(3aR,5R,6S,6aR)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: (3aR,5R,6S,6aR)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde
• 英文别名: (3aR,5R,6S,6aR)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde
• 化学式: C₃₆H₄₀O₆Si
• 分子量: 596.795
• InChiKey: RWZDPWPBKUHOAQ-ORAXTSPASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.75
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  63.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aR,5R,6S,6aR)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde 在 硫酸 吡啶 、 sodium azide 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 cerium(III) chloride 、 sodium cyanoborohydride 、 potassium carbonate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 125.08h， 生成 1-((1R,3R,4R,6S,7S)-7-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-5,6-dimethyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  [EN] SUBSTITUTED 2 '-AMINO AND 2 '-THIO-BICYCLIC NUCLEOSIDES AND OLIGOMERIC COMPOUNDS PREPARED THEREFROM
  [FR] 2'-AMINO- ET 2'-THIO-NUCLÉOSIDES BICYCLIQUES SUBSTITUÉS ET COMPOSÉS OLIGOMÈRES PRÉPARÉS À PARTIR DE CES DERNIERS

  摘要：

  本文提供了由2'-氨基和2'-硫代双环核苷和寡聚物化合物制备而成。本文提供的新型双环核苷预计可用于增强其所包含的寡聚物化合物的一个或多个性质，如核酸酶抗性。

  公开号：

  WO2011156202A1
• 作为产物：
  描述：

  1,2:5,6-二异亚丙基-alpha-D-异呋喃糖 在 sodium periodate 、 草酰氯 、 水 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 108.09h， 生成 (3aR,5R,6S,6aR)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  [EN] TRICYCLIC NUCLEIC ACID ANALOGS
  [FR] ANALOGUES TRICYCLIQUES D'ACIDE NUCLÉIQUE

  摘要：

  本公开提供了由此制备的三环核苷和寡聚化合物。这些三环核苷每个都具有一个三环核糖糖基，其中2'和4'核糖环碳原子之间的桥进一步包括一个融合的碳环或杂环。预计这些三环核苷对增强寡聚化合物的性质将会有用，例如结合亲和力和核酸酶抗性。

  公开号：

  WO2013154798A1

文献信息

• [EN] TRICYCLIC NUCLEIC ACID ANALOGS<br/>[FR] ANALOGUES TRICYCLIQUES D'ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2013154798A1

  公开（公告）日：2013-10-17

  The present disclosure provides tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom. The tricyclic nucleosides each have a tricyclic ribosyl sugar moiety wherein a bridge between the 2' and 4' ribosyl ring carbon atoms further comprises a fused carbocyclic or heterocyclic ring. The tricyclic nucleosides are expected to be useful for enhancing properties of oligomeric compounds including for example binding affinity and nuclease resistance.

  本公开提供了由此制备的三环核苷和寡聚化合物。这些三环核苷每个都具有一个三环核糖糖基，其中2'和4'核糖环碳原子之间的桥进一步包括一个融合的碳环或杂环。预计这些三环核苷对增强寡聚化合物的性质将会有用，例如结合亲和力和核酸酶抗性。
• [EN] TRICYCLIC NUCLEOSIDES AND OLIGOMERIC COMPOUNDS PREPARED THEREFROM<br/>[FR] NUCLÉOSIDES TRICYCLIQUES ET COMPOSÉS OLIGOMÈRES PRÉPARÉS À PARTIR DE CEUX-CI
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2013154799A1

  公开（公告）日：2013-10-17

  The present disclosure provides tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom. More particularly, the tricyclic nucleosides provided herein comprise a tricyclic ribosyl sugar moiety having a bridge between the 4' and 2' ring carbon atoms and a further fused carbocyclic or heterocyclic ring at the 3' and 4' carbon atoms. The tricyclic nucleosides are expected to be useful for enhancing properties of oligomeric compounds including for example binding affinity and nuclease resistance.

  本公开提供了三环核苷和由此制备的寡聚化合物。更具体地，本文提供的三环核苷包括具有在4'和2'环碳原子之间的桥的三环核糖糖基，并且在3'和4'碳原子处具有进一步融合的碳环或杂环。预计这些三环核苷对增强寡聚化合物的性质（例如结合亲和力和核酸酶抗性）将会有用。
• Design, synthesis, and duplex-stabilizing properties of conformationally constrained tricyclic analogues of LNA
  作者：Robert D. Giacometti、Juan C. Salinas、Michael E. Østergaard、Eric E. Swayze、Punit P. Seth、Stephen Hanessian

  DOI：10.1039/c5ob02576a

  日期：——

  The design, synthesis and biophysical evaluation of two highly-constrained tricyclic analogues of locked nucleic acid (LNA), which restrict rotation around the C4′–C5′-exocyclic bond (torsion angle γ) and enhance hydrophobicity in the minor groove and along the major groove, are reported. A structural model that provides insights into the sugar–phosphate backbone conformations required for efficient

  设计，合成和生物物理评估的两个高度受限的锁核酸三环类似物（LNA），它们限制了围绕C4'-C5'-外环键（扭转角γ）的旋转并增强了小沟和小沟中的疏水性大槽，有报道。还提出了一种结构模型，可提供对与互补核酸进行有效杂交所需的糖-磷酸盐骨架构象的见解。
• 6-Disubstituted Or Unsaturated Bicyclic Nucleic Acid Analogs
  申请人：Seth Punit P.

  公开号：US20110053881A1

  公开（公告）日：2011-03-03

  The present disclosure describes 6-disubstituted bicyclic nucleosides, oligomeric compounds prepared therefrom and methods of using the oligomeric compounds. More particularly, the 6-disubstituted bicyclic nucleosides each comprise a 2′-O—C(Ri)(R2)-4′ or 2′-O—C=(R3)(R.4)-4′ bridge wherein each R is, independently a substituent group and Ri and R2 include H. The 6-disubstituted bicyclic nucleosides are useful for enhancing properties of oligomeric compounds including nuclease resistance. In certain embodiments, the oligomeric compounds provided herein hybridize to a portion of a target RNA resulting in loss of normal function of the target RNA.

  本公开描述了6-二取代双环核苷酸、从中制备的寡聚化合物以及使用这些寡聚化合物的方法。更具体地说，这些6-二取代双环核苷酸每个包括一个2′-O—C(Ri)(R2)-4′或2′-O—C=(R3)(R4)-4′桥，其中每个R独立地是一个取代基，而Ri和R2包括H。这些6-二取代双环核苷酸对增强包括核酸酶抗性在内的寡聚化合物的性质是有用的。在某些实施例中，本文提供的寡聚化合物与靶RNA的部分杂交，导致靶RNA的正常功能丧失。
• BICYCLIC MORPHOLINO COMPOUNDS AND OLIGOMERIC COMPOUNDS PREPARED THEREFROM
  申请人：Ionis Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20160186175A1

  公开（公告）日：2016-06-30

  The present invention provides bicyclic morpholino compounds and oligomeric compounds prepared therefrom. More particularly, incorporation of one or more of the bicyclic morpholino compounds into an oligomeric compound is expected to enhance one or more properties of the oligomeric compound. Such oligomeric compounds can also be included in a double stranded composition. In certain embodiments, the oligomeric compounds provided herein are expected to hybridize to a portion of a target RNA resulting in loss of normal function of the target RNA.

  本发明提供双环吗啉化合物及其制备的寡聚化合物。更具体地，将一个或多个双环吗啉化合物并入寡聚化合物中，预计会增强寡聚化合物的一种或多种性质。此类寡聚化合物也可以包含在双链结构中。在某些实施例中，本发明提供的寡聚化合物预计会与目标RNA的一部分杂交，导致目标RNA的正常功能丧失。