1-desthiobiotinylpyrene

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芘
• 英文名称: 1-desthiobiotinylpyrene
• 英文别名: 1-Desthiobiotinylpyrene；(4S,5R)-4-methyl-5-(6-oxo-6-pyren-1-ylhexyl)imidazolidin-2-one
• 化学式: C₂₆H₂₆N₂O₂
• 分子量: 398.505
• InChiKey: GEJQOLRONNVYHQ-KSFYIVLOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  58.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  芘 、 D-脱硫生物素 在 三氟乙酸酐 、 三氟甲磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.02h， 以41%的产率得到1-desthiobiotinylpyrene
  参考文献：
  名称：

  抗生物素蛋白与荧光P偶联物相互作用的结构表征：1-生物素基py和1-去硫基生物素基py。

  摘要：

  抗生物素蛋白是一种四聚体蛋白，属于花萼素超家族。人们对其进行了研究，主要是因为它对生物素具有非凡的亲和力，从而导致了基于抗生物素蛋白-生物素系统的广泛应用。在本研究中，我们报告了抗生物素蛋白在与两种新型荧光pyr衍生物（1-生物素基re（B9P）和1-去硫基生物素基py（D9P））形成的复合物中的第一个晶体结构。通过使用亲和素分子的坐标作为起始模型通过分子置换来解析晶体结构，并且将亲和素/ B9P和亲和素/ D9P的最终模型分别精制至2.0Å和2.1Å的分辨率。我们的数据揭示了在结合这些荧光探针后，抗生物素蛋白的环构象以及整体折叠和四级排列的变化。此外，晶体结构可以分析蛋白质与the衍生物之间相互作用的细节。复合物的结构描述将有助于缀合物的设计，以扩大抗生物素蛋白-生物素技术的能力。

  DOI：

  10.3390/molecules21101270

文献信息

• Structural Characterization of the Avidin Interactions with Fluorescent Pyrene-Conjugates: 1-Biotinylpyrene and 1-Desthiobiotinylpyrene
  作者：Paweł Strzelczyk、Damian Plażuk、Janusz Zakrzewski、Grzegorz Bujacz

  DOI：10.3390/molecules21101270

  日期：——

  we report the first crystal structures of avidin in a complex with two novel fluorescent pyrene derivatives: 1-biotinylpyrene (B9P) and 1-desthiobiotinylpyrene (D9P). The crystal structures were solved by molecular replacement using the coordinates of avidin molecule as a starting model and the final models of avidin/B9P and avidin/D9P were refined to resolutions of 2.0 Å and 2.1 Å, respectively. Our

  抗生物素蛋白是一种四聚体蛋白，属于花萼素超家族。人们对其进行了研究，主要是因为它对生物素具有非凡的亲和力，从而导致了基于抗生物素蛋白-生物素系统的广泛应用。在本研究中，我们报告了抗生物素蛋白在与两种新型荧光pyr衍生物（1-生物素基re（B9P）和1-去硫基生物素基py（D9P））形成的复合物中的第一个晶体结构。通过使用亲和素分子的坐标作为起始模型通过分子置换来解析晶体结构，并且将亲和素/ B9P和亲和素/ D9P的最终模型分别精制至2.0Å和2.1Å的分辨率。我们的数据揭示了在结合这些荧光探针后，抗生物素蛋白的环构象以及整体折叠和四级排列的变化。此外，晶体结构可以分析蛋白质与the衍生物之间相互作用的细节。复合物的结构描述将有助于缀合物的设计，以扩大抗生物素蛋白-生物素技术的能力。