tert-butyl 3-((1H-benzo[d]imidazol-2-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxylate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: tert-butyl 3-((1H-benzo[d]imidazol-2-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxylate
• 英文别名: tert-Butyl 3-((1H-benzo[d]imidazol-2-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxylate；tert-butyl 3-(1H-benzimidazol-2-ylamino)pyrrolidine-1-carboxylate
• 化学式: C₁₆H₂₂N₄O₂
• 分子量: 302.376
• InChiKey: AFSZVYKACTVHSC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  70.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl 3-((1H-benzo[d]imidazol-2-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxylate 在 sodium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 1-(4-fluorobenzyl)-N-(pyrrolidin-3-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-amine
  参考文献：
  名称：

  靶向EZH2-EED相互作用的小分子PRC2抑制剂的结构引导开发

  摘要：

  EZH2-胚胎外胚层发育（EED）蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的破坏是一种新的有前途的癌症治疗策略。我们之前曾报道过阿司咪唑的发现，这是一种靶向 EZH2-EED PPI 的小分子抑制剂。在此，我们报告了 EED 与阿司咪唑复合物在 2.15 Å 处的共晶结构。该结构阐明了阿司咪唑与 EED 的详细结合模式，并为发现具有亲和力K d的新型 EZH2-EED 相互作用抑制剂 DC-PRC2in-01 提供了结构指导设计4.56 μM。DC-PRC2in-01 使PRC2 复合物不稳定，从而导致PRC2 核心蛋白的降解和癌细胞中整体H3K27me3 水平的降低。有效抑制PRC2驱动的淋巴瘤细胞增殖，细胞周期停滞在G0/G1期。总之，这些数据表明 DC-PRC2in-01 可能是一种有效的化学探针，用于研究与 PRC2 相关的生理学和病理学，并为进一步开发提供有前景的化学支架。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c02261
• 作为产物：
  描述：

  3-氨基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯 在 碘甲烷 作用下， 以 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 tert-butyl 3-((1H-benzo[d]imidazol-2-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  靶向EZH2-EED相互作用的小分子PRC2抑制剂的结构引导开发

  摘要：

  EZH2-胚胎外胚层发育（EED）蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的破坏是一种新的有前途的癌症治疗策略。我们之前曾报道过阿司咪唑的发现，这是一种靶向 EZH2-EED PPI 的小分子抑制剂。在此，我们报告了 EED 与阿司咪唑复合物在 2.15 Å 处的共晶结构。该结构阐明了阿司咪唑与 EED 的详细结合模式，并为发现具有亲和力K d的新型 EZH2-EED 相互作用抑制剂 DC-PRC2in-01 提供了结构指导设计4.56 μM。DC-PRC2in-01 使PRC2 复合物不稳定，从而导致PRC2 核心蛋白的降解和癌细胞中整体H3K27me3 水平的降低。有效抑制PRC2驱动的淋巴瘤细胞增殖，细胞周期停滞在G0/G1期。总之，这些数据表明 DC-PRC2in-01 可能是一种有效的化学探针，用于研究与 PRC2 相关的生理学和病理学，并为进一步开发提供有前景的化学支架。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c02261