5-(5-(3-hydroxyprop-1-yn-1-yl)thiophen-2-yl)-2,4-dimethoxy-N-((3-methoxyphenyl)sulfonyl)benzamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 5-(5-(3-hydroxyprop-1-yn-1-yl)thiophen-2-yl)-2,4-dimethoxy-N-((3-methoxyphenyl)sulfonyl)benzamide
• 英文别名: 5-[5-(3-Hydroxyprop-1-Yn-1-Yl)thiophen-2-Yl]-2,4-Dimethoxy-N-[(3-Methoxyphenyl)sulfonyl]benzamide；5-[5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)thiophen-2-yl]-2,4-dimethoxy-N-(3-methoxyphenyl)sulfonylbenzamide
• 化学式: C₂₃H₂₁NO₇S₂
• 分子量: 487.554
• InChiKey: GFHHFWCGCHIDBF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  148
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-溴-2,4-二羟基苯酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 potassium phosphate 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 copper(l) iodide 、 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 、 lithium hydroxide monohydrate 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 37.0h， 生成 5-(5-(3-hydroxyprop-1-yn-1-yl)thiophen-2-yl)-2,4-dimethoxy-N-((3-methoxyphenyl)sulfonyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  使用基于结构的药物设计从片段命中登革热病毒RNA依赖性RNA聚合酶的有效非核苷抑制剂的发现。

  摘要：

  描述了非核苷登革热病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）抑制剂的发现和优化。基于X射线的诺华碎片收集片段筛选结果鉴定出联苯乙酸片段3，该片段结合在RdRp的棕榈亚结构域中。依靠基于结构的设计，随后对片段命中3的优化使体外效能提高了> 1000倍，并在基于细胞的测定中获得了对所有四种低微摩尔EC 50血清型的抗登革热活性。主要候选物27与RdRp的棕榈亚结构域中的新的结合口袋相互作用，并针对所有临床相关的登革热血清型发挥有希望的活性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b00143

文献信息

• Discovery of Potent Non-Nucleoside Inhibitors of Dengue Viral RNA-Dependent RNA Polymerase from a Fragment Hit Using Structure-Based Drug Design
  作者：Fumiaki Yokokawa、Shahul Nilar、Christian G. Noble、Siew Pheng Lim、Ranga Rao、Stefani Tania、Gang Wang、Gladys Lee、Jürg Hunziker、Ratna Karuna、Ujjini Manjunatha、Pei-Yong Shi、Paul W. Smith

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00143

  日期：2016.4.28

  The discovery and optimization of non-nucleoside dengue viral RNA-dependent-RNA polymerase (RdRp) inhibitors are described. An X-ray-based fragment screen of Novartis’ fragment collection resulted in the identification of a biphenyl acetic acid fragment 3, which bound in the palm subdomain of RdRp. Subsequent optimization of the fragment hit 3, relying on structure-based design, resulted in a >1000-fold

  描述了非核苷登革热病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）抑制剂的发现和优化。基于X射线的诺华碎片收集片段筛选结果鉴定出联苯乙酸片段3，该片段结合在RdRp的棕榈亚结构域中。依靠基于结构的设计，随后对片段命中3的优化使体外效能提高了> 1000倍，并在基于细胞的测定中获得了对所有四种低微摩尔EC 50血清型的抗登革热活性。主要候选物27与RdRp的棕榈亚结构域中的新的结合口袋相互作用，并针对所有临床相关的登革热血清型发挥有希望的活性。