Activation loop targeting strategy for design of receptor-interacting protein kinase 2 (RIPK2) inhibitors
作者:Chalada Suebsuwong、Daniel M. Pinkas、Soumya S. Ray、Joshua C. Bufton、Bing Dai、Alex N. Bullock、Alexei Degterev、Gregory D. Cuny
DOI:10.1016/j.bmcl.2018.01.044
日期:2018.2
receptor-interacting protein kinase 2 (RIPK2) inhibitors based on pan-kinase inhibitor regorafenib that aim to engage basic activation loop residues Lys169 or Arg171. We report development of CSR35 that displayed >10-fold selective inhibition of RIPK2 versus VEGFR2, the target of regorafenib. A co-crystal structure of CSR35 with RIPK2 revealed a resolved activation loop with an ionic interaction between
由于家族成员之间的氨基酸序列相似性很大,特别是在ATP结合位点,选择性激酶抑制剂的开发仍然是一个挑战。靶向激活环可能会提供更好的抑制剂选择性,因为该激酶区域的保守性较低。然而,由于激活环的灵活性,该策略存在困难。在本文中,我们报告了基于泛激酶抑制剂雷戈非尼的受体相互作用蛋白激酶2(RIPK2)抑制剂的设计,其目的是参与基本的激活环残基Lys169或Arg171。我们报道了CSR35的发展,该研究显示RIPK2与VEGFR2(regorafenib的靶标)> 10倍的选择性抑制。CSR35的共晶体结构用RIPK2进行的分析揭示了一个固定的活化环,该环在抑制剂中所安装的羧酸与Lys169的侧链之间具有离子相互作用。我们的数据提供了开发靶向II型激活环的抑制剂作为实现提高选择性的补充策略的原则可行性。