5-nitro-6-(4-hydroxybutylamino)uracil

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机1,3-偶极化合物 - 烯丙基型1,3-偶极有机化合物
• 英文名称: 5-nitro-6-(4-hydroxybutylamino)uracil
• 英文别名: 6-(4-hydroxybutylamino)-5-nitropyrimidine-2,4-diol
• 化学式: C₈H₁₂N₄O₅
• 分子量: 244.207
• InChiKey: AWCONWOURUJNOX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-nitro-6-(4-hydroxybutylamino)uracil 在 sodium dithionite 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.08h， 以41%的产率得到6-<(4'-hydroxybutyl)amino>-5-amino-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
  参考文献：
  名称：

  有效地激活人T细胞的Ribitylaminouracil细菌代谢产物的脱氧和单羟基类似物的计算机建模和合成。

  摘要：

  5-（2-氧代丙基亚氨基氨基）-6-d-核糖基氨基尿嘧啶（5-OP-RU）是在细菌合成维生素B2的过程中形成的天然产物。它有效激活粘膜相关的不变T（MAIT）细胞，并具有免疫调节，炎症和抗癌特性。这种高度极性和不稳定的化合物在抗原呈递细胞中表达的主要组织相容性复合物I类相关蛋白（MR1）中与赖氨酸残基形成非常稳定的席夫碱。受5-OP-RU的核糖基部分与MAIT细胞上的MR1和T细胞受体（TCR）结合的重要性启发，在计算机上去除了每个OH。DFT计算和MD模拟显示，C3'-OH与尿嘧啶N1H之间存在非常稳定的氢键，这极大地限制了每个核糖基-OH的柔韧性和位置，可能会影响它们与MR1和TCR的交互。通过使用脱氧策略和动力学控制的亚胺形成，合成了4-OP-RU的四个单脱氧核糖基和四个单羟基烷基类似物，作为探测T细胞活化机制的新工具。

  DOI：

  10.1002/chem.201903732
• 作为产物：
  描述：

  4-氨基-1-丁醇 、 5-硝基-6-氯嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.25h， 以25%的产率得到5-nitro-6-(4-hydroxybutylamino)uracil
  参考文献：
  名称：

  合成新的无环嘧啶核苷类似物作为潜在的抗病毒药物。

  摘要：

  报道了6- [N-（4-羟基丁基）氨基]嘧啶酮​​衍生物18-23和无环膦酸酯核苷类似物29-30的合成。研究了它们的细胞毒性和抗病毒作用。2,5-二氨基-6- [N- [2-（膦酰基甲氧基）乙基]氨基]嘧啶-4（3H）-1（30）显示出强大的抗病毒作用，而21显示出明显的细胞毒活性。

  DOI：

  10.1021/jm00045a010

文献信息

• Synthesis of New Acyclic Pyrimidine Nucleoside Analogs as Potential Antiviral Drugs
  作者：Kurt Eger、Eberhard M. Kluender、Mathias Schmidt

  DOI：10.1021/jm00045a010

  日期：1994.9

  The synthesis of 6-[N-(4-hydroxybutyl)amino]pyrimidinone derivatives 18-23 and the acyclic phosphonate nucleoside analogs 29-30 is reported. Their cytotoxic and antiviral effects were investigated. 2,5-Diamino-6-[N-[2-(phosphonomethoxy)ethyl]amino]pyrimidin-4(3H)- one (30) showed strong antiviral effects, and 21 showed significant cytotoxic activity.

  报道了6- [N-（4-羟基丁基）氨基]嘧啶酮​​衍生物18-23和无环膦酸酯核苷类似物29-30的合成。研究了它们的细胞毒性和抗病毒作用。2,5-二氨基-6- [N- [2-（膦酰基甲氧基）乙基]氨基]嘧啶-4（3H）-1（30）显示出强大的抗病毒作用，而21显示出明显的细胞毒活性。
• Computer Modelling and Synthesis of Deoxy and Monohydroxy Analogues of a Ribitylaminouracil Bacterial Metabolite that Potently Activates Human T Cells
  作者：Geraldine J. M. Ler、Weijun Xu、Jeffrey Y. W. Mak、Ligong Liu、Paul V. Bernhardt、David P. Fairlie

  DOI：10.1002/chem.201903732

  日期：2019.12.5

  5-(2-Oxopropylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil (5-OP-RU) is a natural product formed during bacterial synthesis of vitamin B2. It potently activates mucosal associated invariant T (MAIT) cells and has immunomodulatory, inflammatory, and anticancer properties. This highly polar and unstable compound forms a remarkably stable Schiff base with a lysine residue in major histocompatibility complex class I-related

  5-（2-氧代丙基亚氨基氨基）-6-d-核糖基氨基尿嘧啶（5-OP-RU）是在细菌合成维生素B2的过程中形成的天然产物。它有效激活粘膜相关的不变T（MAIT）细胞，并具有免疫调节，炎症和抗癌特性。这种高度极性和不稳定的化合物在抗原呈递细胞中表达的主要组织相容性复合物I类相关蛋白（MR1）中与赖氨酸残基形成非常稳定的席夫碱。受5-OP-RU的核糖基部分与MAIT细胞上的MR1和T细胞受体（TCR）结合的重要性启发，在计算机上去除了每个OH。DFT计算和MD模拟显示，C3'-OH与尿嘧啶N1H之间存在非常稳定的氢键，这极大地限制了每个核糖基-OH的柔韧性和位置，可能会影响它们与MR1和TCR的交互。通过使用脱氧策略和动力学控制的亚胺形成，合成了4-OP-RU的四个单脱氧核糖基和四个单羟基烷基类似物，作为探测T细胞活化机制的新工具。