MDA-MB-231 三阴性乳腺癌细胞中的细胞 RNA 与一组附加有二嗪交联部分和炔标签的小分子之间的相互作用在活细胞的转录组范围内进行了探测。炔标签可以轻松下拉每个小分子结合的细胞 RNA,并且每个 RNA 靶标的富集定义了化合物的分子足迹。在研究的 34 种
化学上不同的小分子中,有 6 种结合并富集了细胞 RNA。最高度富集的相互作用发生在新型 RNA 结合化合物 F1 和静默素
硫氢基氧化酶 1 亚型 a ( QSOX1-a) 5' 非翻译区的结构区域之间。),不存在于同种型 b 中。其他研究表明,F1 特异性结合 RNA 而不是 DNA 和蛋白质;也就是说,我们研究了整个 DNA、RNA 和蛋白质相互作用组。这种相互作用被用来设计一种
核糖核酸酶靶向嵌合体 (RIBOTAC),以局部招募
核糖核酸酶 L ,以异构体特异性方式降解QSOX1 mRNA,因为QSOX1-a而非QSOX1-b mRNA