Isobutyryl-N-acetylcysteamine-thioester

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Isobutyryl-N-acetylcysteamine-thioester
• 英文别名: S-(2-acetamidoethyl) 2-methylpropanethioate
• 化学式: C₈H₁₅NO₂S
• 分子量: 189.279
• InChiKey: VSBYVFUCIINVNR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  71.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-羟基-3-(4-羟基苯基)-3,4-二氢-1H-异色烯-1-酮 、 Isobutyryl-N-acetylcysteamine-thioester 在 Streptomyces violaceoruber strain 3844-33C 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 20-(2-Acetylaminoethylsulfanyl)kendomycin
  参考文献：
  名称：

  霉素的生物合成：氧原子的起源和进一步的研究

  摘要：

  结构独特的聚酮化合物抗生素kendomycin 1的所有氧原子的起源是通过向[ Violaceoruber （Streptomyces violaceoruber）（菌株）喂入[1- 13 C，18 O 2 ]乙酸盐，[1- 13 C，18 O 2 ]丙酸盐和18 O 2来证实的。3844-33C）可以更详细地了解1的生物合成。通过将最近的文献数据与对霉素的生物合成的需求进行比较，可以获得有关必须参与查耳酮合酶（CHS）的起始单元的生物合成的更多信息。通过向该菌株中另外加入[2- 13 C]丙二酸和[1,4- 13 C 2 ]琥珀酸来研究将乙酸酯掺入先前报道的甲基丙二酸增量剂单元中。结果，证明了甲基丙二酰辅酶A的两个独立途径的共存。此外，N-乙酰基半胱胺和其他硫醇的进料导致以高收率形成新的霉素衍生物2和3。

  DOI：

  10.1039/b003362f
• 作为产物：
  描述：

  N-乙酰基半胱胺 、 异丁酸 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 Isobutyryl-N-acetylcysteamine-thioester
  参考文献：
  名称：

  阿维菌素模块化聚酮化合物合酶的负载酰基转移酶的结构和功能分析

  摘要：

  模块化聚酮化合物合酶（PKS）的负载酰基转移酶（AT）结构域控制掺入聚酮化合物中的起始单元的选择，因此是模块化PKSs工程的有吸引力的目标。在这里，我们报道了来自阿维菌素模块化PKS的负载AT的结构和生化特征，阿维菌素模块化PKS接受40多种羧酸作为一系列同类物生物合成的替代起始单元。从模块化PKS加载AT的首次结构分析揭示了轻松的底物特异性的分子基础。通过将底物建模到活性位点，可以预测对底物结合和识别重要的残基。通过活性位点残基的定点诱变产生了对一组合成底物模拟物具有改变的特异性的突变体。在基板的C-2位置呈S构型。总之，这些结果为通过装载模块化PKS的AT域的活性位点工程进行聚酮化合物的区域特定修饰奠定了基础。

  DOI：

  10.1021/cb500873k

文献信息

• A mechanism-based fluorescence transfer assay for examining ketosynthase selectivity
  作者：Gitanjeli Prasad、Lawrence S. Borketey、Tsung-Yi Lin、Nathan A. Schnarr

  DOI：10.1039/c2ob26008e

  日期：——

  Since their discovery, polyketide synthases have received massive attention from researchers hoping to harness their potential as a platform for generating new and improved therapeutics. Despite significant strides toward this end, inherent specificities within the enzymes responsible for polyketide production have severely limited these efforts. We have developed a mechanism-based, fluorescence transfer assay for a key enzyme component of all polyketide synthases, the ketosynthase domain. As demonstrated, this method can be used with both ketosynthase-containing didomains and full modules. As proof of principle, the ketosynthase domain from module 6 of the 6-deoxyerythronolide synthase is examined for its ability to accept a variety of simple thioester substrates. Consistent with its natural hexaketide substrate, we find that this ketosynthase prefers longer, α-branched thioesters and its ability to distinguish these structural features is quite remarkable. Substrate electronics are also tested via a variety of p-substituted aromatic groups. In all, we expect this technique to find considerable use in the field of polyketide biosynthesis and engineering due to its extraordinary simplicity and very distinct visible readout.

  自其发现以来，聚酮合酶一直受到研究人员的极大关注，他们希望利用其潜力作为平台，生成新的和改进的治疗药物。尽管在这方面取得了重大进展，但负责聚酮生产的酶中固有的特定性严重限制了这些努力。我们开发了一种基于机制的、通过荧光传递的测定方法，用于所有聚酮合酶的关键酶组成部分，即酮合酶结构域。如所示，这种方法可以用于含有酮合酶的双结构域和完整模块。作为原理验证，我们检验了来自6-脱氧赤酮酸合酶模块6的酮合酶结构域，以评估其对各种简单硫酯底物的接受能力。与其天然六酮底物一致，我们发现该酮合酶偏好较长的、α-分支的硫酯，并且其区分这些结构特征的能力相当显著。通过各种对位取代的芳香族基团也测试了底物电子性质。总之，我们预计这项技术将在聚酮生物合成和工程领域得到广泛应用，因为它极其简单且具有非常明显的可见输出。
• A Highly Promiscuous ß-Ketoacyl-ACP Synthase (KAS) III-like Protein Is Involved in Pactamycin Biosynthesis
  作者：Mostafa E. Abugrain、Corey J. Brumsted、Andrew R. Osborn、Benjamin Philmus、Taifo Mahmud

  DOI：10.1021/acschembio.6b01043

  日期：2017.2.17

  β-Ketoacyl–acyl carrier protein (β-Ketoacyl-ACP) synthase (KAS) III catalyzes the first step in fatty acid biosynthesis, involving a Claisen condensation of the acetyl-CoA starter unit with the first extender unit, malonyl-ACP, to form acetoacetyl-ACP. KAS III-like proteins have also been reported to catalyze acyltransferase reactions using coenzyme A esters or discrete ACP-bound substrates. Here,

  β-酮酰基-酰基载体蛋白（β-酮酰基-ACP）合酶（KAS）III催化脂肪酸生物合成的第一步，涉及乙酰辅酶A起始剂单元与第一扩展剂丙二酰-ACP的克莱森缩合反应。形成乙酰乙酰基ACP。还报道了使用辅助酶A酯或离散的ACP结合底物催化类似KAS III的蛋白质催化酰基转移酶反应。在这里，我们报道了KAS III样蛋白（PtmR）的体内和体外表征，该蛋白直接将6-甲基水杨基部分从迭代I型聚酮化合物合酶转移到氨基酚戊酰胺生物合成中的氨基环戊糖醇单元中。PtmR是高度混杂的，可识别各种各样的S-酰基-N-乙酰半胱胺为底物，可生产出一系列具有多种烷基和芳香族特征的pactamycin衍生物。结果表明，KAS III样蛋白可用作修饰复杂天然产物的多功能工具。
• Characterization of AntB, a Promiscuous Acyltransferase Involved in Antimycin Biosynthesis
  作者：Moriah Sandy、Xuejun Zhu、Zhe Rui、Wenjun Zhang

  DOI：10.1021/ol4014365

  日期：2013.7.5

  The in vivo and in vitro characterization of AntB, a dedicated acyltransferase encoded in the antimycin biosynthetic gene cluster, which catalyzes the C-8 acyloxy formation is reported. It is demonstrated that AntB has broad substrate specificity toward both the acyl substrate and the acyl carrier and produces more antimycin analogues with varying C-8 acyloxy moieties.
• Structural and Functional Analysis of the Loading Acyltransferase from Avermectin Modular Polyketide Synthase
  作者：Fen Wang、Yanjie Wang、Junjie Ji、Zhan Zhou、Jingkai Yu、Hua Zhu、Zhiguo Su、Lixin Zhang、Jianting Zheng

  DOI：10.1021/cb500873k

  日期：2015.4.17

  of congeners. This first structural analysis of loading ATs from modular PKSs revealed the molecular basis for the relaxed substrate specificity. Residues important for substrate binding and discrimination were predicted by modeling a substrate into the active site. A mutant with altered specificity toward a panel of synthetic substrate mimics was generated by site-directed mutagenesis of the active

  模块化聚酮化合物合酶（PKS）的负载酰基转移酶（AT）结构域控制掺入聚酮化合物中的起始单元的选择，因此是模块化PKSs工程的有吸引力的目标。在这里，我们报道了来自阿维菌素模块化PKS的负载AT的结构和生化特征，阿维菌素模块化PKS接受40多种羧酸作为一系列同类物生物合成的替代起始单元。从模块化PKS加载AT的首次结构分析揭示了轻松的底物特异性的分子基础。通过将底物建模到活性位点，可以预测对底物结合和识别重要的残基。通过活性位点残基的定点诱变产生了对一组合成底物模拟物具有改变的特异性的突变体。在基板的C-2位置呈S构型。总之，这些结果为通过装载模块化PKS的AT域的活性位点工程进行聚酮化合物的区域特定修饰奠定了基础。
• Biosynthesis of kendomycin: origin of the oxygen atoms and further investigations
  作者：Helge B. Bode、Axel Zeeck

  DOI：10.1039/b003362f

  日期：——

  the structurally unique polyketide antibiotic kendomycin 1 was confirmed by feeding [1-13C,18O2]acetate, [1-13C,18O2]propionate and 18O2 to Streptomyces violaceoruber (strain 3844-33C) resulting in a more detailed insight into the biosynthesis of 1. Further information about the biosynthesis of the starter unit in which a chalcone synthase (CHS) must be involved was obtained from comparison of recent

  结构独特的聚酮化合物抗生素kendomycin 1的所有氧原子的起源是通过向[ Violaceoruber （Streptomyces violaceoruber）（菌株）喂入[1- 13 C，18 O 2 ]乙酸盐，[1- 13 C，18 O 2 ]丙酸盐和18 O 2来证实的。3844-33C）可以更详细地了解1的生物合成。通过将最近的文献数据与对霉素的生物合成的需求进行比较，可以获得有关必须参与查耳酮合酶（CHS）的起始单元的生物合成的更多信息。通过向该菌株中另外加入[2- 13 C]丙二酸和[1,4- 13 C 2 ]琥珀酸来研究将乙酸酯掺入先前报道的甲基丙二酸增量剂单元中。结果，证明了甲基丙二酰辅酶A的两个独立途径的共存。此外，N-乙酰基半胱胺和其他硫醇的进料导致以高收率形成新的霉素衍生物2和3。