N-tert-butoxycarbonyl-β-alanine cyanomethyl ester

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-tert-butoxycarbonyl-β-alanine cyanomethyl ester
• 英文别名: cyanomethyl 3-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate；Cyanomethyl 3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoate；cyanomethyl 3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoate
• 化学式: C₁₀H₁₆N₂O₄
• mdl: MFCD24388929
• 分子量: 228.248
• InChiKey: NIFLAVJDWRGXAB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  88.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-tert-butoxycarbonyl-β-alanine cyanomethyl ester 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 以92%的产率得到cyanomethyl 3-aminopropanoate hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  叔丁氧羰基（Boc）–合成各种天然/非天然N-未保护氨基酸氰基甲基酯时N-保护/去保护的战略基团

  摘要：

  由于它们的合成和医学重要性，合成了许多具有未保护的氨基官能度的天然/非天然氨基酸的氰基甲基酯。彻底筛选了在不稳定（水解敏感性）氰甲基官能团存在下的重要N- Boc脱保护方法，发现在1,4-二恶烷溶液（2-4当量）中易于获得的4M HCl。乙腈，0°C，2-4 h是合适的条件。此条件已被推广，并成功应用于各种烷基，炔基，芳基，杂芳基，苄基，叠氮基，螺氨基酸氰基甲基酯，而与胺的性质（伯或仲）以及胺与酯基之间的距离无关最终脱保护的氨基酯，具有较高的收率和纯度（与其他通常已知的相比）N-保护基（Cbz，Fmoc，Ac，Bn，Bz等）。还证明了与N-未保护的对应物相比，N- Boc保护的氨基酸氰基甲基酯足够稳定以进行进一步的官能化。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2018.10.041
• 作为产物：
  描述：

  Boc-beta-丙氨酸 、 氯乙腈 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以52%的产率得到N-tert-butoxycarbonyl-β-alanine cyanomethyl ester
  参考文献：
  名称：

  叔丁氧羰基（Boc）–合成各种天然/非天然N-未保护氨基酸氰基甲基酯时N-保护/去保护的战略基团

  摘要：

  由于它们的合成和医学重要性，合成了许多具有未保护的氨基官能度的天然/非天然氨基酸的氰基甲基酯。彻底筛选了在不稳定（水解敏感性）氰甲基官能团存在下的重要N- Boc脱保护方法，发现在1,4-二恶烷溶液（2-4当量）中易于获得的4M HCl。乙腈，0°C，2-4 h是合适的条件。此条件已被推广，并成功应用于各种烷基，炔基，芳基，杂芳基，苄基，叠氮基，螺氨基酸氰基甲基酯，而与胺的性质（伯或仲）以及胺与酯基之间的距离无关最终脱保护的氨基酯，具有较高的收率和纯度（与其他通常已知的相比）N-保护基（Cbz，Fmoc，Ac，Bn，Bz等）。还证明了与N-未保护的对应物相比，N- Boc保护的氨基酸氰基甲基酯足够稳定以进行进一步的官能化。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2018.10.041

文献信息

• Incorporation of Fluorescent-Labeled Non-α-Amino Carboxylic Acids into the N-Terminus of Proteins in Response to Amber Initiation Codon
  作者：Masanori Miura、Norihito Muranaka、Ryoji Abe、Takahiro Hohsaka

  DOI：10.1246/bcsj.20090320

  日期：2010.5.15

  Incorporation of non-natural amino acid derivatives containing fluorescent groups into proteins is a useful method for protein analyses. Here, we investigated the incorporation of fluorescent-labeled non-α-amino carboxylic acids into the N-terminus of proteins in response to the UAG initiation codon. A series of TAMRA-labeled amino carboxylic acids were synthesized and attached to an amber suppressor initiator tRNA derived from Escherichia coli initiator tRNA. Fluorescent-labeled amino carboxylic acids were successfully incorporated into the N-terminus of streptavidin by adding TAMRA-acylated initiator tRNAs to an E. coli cell-free translation system, although the incorporation efficiency differed depending on the amino carboxylic acid chain length. Based on this observation, 3-aminopropionic acid derivatives labeled with BODIPY, rhodamine, and cyanine fluorophores were designed and synthesized. The fluorescent-labeled 3-aminopropionic acid derivatives developed using BODIPY and rhodamine dyes could be incorporated with good efficiency. On the other hand, 6-aminohexanoic acid was effectively incorporated when labeled with cyanine dyes. The present study demonstrates that translation initiation can accept a wide variety of non-natural substrates and provides a useful method for N-terminal-specific labeling of proteins with various fluorophores.

  将含荧光基团的非天然氨基酸衍生物掺入蛋白质中是一种有用的蛋白质分析方法。在此，我们研究了在UAG起始密码子的响应下，将荧光标记的非α-氨基酸羧酸掺入蛋白质N末端的过程。合成了一系列TAMRA标记的氨基酸羧酸，并将其连接到由大肠杆菌起始tRNA衍生的琥珀抑制起始tRNA上。通过向大肠杆菌无细胞翻译系统中添加TAMRA酰化的起始tRNA，成功地将荧光标记的氨基酸羧酸掺入链霉亲和素的N末端，尽管掺入效率因氨基酸羧酸链长而异。基于这一观察，设计并合成了使用BODIPY、罗丹明和花菁荧光染料标记的3-氨基丙酸衍生物。使用BODIPY和罗丹明染料开发的荧光标记3-氨基丙酸衍生物可以高效掺入。另一方面，当使用花菁染料标记时，6-氨基己酸可以有效掺入。本研究表明，翻译起始可以接受各种非天然底物，并提供了一种有用的方法，用于使用各种荧光团对蛋白质N末端进行特异性标记。
• PEPTIDE-COMPOUND CYCLIZATION METHOD
  申请人：Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha

  公开号：US20150080549A1

  公开（公告）日：2015-03-19

  An object of the present invention is to provide methods of discovering drugs effective for tough targets, which have conventionally been discovered only with difficulty. The present invention relates to novel methods for cyclizing peptide compounds, and novel peptide compounds and libraries comprising the same, to achieve the above object.

  本发明的目的是提供一种发现对于难以处理的靶点有效的药物的方法，这些药物通常很难被发现。本发明涉及新型的环化肽化合物的方法，以及包含这些化合物的新型肽库，以实现上述目的。
• Unexpected Preference of the <i>E. coli</i> Translation System for the Ester Bond during Incorporation of Backbone-Elongated Substrates
  作者：Shinsuke Sando、Kenji Abe、Nobuhiko Sato、Toshihiro Shibata、Keigo Mizusawa、Yasuhiro Aoyama

  DOI：10.1021/ja068033n

  日期：2007.5.1

  There have been recent advances in the ribosomal synthesis of various molecules composed of nonnatural ribosomal substrates. However, the ribosome has strict limitations on substrates with elongated backbones. Here, we show an unexpected loophole in the E. coli translation system, based on a remarkable disparity in its selectivity for beta-amino/hydroxy acids. We challenged beta-hydroxypropionic acid (beta-HPA), which is less nucleophilic than beta-amino acids but free from protonation, to produce a new repertoire of ribosome-compatible but main-chain-elongated substrates. PAGE analysis and mass-coupled S-tag assays of amber suppression experiments using yeast suppressor tRNA(CUA)(Phe) confirmed the actual incorporation of beta-HPA into proteins/oligopeptides. We investigated the side-chain effects of beta-HPA and found that the side chain at position alpha and R stereochemistry of the beta-substrate is preferred and even notably enhances the efficiency of incorporation as compared to the parent substrate. These results indicate that the E. coli translation machinery can utilize main-chain-elongated substrates if the pK(a) of the substrate is appropriately chosen.
• EP2813512B1
  申请人：——

  公开号：EP2813512B1

  公开（公告）日：2021-03-31
• US9409952B2
  申请人：——

  公开号：US9409952B2

  公开（公告）日：2016-08-09