(2S)-5-oxo-2-[(biphenylsulfonyl) amino]-5-[(2-methylpropyl)amino]pentanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S)-5-oxo-2-[(biphenylsulfonyl) amino]-5-[(2-methylpropyl)amino]pentanoic acid
• 英文别名: (2S)-5-(2-methylpropylamino)-5-oxo-2-[(4-phenylphenyl)sulfonylamino]pentanoic acid
• 化学式: C₂₁H₂₆N₂O₅S
• 分子量: 418.514
• InChiKey: AVCNNANJOCHIKF-IBGZPJMESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  121
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-5-oxo-2-[(biphenylsulfonyl) amino]-5-[(2-methylpropyl)amino]pentanoic acid 在 氯化亚砜 、 羟胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 2‐([1,1′‐biphenyl]‐4‐sulfonamido)‐N¹‐hydroxy‐N⁵‐isobutylpentanediamide
  参考文献：
  名称：

  10.1002/ddr.22255

  摘要：

  AbstractOverexpression of matrix metalloproteinase‐2 (MMP‐2) possesses a correlation with leukemia especially chronic myeloid leukemia (CML). However, no such MMP‐2 inhibitor has come out in the market to date for treating leukemia. In this study, synthesis, biological evaluation, and molecular modeling studies of a set of biphenylsulfonamide derivatives as promising MMP‐2 inhibitors were performed, focusing on their potential applications as antileukemic therapeutics. Compounds DH‐18 and DH‐19 exerted the most effective MMP‐2 inhibition (IC50 of 139.45 nM and 115.16 nM, respectively) with potent antileukemic efficacy against the CML cell line K562 (IC50 of 0.338 µM and 0.398 µM, respectively). The lead molecules DH‐18 and DH‐19 reduced the MMP‐2 expression by 21.3% and 17.8%, respectively with effective apoptotic induction (45.4% and 39.8%, respectively) in the K562 cell line. Moreover, both these compounds significantly arrested different phases of the cell cycle. Again, both these molecules depicted promising antiangiogenic efficacy in the ACHN cell line. Nevertheless, the molecular docking and molecular dynamics (MD) simulation studies revealed that DH‐18 formed strong bidentate chelation with the catalytic Zn2+ ion through the hydroxamate zinc binding group (ZBG). Apart from that, the MD simulation study also disclosed stable binding interactions of DH‐18 and MMP‐2 along with crucial interactions with active site amino acid residues namely His120, Glu121, His124, His130, Pro140, and Tyr142. In a nutshell, this study highlighted the importance of biphenylsulfonamide‐based novel and promising MMP‐2 inhibitors to open up a new avenue for potential therapy against CML.

  DOI：

  10.1002/ddr.22255
• 作为产物：
  描述：

  对联苯磺酰氯 在 乙酰氯 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 (2S)-5-oxo-2-[(biphenylsulfonyl) amino]-5-[(2-methylpropyl)amino]pentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  通过基于计算机/片段的铅鉴定和从头修饰铅，对某些选择性的基质金属蛋白酶-2抑制剂进行了稳健的设计，使其优于基质金属蛋白酶9：合成和生物学检测。

  摘要：

  广泛的选择性严重限制了用于临床目的的基质金属蛋白酶2（MMP-2）抑制剂的开发。为了开发有效的和选择性的MMP-2抑制剂，最初采用了多种分子建模技术来进行可靠的设计。使用预测性和经过验证的回归模型（2D和3D QSAR和基于配体的药效团作图研究）来估计效价，而分类模型（贝叶斯和递归分配分析）用于确定MMP-2抑制剂对MMP-9的选择性。贝叶斯模型指纹用于设计选择性先导分子，并使用基于结构的从头技术对其进行修饰。制备了一系列设计的分子，并分别针对MMP-2和MMP-9的抑制作用进行了筛选，因为这些是紧随其他MMP之后设计的，以观察到更广泛的选择性。最佳活性MMP-2抑制剂的IC50值为24nM，而最佳选择性抑制剂（IC50 = 51nM）对所有测试的MMP表现出对MMP-2的选择性是至少4倍。活性衍生物对人肺癌细胞系A549无细胞毒性。在非细胞毒性浓度下，这些抑制剂最多可将细胞内MMP-2表

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.07.023

文献信息

• Robust design of some selective matrix metalloproteinase-2 inhibitors over matrix metalloproteinase-9 through in silico/fragment-based lead identification and de novo lead modification: Syntheses and biological assays
  作者：Nilanjan Adhikari、Amit K. Halder、Sumana Mallick、Achintya Saha、Kishna D. Saha、Tarun Jha

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.07.023

  日期：2016.9

  of MMP-2 inhibitors over MMP-9. Bayesian model fingerprints were used to design selective lead molecule which was modified using structure-based de novo technique. A series of designed molecules were prepared and screened initially for inhibitions of MMP-2 and MMP-9, respectively, as these are designed followed by other MMPs to observe the broader selectivity. The best active MMP-2 inhibitor had IC50

  广泛的选择性严重限制了用于临床目的的基质金属蛋白酶2（MMP-2）抑制剂的开发。为了开发有效的和选择性的MMP-2抑制剂，最初采用了多种分子建模技术来进行可靠的设计。使用预测性和经过验证的回归模型（2D和3D QSAR和基于配体的药效团作图研究）来估计效价，而分类模型（贝叶斯和递归分配分析）用于确定MMP-2抑制剂对MMP-9的选择性。贝叶斯模型指纹用于设计选择性先导分子，并使用基于结构的从头技术对其进行修饰。制备了一系列设计的分子，并分别针对MMP-2和MMP-9的抑制作用进行了筛选，因为这些是紧随其他MMP之后设计的，以观察到更广泛的选择性。最佳活性MMP-2抑制剂的IC50值为24nM，而最佳选择性抑制剂（IC50 = 51nM）对所有测试的MMP表现出对MMP-2的选择性是至少4倍。活性衍生物对人肺癌细胞系A549无细胞毒性。在非细胞毒性浓度下，这些抑制剂最多可将细胞内MMP-2表