(S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate
• 英文别名: (S)-Di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate；tert-butyl N-[(2S)-6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-1-oxo-1-[3-[2-(2,3,5,6-tetrafluoropyridin-4-yl)ethynyl]anilino]hexan-2-yl]carbamate
• 化学式: C₂₉H₃₄F₄N₄O₅
• 分子量: 594.606
• InChiKey: ZDNXIWWAFKXHEV-FQEVSTJZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate 在 盐酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 10.0h， 以86%的产率得到(S)-2,6-diamino-N-{3-[(perfluoropyridin-4-yl)ethynyl]phenyl}hexanamide dihydrochloride
  参考文献：
  名称：

  Fine-tuning alkyne cycloadditions: Insights into photochemistry responsible for the double-strand DNA cleavage via structural perturbations in diaryl alkyne conjugates

  摘要：

  将光活化芳基乙炔和双阳离子赖氨酸基团结合的混合分子，致使目前已知对小分子而言最高效的双链DNA切割。为了测试烷化能力与这些化合物的DNA损伤特性之间的关联，我们研究了三种异构芳基-四氟吡啶基(TFP)炔烃的酰胺取代物在不同位置(o-、m-和p-)对模型π-系统的光反应性。使用1,4-环己二烯(1,4-CHD)反应来探测这三种异构体的三重激发态的烷化性质，而Stern-Volmer猝灭实验则用于研究光诱导电子转移(PET)的动力学。三种类似的异构赖氨酸共轭物以不同效率切割DNA(分别为p-、m-和o-取代的赖氨酸共轭物，ds DNA切割效率分别为34%、15%和0%)，与相应乙酰胺的烷化能力一致。羟自由基和单线态氧清除剂对DNA切割的显著保护作用仅在m-赖氨酸共轭物中显示。所有三种异构赖氨酸共轭物在光活化下抑制人黑色素瘤细胞生长：其中p-共轭物的CC₅₀ (50%细胞毒性)值最低，为1.49 × 10⁻⁷ M。

  DOI：

  10.3762/bjoc.7.93
• 作为产物：
  描述：

  1-碘-3-硝基苯 在 吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 、 cesium fluoride 、 tin(ll) chloride 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.25h， 生成 (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate
  参考文献：
  名称：

  Fine-tuning alkyne cycloadditions: Insights into photochemistry responsible for the double-strand DNA cleavage via structural perturbations in diaryl alkyne conjugates

  摘要：

  将光活化芳基乙炔和双阳离子赖氨酸基团结合的混合分子，致使目前已知对小分子而言最高效的双链DNA切割。为了测试烷化能力与这些化合物的DNA损伤特性之间的关联，我们研究了三种异构芳基-四氟吡啶基(TFP)炔烃的酰胺取代物在不同位置(o-、m-和p-)对模型π-系统的光反应性。使用1,4-环己二烯(1,4-CHD)反应来探测这三种异构体的三重激发态的烷化性质，而Stern-Volmer猝灭实验则用于研究光诱导电子转移(PET)的动力学。三种类似的异构赖氨酸共轭物以不同效率切割DNA(分别为p-、m-和o-取代的赖氨酸共轭物，ds DNA切割效率分别为34%、15%和0%)，与相应乙酰胺的烷化能力一致。羟自由基和单线态氧清除剂对DNA切割的显著保护作用仅在m-赖氨酸共轭物中显示。所有三种异构赖氨酸共轭物在光活化下抑制人黑色素瘤细胞生长：其中p-共轭物的CC₅₀ (50%细胞毒性)值最低，为1.49 × 10⁻⁷ M。

  DOI：

  10.3762/bjoc.7.93

文献信息

• DIPEPTIDE ACETYLENE CONJUGATES AND A METHOD FOR PHOTOCLEAVAGE OF DOUBLE STRAND DNA BY DIPEPTIDE ACETYLENE CONJUGATES
  申请人：Alabugin Igor

  公开号：US20120288940A1

  公开（公告）日：2012-11-15

  Photoreactive DNA cleaving conjugate compounds are provided comprising a DNA cleaving moiety which comprises an aryl alkyne group and a polyfunctional pH-regulated DNA-binding moiety which comprises at least one or two amino groups.

  提供了光反应性DNA切割共轭化合物，其中包含一个含有芳基炔基团的DNA切割部分和一个含有至少一个或两个氨基团的多功能pH调节DNA结合部分。
• Dipeptide acetylene conjugates and a method for photocleavage of double strand DNA by dipeptide acetylene conjugates
  申请人：Alabugin Igor

  公开号：US08927728B2

  公开（公告）日：2015-01-06

  Photoreactive DNA cleaving conjugate compounds are provided comprising a DNA cleaving moiety which comprises an aryl alkyne group and a polyfunctional pH-regulated DNA-binding moiety which comprises at least one or two amino groups.

  提供了光敏DNA切割结合物化合物，包括一个DNA切割基团，其中包括一个芳基炔基团和一个多功能pH调节的DNA结合基团，其中至少包括一个或两个氨基团。
• Fine-tuning alkyne cycloadditions: Insights into photochemistry responsible for the double-strand DNA cleavage via structural perturbations in diaryl alkyne conjugates
  作者：Wang-Yong Yang、Samantha A Marrone、Nalisha Minors、Diego A R Zorio、Igor V Alabugin

  DOI：10.3762/bjoc.7.93

  日期：——

  Hybrid molecules combining photoactivated aryl acetylenes and a dicationic lysine moiety cause the most efficient double-strand (ds) DNA cleavage known to date for a small molecule. In order to test the connection between the alkylating ability and the DNA-damaging properties of these compounds, we investigated the photoreactivity of three isomeric aryl–tetrafluoropyridinyl (TFP) alkynes with amide substituents in different positions (o-, m-, and p-) toward a model π-system. Reactions with 1,4-cyclohexadiene (1,4-CHD) were used to probe the alkylating properties of the triplet excited states in these three isomers whilst Stern–Volmer quenching experiments were used to investigate the kinetics of photoinduced electron transfer (PET). The three analogous isomeric lysine conjugates cleaved DNA with different efficiencies (34, 15, and 0% of ds DNA cleavage for p-, m-, and o-substituted lysine conjugates, respectively) consistent with the alkylating ability of the respective acetamides. The significant protecting effect of the hydroxyl radical and singlet oxygen scavengers to DNA cleavage was shown only with m-lysine conjugate. All three isomeric lysine conjugates inhibited human melanoma cell growth under photoactivation: The p-conjugate had the lowest CC₅₀ (50% cell cytotoxicity) value of 1.49 × 10⁻⁷ M.

  将光活化芳基乙炔和双阳离子赖氨酸基团结合的混合分子，致使目前已知对小分子而言最高效的双链DNA切割。为了测试烷化能力与这些化合物的DNA损伤特性之间的关联，我们研究了三种异构芳基-四氟吡啶基(TFP)炔烃的酰胺取代物在不同位置(o-、m-和p-)对模型π-系统的光反应性。使用1,4-环己二烯(1,4-CHD)反应来探测这三种异构体的三重激发态的烷化性质，而Stern-Volmer猝灭实验则用于研究光诱导电子转移(PET)的动力学。三种类似的异构赖氨酸共轭物以不同效率切割DNA(分别为p-、m-和o-取代的赖氨酸共轭物，ds DNA切割效率分别为34%、15%和0%)，与相应乙酰胺的烷化能力一致。羟自由基和单线态氧清除剂对DNA切割的显著保护作用仅在m-赖氨酸共轭物中显示。所有三种异构赖氨酸共轭物在光活化下抑制人黑色素瘤细胞生长：其中p-共轭物的CC₅₀ (50%细胞毒性)值最低，为1.49 × 10⁻⁷ M。