(S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate
• 英文别名: (S)-Di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate；tert-butyl N-[(2S)-6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-1-oxo-1-[3-[2-(2,3,5,6-tetrafluoropyridin-4-yl)ethynyl]anilino]hexan-2-yl]carbamate
• 化学式: C₂₉H₃₄F₄N₄O₅
• 分子量: 594.606
• InChiKey: ZDNXIWWAFKXHEV-FQEVSTJZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate 在 盐酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 10.0h， 以86%的产率得到(S)-2,6-diamino-N-{3-[(perfluoropyridin-4-yl)ethynyl]phenyl}hexanamide dihydrochloride
  参考文献：
  名称：

  Fine-tuning alkyne cycloadditions: Insights into photochemistry responsible for the double-strand DNA cleavage via structural perturbations in diaryl alkyne conjugates

  摘要：

  将光活化芳基乙炔和双阳离子赖氨酸基团结合的混合分子，致使目前已知对小分子而言最高效的双链DNA切割。为了测试烷化能力与这些化合物的DNA损伤特性之间的关联，我们研究了三种异构芳基-四氟吡啶基(TFP)炔烃的酰胺取代物在不同位置(o-、m-和p-)对模型π-系统的光反应性。使用1,4-环己二烯(1,4-CHD)反应来探测这三种异构体的三重激发态的烷化性质，而Stern-Volmer猝灭实验则用于研究光诱导电子转移(PET)的动力学。三种类似的异构赖氨酸共轭物以不同效率切割DNA(分别为p-、m-和o-取代的赖氨酸共轭物，ds DNA切割效率分别为34%、15%和0%)，与相应乙酰胺的烷化能力一致。羟自由基和单线态氧清除剂对DNA切割的显著保护作用仅在m-赖氨酸共轭物中显示。所有三种异构赖氨酸共轭物在光活化下抑制人黑色素瘤细胞生长：其中p-共轭物的CC₅₀ (50%细胞毒性)值最低，为1.49 × 10⁻⁷ M。

  DOI：

  10.3762/bjoc.7.93
• 作为产物：
  描述：

  1-碘-3-硝基苯 在 吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 、 cesium fluoride 、 tin(ll) chloride 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.25h， 生成 (S)-di-tert-butyl (6-oxo-6-((3-((perfluoropyridin-4-yl)ethynyl)phenyl)amino)hexane-1,5-diyl)dicarbamate
  参考文献：
  名称：

  Fine-tuning alkyne cycloadditions: Insights into photochemistry responsible for the double-strand DNA cleavage via structural perturbations in diaryl alkyne conjugates

  摘要：

  将光活化芳基乙炔和双阳离子赖氨酸基团结合的混合分子，致使目前已知对小分子而言最高效的双链DNA切割。为了测试烷化能力与这些化合物的DNA损伤特性之间的关联，我们研究了三种异构芳基-四氟吡啶基(TFP)炔烃的酰胺取代物在不同位置(o-、m-和p-)对模型π-系统的光反应性。使用1,4-环己二烯(1,4-CHD)反应来探测这三种异构体的三重激发态的烷化性质，而Stern-Volmer猝灭实验则用于研究光诱导电子转移(PET)的动力学。三种类似的异构赖氨酸共轭物以不同效率切割DNA(分别为p-、m-和o-取代的赖氨酸共轭物，ds DNA切割效率分别为34%、15%和0%)，与相应乙酰胺的烷化能力一致。羟自由基和单线态氧清除剂对DNA切割的显著保护作用仅在m-赖氨酸共轭物中显示。所有三种异构赖氨酸共轭物在光活化下抑制人黑色素瘤细胞生长：其中p-共轭物的CC₅₀ (50%细胞毒性)值最低，为1.49 × 10⁻⁷ M。

  DOI：

  10.3762/bjoc.7.93

文献信息

• DIPEPTIDE ACETYLENE CONJUGATES AND A METHOD FOR PHOTOCLEAVAGE OF DOUBLE STRAND DNA BY DIPEPTIDE ACETYLENE CONJUGATES
  申请人：Alabugin Igor

  公开号：US20120288940A1

  公开（公告）日：2012-11-15

  Photoreactive DNA cleaving conjugate compounds are provided comprising a DNA cleaving moiety which comprises an aryl alkyne group and a polyfunctional pH-regulated DNA-binding moiety which comprises at least one or two amino groups.

  提供了光反应性DNA切割共轭化合物，其中包含一个含有芳基炔基团的DNA切割部分和一个含有至少一个或两个氨基团的多功能pH调节DNA结合部分。
• Dipeptide acetylene conjugates and a method for photocleavage of double strand DNA by dipeptide acetylene conjugates
  申请人：Alabugin Igor

  公开号：US08927728B2

  公开（公告）日：2015-01-06

  Photoreactive DNA cleaving conjugate compounds are provided comprising a DNA cleaving moiety which comprises an aryl alkyne group and a polyfunctional pH-regulated DNA-binding moiety which comprises at least one or two amino groups.

  提供了光敏DNA切割结合物化合物，包括一个DNA切割基团，其中包括一个芳基炔基团和一个多功能pH调节的DNA结合基团，其中至少包括一个或两个氨基团。