N⁴-(4-methoxybenzoyl)-1-(methoxycarbonylmethyl)cytosine | 172405-09-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N⁴-(4-methoxybenzoyl)-1-(methoxycarbonylmethyl)cytosine
• 英文别名: Methyl 2-[4-[(4-methoxybenzoyl)amino]-2-oxopyrimidin-1-yl]acetate
• CAS: 172405-09-3
• 化学式: C₁₅H₁₅N₃O₅
• 分子量: 317.301
• InChiKey: QSRADBQDVCQPJQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(4-methoxybenzoyl)-1-(methoxycarbonylmethyl)cytosine 在 sodium hydroxide 、 propylphosphonic anhydride 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 ([2-(4,5-Dimethoxy-2-nitro-benzyloxycarbonylamino)-ethyl]-{2-[4-(4-methoxy-benzoylamino)-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl]-acetyl}-amino)-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  光不稳定的合成ø -nitroveratryloxycarbonyl（NVOC）保护的肽核酸单体

  摘要：

  肽核酸（PNA）单体的化学合成是使用邻硝基veratryryloxymethoxy（NVOC）基团（N-氨基乙基甘氨酸主链）和碱基不稳定的酰基型核碱基保护基团（腺嘌呤和胞嘧啶为异戊基；鸟嘌呤为异丁酰基）的各种组合完成的。 ），因此提供了与光刻寡核苷酸合成条件兼容的光刻固相PNA合成策略，并通过避免使用常用的脱保护试剂（例如三氟乙酸或哌啶）在基本上中性的介质中原位合成PNA微阵列。还探讨了制备1-（羧甲基）-4 - N-（4-甲氧基苯甲酰基）胞嘧啶和9-（羧甲基）-2-胞嘧啶的简便方法N-（异丁酰基）鸟嘌呤，收率高。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.06.002
• 作为产物：
  描述：

  对甲氧基苯甲酰氯 在 吡啶 、 sodium hydride 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N⁴-(4-methoxybenzoyl)-1-(methoxycarbonylmethyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  光不稳定的合成ø -nitroveratryloxycarbonyl（NVOC）保护的肽核酸单体

  摘要：

  肽核酸（PNA）单体的化学合成是使用邻硝基veratryryloxymethoxy（NVOC）基团（N-氨基乙基甘氨酸主链）和碱基不稳定的酰基型核碱基保护基团（腺嘌呤和胞嘧啶为异戊基；鸟嘌呤为异丁酰基）的各种组合完成的。 ），因此提供了与光刻寡核苷酸合成条件兼容的光刻固相PNA合成策略，并通过避免使用常用的脱保护试剂（例如三氟乙酸或哌啶）在基本上中性的介质中原位合成PNA微阵列。还探讨了制备1-（羧甲基）-4 - N-（4-甲氧基苯甲酰基）胞嘧啶和9-（羧甲基）-2-胞嘧啶的简便方法N-（异丁酰基）鸟嘌呤，收率高。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.06.002

文献信息

• Fmoc/Acyl protecting groups in the synthesis of polyamide (peptide) nucleic acid monomers
  作者：Zoltán Timár、Lajos Kovács、Györgyi Kovács、Zoltán Schmél

  DOI：10.1039/a907832k

  日期：——

  acid 7 is described using partial hydrolysis of a dianisoylated derivative. Different methods were studied for guanine alkylation including (a) Mitsunobu reaction; (b) low-temperature, sodium hydride- and (c) N,N-diisopropylethylamine-mediated alkylation reactions to give preferentially N 9-substituted derivatives. Empirical rules are proposed for differentiating N 9/N 7-substituted guanines based on

  聚酰胺（肽）核酸（PNA）单体22–25的化学合成已使用Fmoc [ N-（2-氨基乙基）甘氨酸骨架]，异戊二烯基（腺嘌呤），4-叔丁基苯甲酰基（胞嘧啶）和异丁酰/二苯基氨基甲（鸟嘌呤）的保护基团的组合，从而允许在低聚物合成两个肽和寡核苷酸合成。描述了使用二异氰酸酯化衍生物的部分水解来制备（N 6-茴香酰腺苷-9-基）乙酸7的另一种方法。研究了鸟嘌呤烷基化的不同方法，包括：（a）Mitsunobu反应；（b）低温氢化钠-和（c）N，N-二异丙基乙胺介导的烷基化反应，优先得到N 9-取代的衍生物。提出了基于其13 C NMR化学位移差异来区分N 9 / N 7取代鸟嘌呤的经验规则。