJHJRGLH-DLBZAZTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (4S)-azido-(2R)-(N⁴-benzyloxycarbonylcytosin-1-ylmethyl)pyrrolidin-N-1-acetic acid ethyl ester 在 镍 氢气 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 [(2R,4S)-4-Amino-2-(4-benzyloxycarbonylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-ylmethyl)-pyrrolidin-1-yl]-acetic acid ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Chimeric (aeg-pyrrolidine)PNAs: synthesis and stereo-discriminative duplex binding with DNA/RNA

  摘要：

  报道了天然存在的4-羟基脯氨酸的设计及其方便转化为胸腺嘧啶吡咯烷PNA单体的四种立体异构体，以及（2R,4S）-腺嘌呤、-鸟嘌呤和-胞嘧啶单体的合成，并将其引入到形成双链的PNA寡聚体中。对互补DNA/RNA序列在平行或反平行方向下的杂交研究得到的有趣结果揭示了立体化学依赖的DNA与RNA的区分以及平行/反平行方向的选择性。

  DOI：

  10.1039/b407292h
• 作为产物：
  描述：

  (2R,4S)-4-Azido-2-(4-benzyloxycarbonylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-ylmethyl)-pyrrolidine-1-carboxylic acid tert-butyl ester 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.17h， 生成 (4S)-azido-(2R)-(N⁴-benzyloxycarbonylcytosin-1-ylmethyl)pyrrolidin-N-1-acetic acid ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Chimeric (aeg-pyrrolidine)PNAs: synthesis and stereo-discriminative duplex binding with DNA/RNA

  摘要：

  报道了天然存在的4-羟基脯氨酸的设计及其方便转化为胸腺嘧啶吡咯烷PNA单体的四种立体异构体，以及（2R,4S）-腺嘌呤、-鸟嘌呤和-胞嘧啶单体的合成，并将其引入到形成双链的PNA寡聚体中。对互补DNA/RNA序列在平行或反平行方向下的杂交研究得到的有趣结果揭示了立体化学依赖的DNA与RNA的区分以及平行/反平行方向的选择性。

  DOI：

  10.1039/b407292h

文献信息

• Chimeric (aeg-pyrrolidine)PNAs: synthesis and stereo-discriminative duplex binding with DNA/RNA
  作者：Pallavi S. Lonkar、Krishna N. Ganesh、Vaijayanti A. Kumar

  DOI：10.1039/b407292h

  日期：——

  The design and facile conversion of naturally occurring 4-hydroxyproline to all four diastereomers of thymine pyrrolidine PNA monomer, (2R,4S)-adenine, -guanine and -cytosine monomers and their incorporation into duplex forming PNA oligomers is reported. The interesting results of the hybridization studies with complementary DNA/RNA sequences in either parallel or antiparallel orientation reveal the stereochemistry-dependent DNA vs. RNA discriminations and parallel/antiparallel orientation selectivity.

  报道了天然存在的4-羟基脯氨酸的设计及其方便转化为胸腺嘧啶吡咯烷PNA单体的四种立体异构体，以及（2R,4S）-腺嘌呤、-鸟嘌呤和-胞嘧啶单体的合成，并将其引入到形成双链的PNA寡聚体中。对互补DNA/RNA序列在平行或反平行方向下的杂交研究得到的有趣结果揭示了立体化学依赖的DNA与RNA的区分以及平行/反平行方向的选择性。