(S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid
• 英文别名: (2S)-2-[2-(6-aminopurin-9-yl)ethylamino]-3-phosphonopropanoic acid
• 化学式: C₁₀H₁₅N₆O₅P
• 分子量: 330.24
• InChiKey: RZABPFHILMTNTM-ZCFIWIBFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.37
• 重原子数：
  22.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  176.48
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N9-(2,2-二乙氧基乙基)腺嘌呤 在 2,6-二甲基吡啶 、 盐酸 、 三甲基溴硅烷 、 溴甲酚绿 、 sodium cyanoborohydride 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid
  参考文献：
  名称：

  探索用于抑制剂设计的 HIV-1 逆转录酶的 dNTP 结合位点

  摘要：

  HIV-1 逆转录酶 (RT) 在病毒生命周期中发挥着核心作用，FDA 批准的抗 HIV 药物中大约有一半针对 RT。核苷类似物 (NRTIs) 需要细胞磷酸化才能与 RT 结合，为了绕过这个限速路径，我们设计了一系列新的无环磷酸核苷类似物作为三磷酸核苷模拟物，旨在螯合催化 Mg 2+离子通过膦酸盐和/或羧酸基团。开发了新的合成程序来获取这些核苷膦酸盐类似物。与 HIV-1 RT/dsDNA 复合的 X 射线结构表明它们的结合模式与我们之前报道的化合物系列的结合模式不同。讨论了链长、手性和接头原子的影响。对这些新化合物的详细结构了解为设计新型 HIV-1 RT 抑制剂提供了机会。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2021.113785

文献信息

• Exploring the dNTP -binding site of HIV-1 reverse transcriptase for inhibitor design
  作者：Weijie Gu、Sergio Martinez、Abhimanyu K. Singh、Hoai Nguyen、Jef Rozenski、Dominique Schols、Piet Herdewijn、Kalyan Das、Steven De Jonghe

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.113785

  日期：2021.12

  HIV-1 reverse transcriptase (RT) plays a central role in the viral life cycle, and roughly half of the FDA-approved anti-HIV drugs are targeting RT. Nucleoside analogs (NRTIs) require cellular phosphorylation for binding to RT, and to bypass this rate-limiting path, we designed a new series of acyclic nucleoside phosphonate analogs as nucleoside triphosphate mimics, aiming at the chelation of the catalytic

  HIV-1 逆转录酶 (RT) 在病毒生命周期中发挥着核心作用，FDA 批准的抗 HIV 药物中大约有一半针对 RT。核苷类似物 (NRTIs) 需要细胞磷酸化才能与 RT 结合，为了绕过这个限速路径，我们设计了一系列新的无环磷酸核苷类似物作为三磷酸核苷模拟物，旨在螯合催化 Mg 2+离子通过膦酸盐和/或羧酸基团。开发了新的合成程序来获取这些核苷膦酸盐类似物。与 HIV-1 RT/dsDNA 复合的 X 射线结构表明它们的结合模式与我们之前报道的化合物系列的结合模式不同。讨论了链长、手性和接头原子的影响。对这些新化合物的详细结构了解为设计新型 HIV-1 RT 抑制剂提供了机会。