(R)-N-(4-((S)-3-methoxy-1-((R)-2-methyloct-7-ynoyl)-5-oxo-2,5-dihydro-1H- pyrrol-2-yl)butyl)-2-methyloct-7-ynamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (R)-N-(4-((S)-3-methoxy-1-((R)-2-methyloct-7-ynoyl)-5-oxo-2,5-dihydro-1H- pyrrol-2-yl)butyl)-2-methyloct-7-ynamide
• 英文别名: doscadenamide A；Doscadenamide A；(2R)-N-[4-[(2S)-3-methoxy-1-[(2R)-2-methyloct-7-ynoyl]-5-oxo-2H-pyrrol-2-yl]butyl]-2-methyloct-7-ynamide
• 化学式: C₂₇H₄₀N₂O₄
• 分子量: 456.626
• InChiKey: IDXOHNKKJPWXGM-ZLNRFVROSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  75.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-N-(4-((S)-3-methoxy-1-((R)-2-methyloct-7-ynoyl)-5-oxo-2,5-dihydro-1H- pyrrol-2-yl)butyl)-2-methyloct-7-ynamide 在 吡啶 、 copper(l) iodide 、 copper diacetate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以80%的产率得到doscadenamide S15
  参考文献：
  名称：

  双功能多卡登胺激活革兰氏阴性菌的群体感应并与 TRAIL 协同诱导癌细胞凋亡

  摘要：

  报道了源自蓝藻的新型双功能多卡登酰胺 A 类似物，多卡登酰胺 A 是铜绿假单胞菌中一种 LasR 依赖性群体感应 (QS) 激活剂，其特征是吡咯啉酮核心结构和侧链伯胺双酰化，形成酰亚胺/酰胺杂化物。通过全合成确认了多斯卡登酰胺 B–J 的特性，并创建了具有不同酰化和不饱和模式的战略重点库。通过突变研究和分子对接确定了与 LasR 结合的关键分子相互作用和功能反应。在包括铜绿假单胞菌和哈维氏弧菌在内的各种革兰氏阴性细菌中探讨了结构-活性关系（SAR），表明吡咯啉酮-N酰基链对于完全激动剂活性至关重要，而其他酰基链是可有可无的或可能导致拮抗剂活性，取决于细菌系统。由于高丝氨酸内酯 (HSL) 群体感应激活剂已被证明与 TRAIL 协同作用以诱导癌细胞凋亡，因此在正交真核筛选系统中测试了选定的多卡登酰胺。最有效的 QS 激动剂多卡登酰胺 S10-S12，以及酰基侧链部分或完全饱和的多卡登酰胺 F

  DOI：

  10.1021/acs.jnatprod.0c01003
• 作为产物：
  描述：

  (R)-2-methyloct-7-ynoic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 (R)-N-(4-((S)-3-methoxy-1-((R)-2-methyloct-7-ynoyl)-5-oxo-2,5-dihydro-1H- pyrrol-2-yl)butyl)-2-methyloct-7-ynamide
  参考文献：
  名称：

  Doscadenamide A 的发现和全合成：来自海洋蓝藻的群体感应信号分子。

  摘要：

  群体感应 (QS) 在细菌发病机制的调节中起关键作用。Doscadenamide A ( 1a ) 从海洋蓝藻中分离得到，其结构通过 NMR 阐明，其活性与 QS 诱导有关。开发了1a的全合成方法，通过将分离的天然产物与合成的非对映异构体进行比较，确认了绝对构型。我们的初步调查表明，1a可以以依赖 LasR 的方式激活 QS 信号传导。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.9b02525

文献信息

• Discovery and Total Synthesis of Doscadenamide A: A Quorum Sensing Signaling Molecule from a Marine Cyanobacterium
  作者：Xiao Liang、Susan Matthew、Qi-Yin Chen、Jason C. Kwan、Valerie J. Paul、Hendrik Luesch

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b02525

  日期：2019.9.20

  Quorum sensing (QS) plays a critical role in the regulation of bacterial pathogenesis. Doscadenamide A (1a) was isolated from a marine cyanobacterium, its structure elucidated by NMR, and its activity linked to QS induction. The total synthesis of 1a was developed, and the absolute configuration confirmed through comparison of the isolated natural product with synthetic diastereomers. Our preliminary

  群体感应 (QS) 在细菌发病机制的调节中起关键作用。Doscadenamide A ( 1a ) 从海洋蓝藻中分离得到，其结构通过 NMR 阐明，其活性与 QS 诱导有关。开发了1a的全合成方法，通过将分离的天然产物与合成的非对映异构体进行比较，确认了绝对构型。我们的初步调查表明，1a可以以依赖 LasR 的方式激活 QS 信号传导。
• [EN] DISCOVERY, TOTAL SYNTHESIS, AND BIOACTIVITY OF DOSCADENAMIDES<br/>[FR] DÉCOUVERTE, SYNTHÈSE TOTALE ET BIOACTIVITÉ DE DOSCADENAMIDES
  申请人：UNIV FLORIDA

  公开号：WO2021021629A1

  公开（公告）日：2021-02-04

  The invention is directed towards compounds (e.g., Formulae (I)-(IX)), their mechanism of action, processes to prepare the compounds, methods of activating quorum sensing signaling activity, and methods of treating diseases and disorders using the compounds described herein (e.g., Formulae (I)-(IX)).

  这项发明涉及化合物（例如，式（I）-（IX）），它们的作用机制，制备这些化合物的方法，激活群体感应信号活性的方法，以及利用本文描述的化合物治疗疾病和疾病的方法（例如，式（I）-（IX））。
• Bifunctional Doscadenamides Activate Quorum Sensing in Gram-Negative Bacteria and Synergize with TRAIL to Induce Apoptosis in Cancer Cells
  作者：Xiao Liang、Qi-Yin Chen、Gustavo M. Seabra、Susan Matthew、Jason C. Kwan、Chenglong Li、Valerie J. Paul、Hendrik Luesch

  DOI：10.1021/acs.jnatprod.0c01003

  日期：2021.3.26

  sensing (QS) activator in Pseudomonas aeruginosa, characterized by dual acylation of the pyrrolinone core structure and the pendant side chain primary amine to form an imide/amide hybrid are reported. The identities of doscadenamides B–J were confirmed through total synthesis and a strategic focused library with different acylation and unsaturation patterns was created. Key molecular interactions for

  报道了源自蓝藻的新型双功能多卡登酰胺 A 类似物，多卡登酰胺 A 是铜绿假单胞菌中一种 LasR 依赖性群体感应 (QS) 激活剂，其特征是吡咯啉酮核心结构和侧链伯胺双酰化，形成酰亚胺/酰胺杂化物。通过全合成确认了多斯卡登酰胺 B–J 的特性，并创建了具有不同酰化和不饱和模式的战略重点库。通过突变研究和分子对接确定了与 LasR 结合的关键分子相互作用和功能反应。在包括铜绿假单胞菌和哈维氏弧菌在内的各种革兰氏阴性细菌中探讨了结构-活性关系（SAR），表明吡咯啉酮-N酰基链对于完全激动剂活性至关重要，而其他酰基链是可有可无的或可能导致拮抗剂活性，取决于细菌系统。由于高丝氨酸内酯 (HSL) 群体感应激活剂已被证明与 TRAIL 协同作用以诱导癌细胞凋亡，因此在正交真核筛选系统中测试了选定的多卡登酰胺。最有效的 QS 激动剂多卡登酰胺 S10-S12，以及酰基侧链部分或完全饱和的多卡登酰胺 F